一文回顧2021年中藥在單體、復(fù)方、腸道微生物領(lǐng)域研究進(jìn)展
當(dāng)前，各類儀器分析技術(shù)及平臺，尤其是質(zhì)譜技術(shù)的長足發(fā)展，促進(jìn)了中藥化學(xué)成分的系統(tǒng)高效解析。隨著組學(xué)技術(shù)的發(fā)展，系統(tǒng)生物學(xué)和網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)發(fā)展十分迅速，為解析中藥對機(jī)體調(diào)節(jié)機(jī)制提供了強(qiáng)大支撐。在中醫(yī)原創(chuàng)理論指導(dǎo)下，整合多學(xué)科技術(shù)方法，將推動中藥作用模式解析，促進(jìn)中藥及醫(yī)藥領(lǐng)域的新發(fā)現(xiàn)。今天，中科新生命為大家精心盤點(diǎn)了中藥領(lǐng)域研究進(jìn)展及2021年高分精選文章簡讀，希望能為大家提供一些科研思路，也祝愿各位老師在2022年再創(chuàng)高峰
1 中藥單體
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，迄今為止，中藥領(lǐng)域涉及單體文章，共發(fā)表10493篇，其中IF≥10的文章共1108篇；2021年發(fā)表1521篇，IF≥10的文章132篇，具體如下：
2 中藥復(fù)方
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，迄今為止，中藥領(lǐng)域涉及復(fù)方文章，共發(fā)表21294篇，其中IF≥10的文章共97篇；2021年發(fā)表3705篇，IF≥10的文章15篇，具體如下：
3 中藥腸道微生物
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，迄今為止，中藥領(lǐng)域涉及腸道微生物文章，共發(fā)表1541篇，其中IF≥10的文章共44篇；2021年發(fā)表546篇，IF≥10的文章10篇，具體如下：
精選文獻(xiàn)簡讀
一、中藥單體
1
文獻(xiàn)名稱：The phytochemical hyperforin triggers thermogenesis in adipose tissue via a Dlat-AMPK signaling axis to curb obesity
發(fā)表期刊：Cell Metabolism（IF=27.2）
組學(xué)技術(shù)：CMAP基因組系統(tǒng)關(guān)聯(lián)、小分子—蛋白互作質(zhì)譜法
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠脂肪細(xì)胞、脂肪組織，人體皮下和內(nèi)臟脂肪組織
技術(shù)路線：
· CMAP基因組系統(tǒng)關(guān)聯(lián)篩選到貫葉金絲桃素為小鼠的抗肥胖劑；
· 金絲桃素促進(jìn)脂肪組織生熱、體重減輕；
· 小分子—蛋白互作質(zhì)譜、微量熱泳動分析和分子對接結(jié)合，鑒定Dlat為HPF的直接靶點(diǎn)；
· 體內(nèi)體外驗(yàn)證HPF誘導(dǎo)的產(chǎn)熱作用由Dlat AMPK-PGC1a軸調(diào)節(jié)。
小結(jié)：本研究通過CMAP基因組系統(tǒng)關(guān)聯(lián)技術(shù)（Connectivity Map）技術(shù)，發(fā)現(xiàn)貫葉連翹提取化合物—貫葉金絲桃素(HPF)，可以通過促進(jìn)脂肪組織產(chǎn)熱，抑制肥胖。作者使用小分子—蛋白互作質(zhì)譜鑒定出Dlat為貫葉金絲桃素的直接分子靶點(diǎn)，并且揭示它對貫葉金絲桃素介導(dǎo)的脂肪細(xì)胞產(chǎn)熱起關(guān)鍵作用。
2
文獻(xiàn)名稱：Breviscapine Alleviates NASH by inhibiting TGF-β-activated Kinase 1-dependent signaling（客戶文章）
發(fā)表期刊：Hepatology（IF=17.4）
組學(xué)技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠組織及血清
技術(shù)路線：
· 體內(nèi)、體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證燈盞花乙素對非酒精性脂肪性肝炎(NASH)有療效；
