NGS基因文庫(kù)構(gòu)建大比拼：人機(jī)大戰(zhàn)

隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，科學(xué)界也開(kāi)始越來(lái)越多地應(yīng)用測(cè)序技術(shù)來(lái)解決生物學(xué)問(wèn)題。在過(guò)去的十年里，新一代測(cè)序技術(shù)—第二代測(cè)序(NGS)迅猛發(fā)展，越來(lái)越多測(cè)序?qū)嶒?yàn)室的采用NGS技術(shù)作為測(cè)序主要手段。而且NGS高通量的特點(diǎn)，使之成為研究DNA和RNA的主要工具。

在NGS過(guò)程中，構(gòu)建基因文庫(kù)是整個(gè)測(cè)序進(jìn)程中第一個(gè)步驟，也是最為關(guān)鍵步驟，基因文庫(kù)的質(zhì)量直接影響后續(xù)的測(cè)序工作。雖然二代測(cè)序技術(shù)發(fā)展迅速，但是基因文庫(kù)的構(gòu)建仍然是一項(xiàng)十分耗費(fèi)時(shí)間以及重復(fù)性高的工作，需要熟練的科研技術(shù)人員在整個(gè)操作過(guò)程中保持需高度注意力，花費(fèi)5個(gè)小時(shí)甚至更多的時(shí)間才能完成建庫(kù)工作。

為了減輕測(cè)序工作人員負(fù)擔(dān)，解放雙手，法國(guó)羅氏診斷公司與派瑪·迪格(PrimaDiag)公司宣布合作，開(kāi)發(fā)了ACSIA NGS^LibPrep自動(dòng)化移液工作站，為羅氏提供的建庫(kù)產(chǎn)品提供自動(dòng)化解決方案，將繁瑣冗長(zhǎng)的建庫(kù)工作自動(dòng)化。

派瑪·迪格公司成立于法國(guó)，專注于科學(xué)和醫(yī)學(xué)生物領(lǐng)域，針對(duì)生物學(xué)特別是分子生物學(xué)領(lǐng)域的各種需要的自動(dòng)化操作工作，創(chuàng)新研制簡(jiǎn)單但強(qiáng)大的自動(dòng)化平臺(tái)。

ACSIA NGS^LibPrep全自動(dòng)建庫(kù)系統(tǒng)移液精準(zhǔn)，重復(fù)性高，在建庫(kù)過(guò)程中避免了任何人為誤差，從而提高文庫(kù)的質(zhì)量。羅氏診斷公司提供建庫(kù)用的KAPA建庫(kù)試劑盒在這個(gè)平臺(tái)上能實(shí)現(xiàn)完全自動(dòng)化，不需要任何人工參與。所以使用ACSIA NGS^LibPrep進(jìn)行建庫(kù)工作是一種非常經(jīng)濟(jì)合算的方法。Kapa Biosystems和羅氏NimbleGen的建庫(kù)操作步驟都在ACSIA NGS^LibPrep自動(dòng)化平臺(tái)上進(jìn)行了步驟優(yōu)化，預(yù)設(shè)了運(yùn)行程序，因此，使用ACSIA NGS^LibPrep自動(dòng)化平臺(tái)構(gòu)建基因文庫(kù)，只需要打開(kāi)預(yù)設(shè)的方法，輸入樣本數(shù)，點(diǎn)擊OK就可以了。人工完成建庫(kù)長(zhǎng)達(dá)5小時(shí)的工作，用ACSIA平臺(tái)只需要人工操作15分鐘，其他的都由ACSIA平臺(tái)代替完成。

ACSIA NGS^LibPrep平臺(tái)使用了派瑪.迪格公司的創(chuàng)新專利技術(shù)APIM(感應(yīng)磁化吸引技術(shù))，根據(jù)需求通電或斷電產(chǎn)生磁力去極化，無(wú)需轉(zhuǎn)移微孔板就可以對(duì)磁珠進(jìn)行吸引和釋放，實(shí)現(xiàn)磁珠零殘留。此外，ACSIA NGS^LibPrep全自動(dòng)建庫(kù)系統(tǒng)上可以配置市場(chǎng)上供應(yīng)的任何類型的微孔板和深孔板。所有的液體參數(shù)經(jīng)過(guò)精心優(yōu)化，系統(tǒng)設(shè)有專利的SMT智能省槍頭系統(tǒng)，可在沒(méi)有交叉污染的情況下重復(fù)使用槍頭。這使得建庫(kù)所使用的實(shí)際試劑消耗達(dá)到最小，而優(yōu)化的操作步驟也允許使用最少的槍頭數(shù)來(lái)完成整個(gè)建庫(kù)工作，大大節(jié)約試劑和耗材成本。在ACSIA NGS^LibPrep平臺(tái)上構(gòu)建48個(gè)DNA文庫(kù)僅需要3盒槍頭，而人工操作使用的槍頭數(shù)會(huì)達(dá)到14盒之多；處理每個(gè)樣品平均使用的槍頭數(shù)從人工完成所需要的28個(gè)降到了6個(gè)，大大節(jié)省了槍頭成本。比較ACSIA和人工建立的文庫(kù)質(zhì)量，使用ACSIA處理樣本，得到的樣本濃度更加均一，變異系數(shù)小。（見(jiàn)圖1）

除了羅氏和Kapa Biosystems試劑，派瑪.廸格已先后跟多個(gè)NGS試劑廠家合作，并進(jìn)行優(yōu)化，包括Illumina、NEB、安捷倫等。所以，ACSIA NGS^LibPrep全自動(dòng)建庫(kù)系統(tǒng)已內(nèi)置各試劑廠家的優(yōu)化實(shí)驗(yàn)程序，用戶只需在平臺(tái)上放好試劑，打開(kāi)相對(duì)應(yīng)的試劑程序，需入樣本數(shù)量，系統(tǒng)便會(huì)全自動(dòng)地把工作完成。真正輕松進(jìn)行NGS實(shí)驗(yàn)!!