Biomek i7全自動核酸移液工作站在在細(xì)胞株系開發(fā)數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)的應(yīng)用

細(xì)胞株開發(fā)是眾多具有重大數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)的工作流程之一。與任何篩選過程一樣，樣本通量帶來了數(shù)據(jù)量的挑戰(zhàn)。當(dāng)使用多種分析工具以不同格式生成不同類型的數(shù)據(jù)時，這就變得更加具有挑戰(zhàn)性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動數(shù)據(jù)，而且整個過程可能會延長數(shù)月。在整個過程中，必須對數(shù)據(jù)進(jìn)行追蹤，以確保進(jìn)入生產(chǎn)的任何細(xì)胞株都有必要的歷史數(shù)據(jù)（例如單克隆性的證明），并且為了報告需要，所有的數(shù)據(jù)都可以被方便地訪問。在這里，我們將描述在Biomek i7工作站（圖1）上自動化細(xì)胞株開發(fā)如何克服與此工作流程相關(guān)的許多數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)。
  作為液體轉(zhuǎn)移步驟的一部分，Biomek軟件會自動移動數(shù)據(jù)，因此數(shù)據(jù)可以隨著樣本移動而并行移動（圖4）。同時，數(shù)據(jù)也可以存儲在DART數(shù)據(jù)庫中，未來任何時候掃描孔板條碼時，相應(yīng)的數(shù)據(jù)都會被自動檢索出來。DART提供了不同時間交互的方法之間的鏈接（圖4）——在諸如細(xì)胞株開發(fā)這樣的長時間工作流程中，這是一個關(guān)鍵組件。
  除開存儲和利用數(shù)據(jù)，DART數(shù)據(jù)庫可以通過多種方便的方式訪問。為了以用戶友好的方式進(jìn)行快速可視化，可通過Chrome瀏覽器直接實時查看（圖6A），同時可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。