Agripheno™高通量基因分型檢測平臺及其應用案例

>>Agripheno™高通量基因分型檢測平臺<<
Agripheno™高通量基因分型檢測平臺包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar®模塊化內(nèi)聯(lián)液體處理與分析系統(tǒng)、Soellex®高通量PCR水浴熱循環(huán)系統(tǒng)和Araya®內(nèi)聯(lián)熒光檢測系統(tǒng)。

Oktopure DNA提取儀采用磁珠的方法提取DNA，通量達到800個樣本/3小時。同時，適用于多種樣本類型的DNA提取，包括植物葉片、種子，毛發(fā)、血方卡、精液、口拭子、唾液、組織等。提取的DNA適用于多種下游應用，如基因分型、一代測序、二代測序等。

Oktopure DNA提取儀
 

Nexar高通量吸取樣品DNA和引物、mix至384孔卷帶并封膜。Soellex對封膜完成的卷帶進行PCR水浴熱循環(huán)，每次最多可達230,000個樣本。Araya對水浴完成的卷帶掃描分析，28秒掃描一張卷帶。

Nexar®模塊化內(nèi)聯(lián)液體處理與分析系統(tǒng)

Soellex®高通量PCR水浴熱循環(huán)系統(tǒng)

Araya®內(nèi)聯(lián)熒光檢測系統(tǒng)

Agripheno™基因分型采用KASP（KompetitiveAllele Specific PCR）原理，對目標SNPs和InDels進行精準的雙等位基因分型。反應體系僅1.6μl，具有高通量、低成本，準確率和檢出率接近100%的明顯優(yōu)勢。

>>服務流程<<

>>客戶需提供<<

每個位點至少10個陽性對照。 

>>服務周期<<

 引物測試完成后，每批樣品一周內(nèi)出結(jié)果。

>>服務特點<<

高通量、低成本、快速準確。

>>應用案例<<

☑ 牛毛基因分型

項目背景：牛奶里的蛋白有兩種，酪蛋白和乳清蛋白。酪蛋白中的β酪蛋白分為A1和A2型。人在消化蛋白的時候，消化酶會在A1β酪蛋白67號位置一刀切，產(chǎn)生一種7個氨基酸的肽鏈（BCM-7），而無法切A2蛋白。BCM-7會導致許多人無法吸收牛奶中的營養(yǎng)成分，通常表現(xiàn)為喝奶后出現(xiàn)不同程度的脹氣、腹痛、腹瀉等胃腸不適現(xiàn)象。而A2型牛奶更易吸收。A1, A2的區(qū)別是由奶牛的基因不同造成的，不同基因的奶牛會生產(chǎn)出含有不同蛋白質(zhì)類型的牛奶。所以，需要檢測奶牛的基因型用于奶牛育種。

項目目的：檢測不同奶牛的SNP基因型（決定牛奶A1A2類型的位點）。

實驗過程：

分型結(jié)果：

每個數(shù)據(jù)點代表一個獨立的DNA樣本的熒光信號，相同基因型的樣本會發(fā)出相似水平的熒光，因此富集在一起。