使用Metaboanalyst5.0-Statistical Analysis進(jìn)行基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析的流程

小趣在前面的推文中給大家介紹過VIP scores圖通過Metaboanalyst(MA)網(wǎng)站來實(shí)現(xiàn)的方法，那MA網(wǎng)站是一個什么樣的網(wǎng)站呢？今天小趣就來為您介紹~

Metaboanalyst是一個基于網(wǎng)絡(luò)、功能全面的工具，用于處理、分析和解釋代謝組學(xué)數(shù)據(jù)。它不僅可以做統(tǒng)計(jì)分析，還能進(jìn)行功能注釋分析，比如Enrichment Analysis、Pathway Analysis。小趣今天主要帶大家來學(xué)習(xí)一下用Metaboanalyst網(wǎng)站實(shí)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)分析，下面一起來看看吧~

第一列sample為樣本名，第二列classid為樣本分組，從第3列開始為每一個代謝物在單個樣本上的含量。

1.首先在瀏覽器中輸入網(wǎng)址https://www.metaboanalyst.ca/，點(diǎn)擊首頁Statistical Analysis[one factor]，進(jìn)入下一頁面，會有很多數(shù)據(jù)輸入格式選擇，這里我們選擇的輸入格式為.csv，點(diǎn)擊Choose選擇輸入的文件，然后點(diǎn)擊Submit進(jìn)入下一個頁面。

2. Edit Groups是修改分組，這里我們不需要修改，直接點(diǎn)擊Proceed進(jìn)入下一個頁面。

3. 這個頁面是對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，Sample normalization是否對數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化處理；Data transformation 是否對數(shù)據(jù)進(jìn)行某種轉(zhuǎn)換；Data scaling 是否對數(shù)據(jù)進(jìn)行某種scaling方式處理。選擇完成后點(diǎn)擊normalize，然后點(diǎn)擊Proceed進(jìn)入下一個頁面。

4. 這個頁面有很多分析可以進(jìn)行選擇，可根據(jù)自己的需求點(diǎn)擊，比如我們現(xiàn)在需要做一個PCA，則可以點(diǎn)擊Principal Component Analysis (PCA)，進(jìn)入下一個頁面。

5. 在該頁面可以根據(jù)圖形頁面的小畫筆對圖形進(jìn)行修改。這樣我們一張PCA圖就做好啦。最后所有做過的分析都可以直接通過左下角的Download直接打包下載。

最后在這里展示幾張通過該網(wǎng)站做出來的幾個分析圖吧。