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內(nèi)源性代謝物檢測(cè)方法及應(yīng)用

瀏覽次數(shù):712 發(fā)布日期:2023-1-6  來(lái)源:MedChemExpress

代謝物 (Metabolites) 指的是在整個(gè)細(xì)胞活動(dòng)中作為前體、中間體和最終產(chǎn)物存在的生物小分子[1]。它們可以啟動(dòng)細(xì)胞信號(hào)級(jí)聯(lián),調(diào)節(jié)各種生物過(guò)程,并提供細(xì)胞狀態(tài)的直接信息。人體中的代謝物包括內(nèi)源性代謝物 (由人體中的生命活動(dòng)產(chǎn)生的生物小分子) 和外源性代謝物 (指的是來(lái)源于飲食等由外來(lái)途徑攝入人體的)。人體內(nèi)源性代謝物一般包括來(lái)源于細(xì)胞、組織和體液中的小分子代謝物 (圖 1),對(duì)人體內(nèi)源性代謝物的研究一直被用于健康評(píng)估和疾病診斷[2]。由此衍生出代謝組學(xué)。


圖 1. 來(lái)源于體液和細(xì)胞的代謝物[2]

內(nèi)源性代謝物的檢測(cè)方法
一般來(lái)說(shuō),代謝組學(xué)是對(duì)體液、細(xì)胞和組織中的代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,通常被用作生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的工具[3]。近些年來(lái),代謝組學(xué)的技術(shù)在不斷進(jìn)步,質(zhì)譜 (MS)、核磁共振 (NMR) 以及它們與色譜的結(jié)合已廣泛應(yīng)用于代謝物的分離和檢測(cè)。

表面增強(qiáng)拉曼光譜 (SERS) 是一種超靈敏和高度特異的光學(xué)檢測(cè)技術(shù),得益于拉曼光譜的分子“指紋”和等離子體納米材料的巨大信號(hào)增強(qiáng) (低至單分子水平) 。拉曼光譜作為光與樣品相互作用時(shí)發(fā)射的非彈性部分,顯示出指紋特征和窄帶寬的高度特異性。它可以揭示分子振動(dòng)、旋轉(zhuǎn)和過(guò)渡信息,換言之,可以反應(yīng)分子的結(jié)構(gòu)信息。在一些特殊的材料表面,分子的拉曼散射光譜強(qiáng)度能得到非常顯著的增強(qiáng)。這種散射光譜的增強(qiáng)使人們可以更加容易的利用拉曼光譜進(jìn)行樣品的分析。作為一種新興的代謝產(chǎn)物檢測(cè)方法,SERS 已通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化的底物制備和檢測(cè)程序開(kāi)發(fā) (圖 2)[2]。

圖 2. 表面增強(qiáng)拉曼光譜 (SERS) 對(duì)代謝物的檢測(cè)流程[2]

 

質(zhì)譜 (MS) 是一種測(cè)量離子質(zhì)荷比的分析方法質(zhì)譜的基本原理是電離樣品中的每一種成分,以產(chǎn)生具有不同電荷質(zhì)量比的帶電離子,然后離子束進(jìn)入質(zhì)量分析儀進(jìn)行質(zhì)量測(cè)定。MS 被廣泛應(yīng)用于通過(guò)直接注射或色譜分離來(lái)分析生物樣品。質(zhì)量準(zhǔn)確度的最新改進(jìn)極大地拓寬了 MS 能夠以更高精度分析的代謝物范圍。通過(guò)具有高靈敏度和高分辨率的 MS 可以實(shí)現(xiàn)各種代謝產(chǎn)物的定量,以獲得代謝信息[2]。例如,通過(guò)基質(zhì)輔助激光解吸/電離質(zhì)譜 (LDIMS) 檢測(cè)尿液中的代謝物,以確定腎臟疾病亞型特征[4]。同樣,在 LDIMS 的幫助下,通過(guò)血清代謝物檢測(cè)實(shí)現(xiàn)了早期肺腺癌的診斷[5]
核磁共振 (NMR) 檢測(cè)代謝產(chǎn)物是基于不同核自旋運(yùn)動(dòng)的差異。在強(qiáng)磁場(chǎng)中,某些元素的原子核和電子能量本身所具有的磁性,被分裂成兩個(gè)或兩個(gè)以上量子化的能級(jí)。吸收適當(dāng)頻率的電磁輻射,可在所產(chǎn)生的磁誘導(dǎo)能級(jí)之間發(fā)生躍遷,同時(shí)會(huì)產(chǎn)生共振譜,可用于測(cè)定分子中某些原子的數(shù)目、類(lèi)型和相對(duì)位置,從而能夠分析代謝物的結(jié)構(gòu)。核磁共振能夠獲得整個(gè)代謝的信息,被認(rèn)為是體液分析中最成功的分析技術(shù)之一。然而,受限于相對(duì)較低的靈敏度,NMR 僅適用于足夠濃度的代謝物[2]。
3 種檢測(cè)方法的比較如下:

表 1. MS, NMR 和 SERS 對(duì)代謝物檢測(cè)的比較[6]

內(nèi)源性代謝物用于疾病診斷

疾病會(huì)使體內(nèi)的生理過(guò)程發(fā)生變化,進(jìn)而引起體內(nèi)代謝物的改變。對(duì)機(jī)體的代謝物進(jìn)行定性和定量分析,可以找到疾病的標(biāo)記物,進(jìn)而可能用于疾病的診斷,對(duì)于早期診斷疾病具有重要意義。

