細(xì)胞STR鑒定相關(guān)介紹

  據(jù)統(tǒng)計(jì)約30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)，只因使用了交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)的細(xì)胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果……，這將浪費(fèi)大量時(shí)間、精力和金錢。

世人皆知，細(xì)胞身嬌體貴難養(yǎng)活，養(yǎng)好細(xì)胞實(shí)屬不易。而這其中最煩的是污染、最怕的是掉包。因?yàn)楸M管研究僧們有方法把一切污染的源頭扼殺在搖籃之內(nèi)，卻沒有火眼金睛辨別已經(jīng)換了馬甲的錯(cuò)誤細(xì)胞。因而細(xì)胞一旦被李代桃僵，再資深的科研者都會(huì)陰溝里翻船，所以細(xì)胞鑒定顯得尤為重要。

為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定？

進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定是很重要的。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細(xì)胞來進(jìn)行，這些細(xì)胞可能是受贈(zèng)于其它研究人員,也可能是從細(xì)胞庫(如美國 ATCC,American Type Culture Collection)得來。據(jù)估計(jì)，15-20%的實(shí)驗(yàn)室，實(shí)驗(yàn)中所使用的細(xì)胞已經(jīng)不是原來的細(xì)胞系，或者與其它細(xì)胞系發(fā)生了交叉污染。顯然，細(xì)胞系遭到污染、特征鑒別錯(cuò)誤，將會(huì)極大的威脅著基于這些細(xì)胞而發(fā)表的論文質(zhì)量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。

什么情況下需要細(xì)胞系鑒定?

1. 當(dāng)建立或獲得一個(gè)新的細(xì)胞系時(shí)；
2. 一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開始/結(jié)束時(shí)；
3. 在細(xì)胞凍存之前，或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng) 2～3 個(gè)月時(shí)；
4. 發(fā)表文章或申請(qǐng)課題經(jīng)費(fèi)前；
5. 細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時(shí)；
6. 當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用超過一種細(xì)胞系時(shí)，所有細(xì)胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能。

如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系身份?

收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及 STR 信息，可以與參考數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)。如果細(xì)胞樣本的每個(gè) STR 位點(diǎn)和參考細(xì)胞 STR 位點(diǎn)都能重合匹配，即說明該細(xì)胞系正確，反之則說明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記，交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來，匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確，匹配度＜80%則說明該細(xì)胞系的來源需要被懷疑。

如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記，則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定，從而找到問題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購買一株新的細(xì)胞系。

生物細(xì)胞STR鑒定服務(wù)

STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）基因分型已被ICLAC、ATCC等權(quán)威機(jī)構(gòu)作為鑒別細(xì)胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。海星生物對(duì)人源細(xì)胞21個(gè)STR位點(diǎn)進(jìn)行檢測，可方便與權(quán)威數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)，具有較高的準(zhǔn)確性。

 STR基因位點(diǎn)由長度為3～7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成， 這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中，可作為高度多態(tài)性標(biāo)記，被稱為細(xì)胞的DNA指紋。STR 基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分，在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識(shí)別。隨后通過一定的計(jì)算方法，即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。