10x Genomics Visium FFPE空間基因表達(dá)解決方案介紹

        FFPE (Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded)指的是用福爾馬林固定、石蠟包埋樣本的方法。由于可以在常溫狀態(tài)下保存很久，F(xiàn)FPE樣本是目前醫(yī)學(xué)領(lǐng)域常見的生物材料。但FFPE樣本一般存在嚴(yán)重的RNA降解，福爾馬林的固定容易使組織中的核酸發(fā)生不同程度的降解和分子間的交聯(lián)，石蠟的高溫滲入過程又進(jìn)一步加速了核酸的降解，保存的時(shí)間及環(huán)境對(duì)樣品中核酸的完整性也有很大影響，這對(duì)于研究者們進(jìn)行科學(xué)發(fā)現(xiàn)來說無疑是很大的挑戰(zhàn)。
     
       10x Genomics的Visium空間基因表達(dá)解決方案是一種結(jié)合組織學(xué)和表達(dá)譜信息來定位和量化組織中基因表達(dá)的方法。針對(duì)FFPE樣本，采用靶向基因的探針對(duì)的RNA模板連接，對(duì)人和小鼠FFPE組織切片上的全轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行高度特異且靈敏的檢測(cè)，可在形態(tài)背景和空間組織中發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型和生物標(biāo)志物，揭示腫瘤、神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域復(fù)雜的組織異質(zhì)性。



        在準(zhǔn)備構(gòu)建文庫時(shí)，對(duì)捕獲區(qū)域的FFPE組織進(jìn)行透化處理，以釋放出連接的探針對(duì)，使其與玻片上的捕獲探針雜交，從而實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)信息的捕獲，延長(zhǎng)探針對(duì)以摻入空間條形碼，并制備測(cè)序文庫。


       
       通過10x Genomics提供的開源軟件Space Ranger來處理數(shù)據(jù)，可將空間基因表達(dá)信息與組織圖像相疊加，并通過Loupe Browser可視化軟件來實(shí)現(xiàn)交互性地探索結(jié)果，進(jìn)而分析和了解基因與蛋白表達(dá)的異質(zhì)性。

• 針對(duì)RNA降解的FFPE樣本，可同時(shí)獲取空間位置和基因表達(dá)信息；

• 無需購買10x Genomics儀器，節(jié)省費(fèi)用；

• 無需預(yù)先選擇ROI（region of interest），可對(duì)整張組織切片進(jìn)行無分析；

• 分辨率高，每個(gè)spot可涵蓋1-10個(gè)細(xì)胞

• 提供從樣本制備到數(shù)據(jù)分析的完整解決方案

       10x Genomics是一家生命科學(xué)技術(shù)公司，致力于對(duì)生物學(xué)進(jìn)行研究，理解和掌握從而促進(jìn)人類健康。該公司的綜合解決方案包括用于分析生物系統(tǒng)的儀器、試劑耗材和軟件，其所能提供的分辨率和規(guī)模與生物學(xué)的復(fù)雜性相匹配。10x Genomics的產(chǎn)品已被全球的研究人員所采用，其中包括全球100強(qiáng)研究機(jī)構(gòu)和全球20強(qiáng)制藥公司，并被2800多篇有關(guān)腫瘤、免疫學(xué)和神經(jīng)科學(xué)等發(fā)現(xiàn)的研究論文引用。公司的專利組合包括超過1100項(xiàng)已發(fā)布的專利和專利申請(qǐng)。       
       北京怡美通德科技發(fā)展有限公司是一家專業(yè)代理生物技術(shù)產(chǎn)品的分銷公司，在NGS及相關(guān)技術(shù)領(lǐng)域具有近20年為廣大科研客戶提供專業(yè)產(chǎn)品和服務(wù)的經(jīng)驗(yàn)。目前為10x Genomics北區(qū)的官方授權(quán)代理商，負(fù)責(zé)10x Genomics產(chǎn)品在相關(guān)區(qū)域內(nèi)的銷售、市場(chǎng)推廣以及售前售后技術(shù)服務(wù)等，為客戶提供10x Genomics單細(xì)胞和空間多組學(xué)測(cè)序的Demo實(shí)驗(yàn)、平臺(tái)建設(shè)、技術(shù)咨詢、試劑周轉(zhuǎn)供貨、實(shí)驗(yàn)操作和生物信息學(xué)培訓(xùn)、儀器保修和售后問題解決等專業(yè)服務(wù)。歡迎通過如下方式聯(lián)系我們，電話: 010-84409661，Email: marketing@emtd.com.cn。