早期癌癥檢測(cè)大大增加了成功治療的機(jī)會(huì),但對(duì)包括肺腺癌 (LA) 在內(nèi)的一些腫瘤的可用診斷方法有限。對(duì)于大規(guī)模臨床應(yīng)用而言,理想的 LA 早期診斷必須解決快速檢測(cè)、低侵襲性和高度的可操作性。有研究者通過(guò)優(yōu)化的鐵粒子輔助激光解吸/電離質(zhì)譜 (LDI-MS) 法對(duì)早期肺癌患者 (n=200)、健康對(duì)照 (n=200)、其它肺癌 (n=36) 以及肺良性疾病 (n=45) 的 481 份人血清樣本進(jìn)行代謝組學(xué)分析,然后通過(guò)儀器模擬算法,確定了一個(gè)由七種代謝產(chǎn)物和相關(guān)途徑組成的生物標(biāo)志物組,以區(qū)分早期 LA 和對(duì)照組 (p<0.05),對(duì)于早期診斷 LA 有重要意義[5]

圖 3. 對(duì)血液的代謝組學(xué)分析[5]

此外還有,美國(guó)康奈爾大學(xué)營(yíng)養(yǎng)科學(xué)部 Patrick J. Stover 教授設(shè)計(jì)了一項(xiàng)針對(duì)大學(xué)新生的為期 9 個(gè)月的前瞻性研究 (n=264) 來(lái)探索年輕人代謝組與突發(fā)性肥胖增加的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)戊糖磷酸途謝產(chǎn)物赤蘚糖醇,可能是當(dāng)代大學(xué)生腹型肥胖的潛在生物標(biāo)記物[7]。

內(nèi)源性代謝物用于疾病治療

除了應(yīng)用于疾病診斷,內(nèi)源性代謝物本身在體內(nèi)還發(fā)揮著重要作用。許多疾病與內(nèi)源性代謝物的改變有關(guān),可以從內(nèi)源性代謝物著手研究尋找治療疾病的藥物,為新藥研究提供新的方法。

在癌癥治療方面,內(nèi)源性代謝物也可提供新的思路。有研究表明,細(xì)胞中正常產(chǎn)生的許多代謝產(chǎn)物可能具有高度毒性,如含有反應(yīng)性基團(tuán)的代謝產(chǎn)物 (如 methylglyoxal, 4-hydroxynonenal, and glutaconyl-CoA) 或充當(dāng)與其他代謝產(chǎn)物競(jìng)爭(zhēng)類(lèi)似物的代謝產(chǎn)物 (如deoxyuridine triphosphate and l-2-hydroxyglutarate)。如果代謝途徑含有有毒的中間體,那么我們可以通過(guò)靶向下游酶來(lái)誘導(dǎo)有毒中間體的積聚并毒害癌細(xì)胞[8]。

 

圖 4. 根據(jù)作用機(jī)制的不同的毒性代謝物分類(lèi) (a. 反應(yīng)集團(tuán);b. 毒性類(lèi)似物;c. 興奮毒性)[8]

 

總結(jié)

綜上所述,內(nèi)源性代謝物除了在體內(nèi)作為功能小分子存在外,還在疾病診斷和疾病治療方面發(fā)揮著越來(lái)越多的作用,相信內(nèi)源性代謝物在不久的將來(lái)還可應(yīng)用于更多的領(lǐng)域 (比如中醫(yī)藥現(xiàn)代化領(lǐng)域等),將發(fā)揮更多更廣的作用。

 

相關(guān)產(chǎn)品

2-Deoxy-D-glucose
葡萄糖類(lèi)似物,為葡萄糖代謝抑制劑,通過(guò)作用于己糖激酶來(lái)抑制糖酵解。

ATP

體內(nèi)能量?jī)?chǔ)存和代謝的重要物質(zhì),為代謝提供能量,同時(shí)在細(xì)胞中作為輔酶發(fā)揮作用,是免疫和炎癥中重要的內(nèi)源性信號(hào)分子。

Retinoic acid
維生素 A 的代謝產(chǎn)物,在細(xì)胞生長(zhǎng),分化和器官發(fā)生中起重要作用。

Nicotina‍mide

是維生素 B3 或煙酸的一種形式,可抑制 SIRT2 的體外活性。

MCE 的所有產(chǎn)品僅用作科學(xué)研究或藥證申報(bào),我們不為任何個(gè)人用途提供產(chǎn)品和服務(wù)


參考文獻(xiàn)

[1] Damiani C, et al. Systems metabolomics: from metabolomic snapshots to design principles. Curr Opin Biotechnol. 2020;63:190-199.
[2] Lu Y, Lin L, Ye J. Human metabolite detection by surface-enhanced Raman spectroscopy. Mater Today Bio. 2022;13:100205.
[3] Johnson CH, Ivanisevic J, Siuzdak G. Metabolomics: beyond biomarkers and towards mechanisms. Nat Rev Mol Cell Biol. 2016;17(7):451-459.
[4] Yang J, Wang R, Huang L, et al. Urine Metabolic Fingerprints Encode Subtypes of Kidney Diseases. Angew Chem Int Ed Engl. 2020;59(4):1703-1710.
[5] Huang L, Wang L, Hu X, et al. Machine learning of serum metabolic patterns encodes early-stage lung adenocarcinoma. Nat Commun. 2020;11(1):3556.
[6] Emwas AH. The strengths and weaknesses of NMR spectroscopy and mass spectrometry with particular focus on metabolomics research. Methods Mol Biol. 2015;1277:161-193.
[7] Hootman KC, Trezzi JP, Kraemer L, et al. Erythritol is a pentose-phosphate pathway metabolite and associated with adiposity gain in young adults. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017;114(21):E4233-E4240.
[8] Lee N, Spears ME, Carlisle AE, Kim D. Endogenous toxic metabolites and implications in cancer therapy. Oncogene. 2020;39(35):5709-5720.

 

 

來(lái)源:上海皓元生物醫(yī)藥科技有限公司
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