· 轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)表明，其關(guān)鍵機(jī)制是抑制TAK1磷酸化和MAPK信號級聯(lián)反應(yīng)；
· 抑制劑干預(yù)靶蛋白，驗(yàn)證靶蛋白在藥物分子發(fā)揮效應(yīng)中的地位。
小結(jié)：本研究在體內(nèi)和體外評估了燈盞花素對肝脂肪變性、炎癥和纖維化發(fā)展的影響。燈盞花素治療顯著降低了喂食高脂肪飲食、高脂肪/高膽固醇飲食或蛋氨酸和膽堿缺乏的小鼠的脂質(zhì)積累、炎癥細(xì)胞浸潤、肝損傷和纖維化。轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析進(jìn)一步表明，其關(guān)鍵機(jī)制是抑制TAK1磷酸化和隨后的MAPK信號級聯(lián)反應(yīng)。用TAK1抑制劑治療消除了燈盞花素介導(dǎo)的代謝脅迫下的肝臟保護(hù)作用。分子對接表明燈盞花素直接與TAK1結(jié)合。燈盞花素通過直接抑制TAK1信號通路來阻止代謝應(yīng)激誘導(dǎo)的非酒精性脂肪性肝炎進(jìn)展，可能是治療非酒精性脂肪性肝炎的一種候選藥物。
二、中藥復(fù)方
1
文獻(xiàn)名稱：The Identification of the Biomarkers of Sheng-Ji Hua-Yu Formula Treated Diabetic Wound Healing Using Modular Pharmacology（客戶文章）
發(fā)表期刊：Frontiers in Pharmacology（IF=5.8）
組學(xué)技術(shù)：中藥成分分析、定量分析、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠皮膚組織
技術(shù)路線：
· 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)：構(gòu)建生濟(jì)化瘀方關(guān)鍵成分和靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)；
· 分子對接：篩選關(guān)鍵基因，驗(yàn)證核心靶點(diǎn)；
· 成分分析：LC-MS/MS鑒定及定量化學(xué)成分，建立質(zhì)量控制方法；
· 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)：驗(yàn)證生物標(biāo)志物及信號通路。
小結(jié)：本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)構(gòu)建生濟(jì)化瘀方的成分和靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)，ClusterONE算法識別關(guān)鍵基因和核心通路，分子對接和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證生濟(jì)化瘀方的生物標(biāo)志物。LC-MS/MS鑒定和定量化學(xué)成分，富集分析表明其通過神經(jīng)活性配體-受體相互作用和cAMP信號通路的調(diào)節(jié)，從而改善糖尿病創(chuàng)面愈合樣損傷。
2
文獻(xiàn)名稱：TMT-based proteomics analysis reveals the protective effect of Jueyin granules on imiquimod-induced psoriasis mouse model by causing autophagy（客戶文章）
發(fā)表期刊：Phytomedicine（IF=5.3）
組學(xué)技術(shù)：中藥成分分析、定量分析、TMT蛋白質(zhì)組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠皮膚組織
技術(shù)路線：
· 成分分析：LC-MS/MS鑒定及定量決銀顆�；瘜W(xué)成分分析，建立質(zhì)量控制方法；
· TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)：分析差異表達(dá)蛋白(DEPs)；
· 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)：鑒定并驗(yàn)證關(guān)鍵蛋白，證實(shí)決銀顆粒對銀屑病的作用機(jī)制。
