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SPT Labtech與Thermo Fisher合作推出NGS建庫方案

瀏覽次數(shù):6212 發(fā)布日期:2021-5-18  來源:騰泉
文庫制備成本在如今大規(guī)模的NGS研究費(fèi)用中所占的比重越來越重,經(jīng)費(fèi)和成本的限制阻礙了科學(xué)家對傳染病監(jiān)測、癌癥研究等領(lǐng)域更深入探索的步伐。SPT Labtech宣布與Thermo Fisher Scientific進(jìn)行市場合作,旨在構(gòu)建自動化的文庫制備方案,以期提高建庫成功率,并降低variant檢測的費(fèi)用。
 

 

高靈敏度的variant檢測現(xiàn)在可以通過使用SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統(tǒng)進(jìn)行自動化建庫,將反應(yīng)體系微縮化,減少試劑使用量,降低1/10的成本,從而能夠在一組樣本中添加更多的replicates,提高建庫成功率和測序數(shù)據(jù)質(zhì)量。 


此項方案將首先支持用于Illumina系統(tǒng)的Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒,以及Collibri文庫定量試劑盒,包括SARS-CoV-2研究、癌癥研究中拷貝數(shù)變異以及其他突變檢測的應(yīng)用。
 
一、更高的效率


SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統(tǒng)可以快速編程,24/7全天候進(jìn)行樣本制備工作,解放研究人員的時間。

dragonfly discovery、mosquito HV genomics及NGS實(shí)驗(yàn)set up專用軟件

 
二、更高的成功率


使用SPT Labtech設(shè)備進(jìn)行微縮化建庫,可將試劑的用量體積減少多達(dá)10倍,從而可以用不到1個樣本的成本,做5–6個replicates。樣本重復(fù)數(shù)量的增加,保障了即使某個樣品在flow cell上測序失敗,仍有其他樣品的數(shù)據(jù)可以使用,無需再重新準(zhǔn)備樣本展開測序,從而確保了實(shí)驗(yàn)一次成功。Invitrogen Collibri NGS文庫制備試劑盒中每種試劑含有一種示蹤染料,通過顏色變化可清晰觀察文庫制備過程,避免高代價的實(shí)驗(yàn)失誤。

dragonfly discovery每個通道可以獨(dú)立進(jìn)行試劑分配

 
三、更微量的樣本


SPT Labtech設(shè)備獨(dú)有的固相置換技術(shù)可以精確地處理微量液體,對0.5uL的粘稠樣本都有著極高的加樣精度。Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒可從1 ng的樣本起始量提供均勻的基因組覆蓋度。Collibri ES DNA PCR-free建庫方案經(jīng)過優(yōu)化,可將 100 ng DNA 制備成足量測序文庫,足以用于文庫定量及在 Illumina NovaSeq 系統(tǒng)上進(jìn)行兩次以上測序。PCR-free的建庫流程可在1.5小時內(nèi)完成,一天內(nèi)就可以將DNA轉(zhuǎn)化為數(shù)據(jù),從而最大限度地提高實(shí)驗(yàn)效率。

mosquito HV genomics的8/16通道進(jìn)行樣本和index轉(zhuǎn)移

 
四、加速科學(xué)發(fā)現(xiàn):提高實(shí)驗(yàn)成功率并降低研究成本


SPT Labtech的產(chǎn)品戰(zhàn)略總監(jiān)Joby Jenkins表示,在不犧牲結(jié)果質(zhì)量的前提下降低NGS建庫成本是朝著科學(xué)民主化邁出的一大步。NGS技術(shù)發(fā)展迅速,對于每個實(shí)驗(yàn)室來說,將最新的建庫方法進(jìn)行自動化的流程搭建將會非常耗時,而我們的目標(biāo)就是實(shí)現(xiàn)NGS建庫過程的自動化和微縮化,解決技術(shù)和方法上的挑戰(zhàn),這樣科學(xué)家們就可以更關(guān)注于科學(xué)問題本身,擴(kuò)大他們研究項目的范圍,最終對生命科學(xué)和人類健康產(chǎn)生更深刻的見解。



 

相關(guān)公司:SPT Labtech
聯(lián)系電話:400-151-8616
E-mail:marketing@sptlabtech.cn


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