生信分析：解鎖Venn圖畫法

瀏覽次數(shù)：1713　發(fā)布日期：2021-10-20　來源：本站　僅供參考，謝絕轉(zhuǎn)載，否則責任自負

Venn圖，又稱韋恩圖或文氏圖，韋恩圖用于展示在不同的事物群組(集合)之間的數(shù)學或邏輯聯(lián)系，尤其適合用來表示集合(或)類之間的“大致關(guān)系”，它也常常被用來幫助推導(或理解推導過程)關(guān)于集合運算(或類運算)的一些規(guī)律。是一種用于直觀表示元素集合重疊的一種圖形。接下來和大家分享一下韋恩圖的制作方法。

1.在線Venn圖的解鎖
（1）jvenn（http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html）
第一步：（界面）打開鏈接是這樣的。

第二步：（數(shù)據(jù)輸入）左側(cè)輸入數(shù)據(jù)，這里也可以導入文件，輸入文件為文本文檔。在輸入對應組合名時，組合名不能超過11個字符。

第三步：（釋義與數(shù)據(jù)導出）在上圖紅框中輸入數(shù)據(jù)，即可得到兩個數(shù)據(jù)集的交集基因，如不需要柱狀圖，可通過將下圖紅框中設(shè)置為"NO"，同時通過點擊黃框中的英文即可得到圖像及相應的文件。

（2）Draw Venn Diagram（http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/）

第一步：（界面）打開首頁是這樣的。

第二步：（數(shù)據(jù)輸入）左側(cè)輸入數(shù)據(jù)，這里既可以導入文件，也可以直接輸入組合的列表，如果輸入框不夠，可以點擊"Add"添加新的輸入框。右側(cè)可填寫對應組合的名稱。

第三步：（數(shù)據(jù)導出）上傳數(shù)據(jù)，命名好組名并點擊"Submit"，即可得到結(jié)果。最后，就是下載結(jié)果。

在線Venn圖小結(jié)
jvenn和Draw Venn Diagram兩個Venn圖網(wǎng)站各有優(yōu)缺點。jvenn只能畫少于6組的Venn圖且會限制組名的長度，Draw Venn Diagram能夠畫大于6組的圖像。

2、R語言代碼Venn圖的解鎖
（1）首先展示一個使用R的VennDiagram包繪制常規(guī)韋恩圖的方法，該包適用于2<=樣本數(shù)<=5的情形。通常韋恩圖所展示的樣本數(shù)量不會超過5，因為當樣本數(shù)量大于5時，繪圖結(jié)果將難以觀測。因此對于VennDiagram包來講，它所支持的樣本數(shù)量也是最多為5個。其實不止R的VennDiagram包，其它可繪制韋恩圖的R包或除R外的其它繪圖工具等，一般也不支持樣本數(shù)大于5個的情形。

第一步：Venn圖數(shù)據(jù)整理