小結(jié)：本研究首次使用LC-MS/MS對決銀顆粒的成分進(jìn)行定性和定量分析。此外，通過TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，揭示了決銀顆�？赡芡ㄟ^上調(diào)ApoA1誘導(dǎo)細(xì)胞自噬，抑制CD4+T細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的浸潤，減輕咪喹莫特誘導(dǎo)的銀屑病炎癥。
3
文獻(xiàn)名稱：Detection of an anti-angina therapeutic module in the effective population treated by a multi-target drug Danhong injection: a randomized trial
發(fā)表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy（IF=18.1）
組學(xué)技術(shù)：中藥指紋圖譜、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：中度癥狀性穩(wěn)定型心絞痛患者
技術(shù)路線：
· 成分分析：LC-MS/MS指紋圖譜鑒定丹紅注射液（DHI）化學(xué)成分，建立質(zhì)量控制方法；
· 臨床試驗(yàn)：多中心、隨機(jī)、雙盲臨床試驗(yàn)評估，顯示初始短期丹紅注射液療程緩解了心絞痛并改善了自我評估的健康狀況；
· 轉(zhuǎn)錄組學(xué)：差異基因分析，功能上不太可能與穩(wěn)定型心絞痛有關(guān)；
· 模塊化網(wǎng)絡(luò)藥理：通過25個靶向功能模塊（TFM）網(wǎng)絡(luò)治療心絞痛，在不同反應(yīng)人群中具有全局靈活性。
小結(jié)：本研究通過多中心、隨機(jī)、雙盲臨床試驗(yàn)，在大約90天的隨訪中，丹紅注射液最初的短期療程以及最佳藥物治療，更大程度上緩解了心絞痛，并改善了自我評估的健康狀況。此外，本研究基于差異反應(yīng)人群中的模塊靈活性，采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)來檢測多靶點(diǎn)藥物的有效治療模塊。
三、中藥腸道微生物
1
文獻(xiàn)名稱：Gut microbiota-derived inosine from dietary barley leaf supplementation attenuates colitis through PPARγ signaling activation
發(fā)表期刊：Microbiome（IF=14.6）
組學(xué)技術(shù)：16S rRNA、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導(dǎo)的結(jié)腸炎小鼠模型
技術(shù)路線：
· 藥效學(xué)研究大麥葉（BL）減輕葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導(dǎo)的小鼠結(jié)腸炎；
· 功能研究BL增強(qiáng)了結(jié)腸動力，提高了粘膜屏障功能；
· 轉(zhuǎn)錄組學(xué)表明BL可能與PPARγ信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路有關(guān)；
· 代謝組學(xué)表明BL促進(jìn)腸道菌群來源的嘌呤代謝物的富集；
· 體內(nèi)體外驗(yàn)證，肌苷激活人結(jié)腸上皮細(xì)胞中的PPARγ信號及功能，通過A2AR/PPARγ改善腸道功能及結(jié)腸炎。
小結(jié)：本研究通過16S rRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)大麥葉可改善葡聚糖硫酸鈉(DSS)引發(fā)的腸道菌群失調(diào)，其機(jī)制是通過激活PPARγ信號轉(zhuǎn)導(dǎo)，提高腸粘膜屏障作用所引發(fā)的。代謝組學(xué)分析表明腸道菌群通過調(diào)控結(jié)腸組織中大麥葉誘導(dǎo)的代謝重編程增強(qiáng)糖酵解過程而發(fā)揮作用。補(bǔ)充外源性肌苷可產(chǎn)生與大麥葉相似的結(jié)腸炎保護(hù)作用。本研究為大麥葉對結(jié)腸炎保護(hù)作用潛在機(jī)制提供了新的見解，并論證大麥葉和肌苷在預(yù)防潰瘍性結(jié)腸炎中的潛在應(yīng)用。
2
文獻(xiàn)名稱：Ginseng polysaccharides alter the gut microbiota and kynurenine/tryptophan ratio，potentiating the antitumour effect of antiprogrammed cell death 1/programmed cell death ligand 1 (anti- PD-1/PD- L1) immunotherapy
