DAP-seq技術(shù)并結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)推導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)

2023年6月4日，青島農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院宋輝教授課題組的研究成果，發(fā)表在Oil Crop Science期刊上，文章題目為Identification of the target genes of AhTWRKY24 and AhTWRKY106 transcription factors reveals their regulatory network in Arachis hypogaea cv. Tifrunner using DAP-seq。該研究使用DNA親和純化測(cè)序（DAP-seq）技術(shù)鑒定了AhTWRKY24和AhTWRKY106的結(jié)合基序以及下游基因。并結(jié)合RNA-seq數(shù)據(jù)揭示了AhTWRKY24和AhTWRKY106轉(zhuǎn)錄因子可以調(diào)控參與干旱脅迫響應(yīng)的下游基因。

WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物對(duì)生物和非生物脅迫反應(yīng)的重要核心調(diào)控因子�；ㄉ�是一種重要的油料和蛋白質(zhì)作物�；ㄉ�具有數(shù)百個(gè)WRKY轉(zhuǎn)錄因子成員，但是對(duì)于它們的功能和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)仍不清楚。本研究前期鑒定了花生中具有耐旱功能的部分同源的AhTWRKY24和AhTWRKY106轉(zhuǎn)錄因子。以此為基礎(chǔ)，本研究利用DAP-seq技術(shù)并結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)推導(dǎo)了AhTWRKY24和AhTWRKY106轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。