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全自動化DNA文庫構(gòu)建技術(shù)簡介

瀏覽次數(shù):5030 發(fā)布日期:2016-8-3  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

在二代測序中,基因文庫的構(gòu)建是一項十分耗時耗力的工作,需要熟練的科研技術(shù)人員在整個操作過程中保持需高度注意力,花費大量時間和精力才能完成建庫工作。因此,大多數(shù)實驗室有將文庫構(gòu)建工作自動化的需求,以節(jié)省人力。

應文庫構(gòu)建自動化的需求,派瑪.迪格(PrimaDiag)公司研發(fā)了ACSIA NGSLibPrep自動建庫平臺,該平臺移液精準,重復性高,使用了創(chuàng)新專利技術(shù)APIM(感應磁化吸引技術(shù))處理磁珠,根據(jù)需求通電或斷電產(chǎn)生磁力和去磁化,溫度控制精準到0.1℃,震蕩速度200 - 3000 rpm范圍可調(diào)。

歸功于ACSIA平臺的靈活性,派瑪.迪格公司的科研人員將NEBNext Ultra DNA kit的文庫構(gòu)建操作步驟在ACSIA文庫構(gòu)建平臺上實現(xiàn)了全自動化。派瑪.迪格公司將提供優(yōu)化好的預設程序,中途不需要人工干預,一次實現(xiàn)96個文庫的全自動化構(gòu)建。3小時的人手建庫工作,使用自動化平臺,只需人手操作10分鐘。

經(jīng)過優(yōu)化的操作步驟允許使用最少的槍頭數(shù)來完成整個建庫工作,大大節(jié)約試劑和耗材成本。例如構(gòu)建48個DNA文庫僅需要3盒槍頭,而人工操作使用的槍頭數(shù)會達到14盒之多。

比較ACSIA全自動化和人工建立的文庫,DNA片段大小分別是338 bp 和 340 bp,結(jié)果十分相近,而使用ACSIA建庫得到文庫質(zhì)量比人工建庫高將近30%。

減少人手操作時間,極大的節(jié)省槍頭成本,文庫得率顯著增加,使得NEBNextUltra DNA kit 在ACSIA NGSLibPrep自動文庫構(gòu)建平臺上完美實現(xiàn)全自動化建庫。

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