發(fā)表期刊：Gut（IF=23.0）
組學(xué)技術(shù)：16S PicBio SMRT測序、靶向代謝組學(xué)（短鏈脂肪酸、色氨酸代謝通路）、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：LLC荷瘤小鼠模型、非小細(xì)胞肺癌患者
技術(shù)路線：
· 聯(lián)合治療對動物模型的抗腫瘤作用：抑制腫瘤生長，提高動物存活，激活CD8+T細(xì)胞，抑制Tregs細(xì)胞；
· 聯(lián)合治療對腸道微生態(tài)的作用：改善菌群組成，減少炎癥浸潤，增強(qiáng)細(xì)胞保護(hù)功能；
· 聯(lián)合治療對菌群相關(guān)代謝物的作用：影響短鏈脂肪酸、色氨酸代謝；
· 臨床分析：免疫治療響應(yīng) VS 非響應(yīng)患者的腸道菌群差異，狄氏副擬桿菌等豐度較高，且與治療響應(yīng)及預(yù)后有關(guān)；
· 聯(lián)合治療對非響應(yīng)患者糞便移植動物的治療效果：恢復(fù)免疫治療響應(yīng)，伴隨免疫、腸道菌群組成及其相關(guān)代謝物的相應(yīng)改變。
小結(jié)：本研究利用肺癌荷瘤小鼠小鼠模型實(shí)驗(yàn)和臨床樣本，通過糞菌移植(FMT)、16S PacBio單分子實(shí)時測序(SMRT)和代謝組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)人參多糖（GPs）可增強(qiáng)非小細(xì)胞肺癌患者對PD-1免疫治療的敏感性。狄氏副擬桿菌和普通擬桿菌也可作為抗PD-1免疫治療的佐劑。腸道菌群可用于預(yù)測抗PD-1免疫療法反應(yīng)的新型生物標(biāo)志物。可見，本研究揭示了中藥通過調(diào)控腸道菌群增強(qiáng)腫瘤免疫治療的巨大應(yīng)用潛力。
3
文獻(xiàn)名稱：Polyamine metabolism links gut microbiota and testicular dysfunction
發(fā)表期刊：Microbiome（IF=14.6）
組學(xué)技術(shù)：宏基因組、代謝組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠睪丸損傷模型
技術(shù)路線：
· 雷公藤甲素注射造成嚴(yán)重的睪丸損傷，影響包括精胺代謝在內(nèi)的多條代謝途徑的改變；
· 睪丸損傷后，多胺代謝在睪丸和腸道微生物群中均受到抑制；
· 補(bǔ)充多胺可改善睪丸功能障礙；
· 由精胺調(diào)節(jié)的熱休克蛋白70家族（HSP70s）可防止睪丸損傷；
· 抗生素去除腸道菌群加劇了睪丸損傷，移植狄氏副擬桿菌可改善睪丸損傷。
小結(jié)：本研究以雷公藤甲素誘導(dǎo)小鼠睪丸損傷為模型，采用代謝組學(xué)與宏基因組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)雷公藤甲素抑制多胺的生物合成與吸收，同時破壞多胺產(chǎn)生菌的動態(tài)平衡。補(bǔ)充多胺或者移植腸道菌群能夠改善睪丸損傷，揭示了腸道菌群在改善睪丸損傷中發(fā)揮重要作用。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，精胺的保護(hù)作用依賴于HSP70蛋白的上調(diào)。
1 中藥單體
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，迄今為止，中藥領(lǐng)域涉及單體文章，共發(fā)表10493篇，其中IF≥10的文章共1108篇；2021年發(fā)表1521篇，IF≥10的文章132篇，具體如下：
2 中藥復(fù)方
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，迄今為止，中藥領(lǐng)域涉及復(fù)方文章，共發(fā)表21294篇，其中IF≥10的文章共97篇；2021年發(fā)表3705篇，IF≥10的文章15篇，具體如下：
3 中藥腸道微生物
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，迄今為止，中藥領(lǐng)域涉及腸道微生物文章，共發(fā)表1541篇，其中IF≥10的文章共44篇；2021年發(fā)表546篇，IF≥10的文章10篇，具體如下：
精選文獻(xiàn)簡讀
一、中藥單體
1
