寶予德HF extract高通量組織研磨儀在樣本研磨上的應(yīng)用

早在2019年12月之前，新冠病毒可能已經(jīng)在人群“隱秘傳播”（cryptic spread）階段發(fā)生了一些關(guān)鍵突變。也就是說(shuō)，這種新型病毒在人群中出現(xiàn)的時(shí)間可能比設(shè)想的更早，甚至不一定最早出現(xiàn)在武漢。

上述推測(cè)結(jié)論來(lái)自兩位病毒學(xué)專(zhuān)家：澳大利亞悉尼大學(xué)瑪麗·巴希爾傳染病和生物安全研究所的愛(ài)德華·霍爾姆斯（Edward C. Holmes）教授，以及中國(guó)疾控中心（CDC）傳染病預(yù)防控制所研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬上海市公共衛(wèi)生臨床中心兼職教授張永振。當(dāng)?shù)貢r(shí)間3月26日，這兩位“老搭檔”聯(lián)合在頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》（CELL）上發(fā)表了一篇評(píng)論“A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2”
 

 

武漢華南海鮮市場(chǎng)的起源不確定性：幾年前探訪過(guò)市場(chǎng)

此前的觀察顯示，第一批報(bào)告的COVID-19病例和武漢的華南海鮮野生動(dòng)物市場(chǎng)有關(guān)聯(lián)。值得一提的是，張永振、霍爾姆斯等人曾在2014年親身探訪過(guò)該市場(chǎng)，霍爾姆斯提供的一張照片顯示，當(dāng)時(shí)該市場(chǎng)即出售野生動(dòng)物。

圖片來(lái)源：該照片由Edward C. Holmes提供，拍攝于2014年10月，當(dāng)時(shí)兩位作者一起參觀了市場(chǎng)。
他們?cè)谖恼轮刑岬�，在此次疫情暴發(fā)的時(shí)候那里仍然可以買(mǎi)到多種哺乳動(dòng)物。然而，由于并非所有的早期案例都與市場(chǎng)有關(guān)，新冠病毒出現(xiàn)的故事可能比最初推測(cè)的更為復(fù)雜。

中國(guó)疾控中心此前獲得了來(lái)自該市場(chǎng)“環(huán)境樣本”（比如物體表面）的基因組序列。系統(tǒng)發(fā)育分析表明，它們與從武漢最早的病人身上采集的病毒密切相關(guān)。

張永振等人表示，雖然這再次表明，華南海鮮市場(chǎng)在病毒出現(xiàn)中發(fā)揮了重要作用，但很難明確這些環(huán)境樣本中的病毒來(lái)自該市場(chǎng)的動(dòng)物還是當(dāng)時(shí)已在無(wú)意中傳播的人。“不幸的是，隨著市場(chǎng)的關(guān)閉，目前明顯缺乏直接的動(dòng)物樣本，這可能意味著很難、甚至不可能準(zhǔn)確地識(shí)別出任何動(dòng)物宿主。”

環(huán)境樣本的含有復(fù)雜的有機(jī)質(zhì)、無(wú)機(jī)鹽等雜質(zhì)，需要用研磨珠對(duì)樣本進(jìn)行處理，并且利用IRT 技術(shù)對(duì)樣本的有機(jī)物、無(wú)機(jī)鹽進(jìn)行分離，才能保證樣本的正常擴(kuò)增。

寶予德HF extract高通量組織研磨儀是針對(duì)現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用而設(shè)計(jì)生產(chǎn)的一款全面型應(yīng)用的研磨儀，它可對(duì)小量、大批次樣品，如植物、動(dòng)物組織細(xì)胞以及小量固體樣品、環(huán)境樣本進(jìn)行快速地干磨、濕磨及冷凍研磨。

環(huán)境樣本核酸提取前處理過(guò)程圖示：

經(jīng)研磨儀處理后的冠狀病毒檢測(cè)結(jié)果：

a:不經(jīng)研磨和IRT去抑制物處理擴(kuò)增結(jié)果

b:研磨儀處理，經(jīng)過(guò)IRT去抑制物進(jìn)行擴(kuò)增結(jié)果

 
由上可見(jiàn)：環(huán)境樣本需要經(jīng)過(guò)HF extract高通量研磨儀處理后，經(jīng)過(guò)IRT技術(shù)沉淀雜質(zhì)，才能真正的檢測(cè)出結(jié)果，提高陽(yáng)性率，避免漏檢。