文獻(xiàn)名稱：The phytochemical hyperforin triggers thermogenesis in adipose tissue via a Dlat-AMPK signaling axis to curb obesity
發(fā)表期刊：Cell Metabolism（IF=27.2）
組學(xué)技術(shù)：CMAP基因組系統(tǒng)關(guān)聯(lián)、小分子—蛋白互作質(zhì)譜法
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠脂肪細(xì)胞、脂肪組織，人體皮下和內(nèi)臟脂肪組織
技術(shù)路線：
· CMAP基因組系統(tǒng)關(guān)聯(lián)篩選到貫葉金絲桃素為小鼠的抗肥胖劑；
· 金絲桃素促進(jìn)脂肪組織生熱、體重減輕；
· 小分子—蛋白互作質(zhì)譜、微量熱泳動分析和分子對接結(jié)合，鑒定Dlat為HPF的直接靶點(diǎn)；
· 體內(nèi)體外驗(yàn)證HPF誘導(dǎo)的產(chǎn)熱作用由Dlat AMPK-PGC1a軸調(diào)節(jié)。
小結(jié)：本研究通過CMAP基因組系統(tǒng)關(guān)聯(lián)技術(shù)（Connectivity Map）技術(shù)，發(fā)現(xiàn)貫葉連翹提取化合物—貫葉金絲桃素(HPF)，可以通過促進(jìn)脂肪組織產(chǎn)熱，抑制肥胖。作者使用小分子—蛋白互作質(zhì)譜鑒定出Dlat為貫葉金絲桃素的直接分子靶點(diǎn)，并且揭示它對貫葉金絲桃素介導(dǎo)的脂肪細(xì)胞產(chǎn)熱起關(guān)鍵作用。
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文獻(xiàn)名稱：Breviscapine Alleviates NASH by inhibiting TGF-β-activated Kinase 1-dependent signaling（客戶文章）
發(fā)表期刊：Hepatology（IF=17.4）
組學(xué)技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠組織及血清
技術(shù)路線：
· 體內(nèi)、體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證燈盞花乙素對非酒精性脂肪性肝炎(NASH)有療效；
· 轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)表明，其關(guān)鍵機(jī)制是抑制TAK1磷酸化和MAPK信號級聯(lián)反應(yīng)；
· 抑制劑干預(yù)靶蛋白，驗(yàn)證靶蛋白在藥物分子發(fā)揮效應(yīng)中的地位。
小結(jié)：本研究在體內(nèi)和體外評估了燈盞花素對肝脂肪變性、炎癥和纖維化發(fā)展的影響。燈盞花素治療顯著降低了喂食高脂肪飲食、高脂肪/高膽固醇飲食或蛋氨酸和膽堿缺乏的小鼠的脂質(zhì)積累、炎癥細(xì)胞浸潤、肝損傷和纖維化。轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析進(jìn)一步表明，其關(guān)鍵機(jī)制是抑制TAK1磷酸化和隨后的MAPK信號級聯(lián)反應(yīng)。用TAK1抑制劑治療消除了燈盞花素介導(dǎo)的代謝脅迫下的肝臟保護(hù)作用。分子對接表明燈盞花素直接與TAK1結(jié)合。燈盞花素通過直接抑制TAK1信號通路來阻止代謝應(yīng)激誘導(dǎo)的非酒精性脂肪性肝炎進(jìn)展，可能是治療非酒精性脂肪性肝炎的一種候選藥物。
二、中藥復(fù)方
1
文獻(xiàn)名稱：The Identification of the Biomarkers of Sheng-Ji Hua-Yu Formula Treated Diabetic Wound Healing Using Modular Pharmacology（客戶文章）
發(fā)表期刊：Frontiers in Pharmacology（IF=5.8）
組學(xué)技術(shù)：中藥成分分析、定量分析、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠皮膚組織
技術(shù)路線：
· 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)：構(gòu)建生濟(jì)化瘀方關(guān)鍵成分和靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)；
· 分子對接：篩選關(guān)鍵基因，驗(yàn)證核心靶點(diǎn)；
· 成分分析：LC-MS/MS鑒定及定量化學(xué)成分，建立質(zhì)量控制方法；
· 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)：驗(yàn)證生物標(biāo)志物及信號通路。
小結(jié)：本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)構(gòu)建生濟(jì)化瘀方的成分和靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)，ClusterONE算法識別關(guān)鍵基因和核心通路，分子對接和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證生濟(jì)化瘀方的生物標(biāo)志物。LC-MS/MS鑒定和定量化學(xué)成分，富集分析表明其通過神經(jīng)活性配體-受體相互作用和cAMP信號通路的調(diào)節(jié)，從而改善糖尿病創(chuàng)面愈合樣損傷。
2
文獻(xiàn)名稱：TMT-based proteomics analysis reveals the protective effect of Jueyin granules on imiquimod-induced psoriasis mouse model by causing autophagy（客戶文章）
發(fā)表期刊：Phytomedicine（IF=5.3）
組學(xué)技術(shù)：中藥成分分析、定量分析、TMT蛋白質(zhì)組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠皮膚組織
技術(shù)路線：
· 成分分析：LC-MS/MS鑒定及定量決銀顆�；瘜W(xué)成分分析，建立質(zhì)量控制方法；
· TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)：分析差異表達(dá)蛋白(DEPs)；
· 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)：鑒定并驗(yàn)證關(guān)鍵蛋白，證實(shí)決銀顆粒對銀屑病的作用機(jī)制。
小結(jié)：本研究首次使用LC-MS/MS對決銀顆粒的成分進(jìn)行定性和定量分析。此外，通過TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，揭示了決銀顆�？赡芡ㄟ^上調(diào)ApoA1誘導(dǎo)細(xì)胞自噬，抑制CD4+T細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的浸潤，減輕咪喹莫特誘導(dǎo)的銀屑病炎癥。
3
文獻(xiàn)名稱：Detection of an anti-angina therapeutic module in the effective population treated by a multi-target drug Danhong injection: a randomized trial
發(fā)表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy（IF=18.1）
組學(xué)技術(shù)：中藥指紋圖譜、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：中度癥狀性穩(wěn)定型心絞痛患者
技術(shù)路線：
· 成分分析：LC-MS/MS指紋圖譜鑒定丹紅注射液（DHI）化學(xué)成分，建立質(zhì)量控制方法；
· 臨床試驗(yàn)：多中心、隨機(jī)、雙盲臨床試驗(yàn)評估，顯示初始短期丹紅注射液療程緩解了心絞痛并改善了自我評估的健康狀況；
· 轉(zhuǎn)錄組學(xué)：差異基因分析，功能上不太可能與穩(wěn)定型心絞痛有關(guān)；
· 模塊化網(wǎng)絡(luò)藥理：通過25個靶向功能模塊（TFM）網(wǎng)絡(luò)治療心絞痛，在不同反應(yīng)人群中具有全局靈活性。
小結(jié)：本研究通過多中心、隨機(jī)、雙盲臨床試驗(yàn)，在大約90天的隨訪中，丹紅注射液最初的短期療程以及最佳藥物治療，更大程度上緩解了心絞痛，并改善了自我評估的健康狀況。此外，本研究基于差異反應(yīng)人群中的模塊靈活性，采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)來檢測多靶點(diǎn)藥物的有效治療模塊。
三、中藥腸道微生物
1
文獻(xiàn)名稱：Gut microbiota-derived inosine from dietary barley leaf supplementation attenuates colitis through PPARγ signaling activation
發(fā)表期刊：Microbiome（IF=14.6）
組學(xué)技術(shù)：16S rRNA、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導(dǎo)的結(jié)腸炎小鼠模型
技術(shù)路線：
· 藥效學(xué)研究大麥葉（BL）減輕葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導(dǎo)的小鼠結(jié)腸炎；
· 功能研究BL增強(qiáng)了結(jié)腸動力，提高了粘膜屏障功能；
· 轉(zhuǎn)錄組學(xué)表明BL可能與PPARγ信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路有關(guān)；
· 代謝組學(xué)表明BL促進(jìn)腸道菌群來源的嘌呤代謝物的富集；
· 體內(nèi)體外驗(yàn)證，肌苷激活人結(jié)腸上皮細(xì)胞中的PPARγ信號及功能，通過A2AR/PPARγ改善腸道功能及結(jié)腸炎。
小結(jié)：本研究通過16S rRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)大麥葉可改善葡聚糖硫酸鈉(DSS)引發(fā)的腸道菌群失調(diào)，其機(jī)制是通過激活PPARγ信號轉(zhuǎn)導(dǎo)，提高腸粘膜屏障作用所引發(fā)的。代謝組學(xué)分析表明腸道菌群通過調(diào)控結(jié)腸組織中大麥葉誘導(dǎo)的代謝重編程增強(qiáng)糖酵解過程而發(fā)揮作用。補(bǔ)充外源性肌苷可產(chǎn)生與大麥葉相似的結(jié)腸炎保護(hù)作用。本研究為大麥葉對結(jié)腸炎保護(hù)作用潛在機(jī)制提供了新的見解，并論證大麥葉和肌苷在預(yù)防潰瘍性結(jié)腸炎中的潛在應(yīng)用。
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文獻(xiàn)名稱：Ginseng polysaccharides alter the gut microbiota and kynurenine/tryptophan ratio，potentiating the antitumour effect of antiprogrammed cell death 1/programmed cell death ligand 1 (anti- PD-1/PD- L1) immunotherapy
發(fā)表期刊：Gut（IF=23.0）
組學(xué)技術(shù)：16S PicBio SMRT測序、靶向代謝組學(xué)（短鏈脂肪酸、色氨酸代謝通路）、轉(zhuǎn)錄組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：LLC荷瘤小鼠模型、非小細(xì)胞肺癌患者
技術(shù)路線：
· 聯(lián)合治療對動物模型的抗腫瘤作用：抑制腫瘤生長，提高動物存活，激活CD8+T細(xì)胞，抑制Tregs細(xì)胞；
· 聯(lián)合治療對腸道微生態(tài)的作用：改善菌群組成，減少炎癥浸潤，增強(qiáng)細(xì)胞保護(hù)功能；
· 聯(lián)合治療對菌群相關(guān)代謝物的作用：影響短鏈脂肪酸、色氨酸代謝；
· 臨床分析：免疫治療響應(yīng) VS 非響應(yīng)患者的腸道菌群差異，狄氏副擬桿菌等豐度較高，且與治療響應(yīng)及預(yù)后有關(guān)；
· 聯(lián)合治療對非響應(yīng)患者糞便移植動物的治療效果：恢復(fù)免疫治療響應(yīng)，伴隨免疫、腸道菌群組成及其相關(guān)代謝物的相應(yīng)改變。
小結(jié)：本研究利用肺癌荷瘤小鼠小鼠模型實(shí)驗(yàn)和臨床樣本，通過糞菌移植(FMT)、16S PacBio單分子實(shí)時測序(SMRT)和代謝組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)人參多糖（GPs）可增強(qiáng)非小細(xì)胞肺癌患者對PD-1免疫治療的敏感性。狄氏副擬桿菌和普通擬桿菌也可作為抗PD-1免疫治療的佐劑。腸道菌群可用于預(yù)測抗PD-1免疫療法反應(yīng)的新型生物標(biāo)志物。可見，本研究揭示了中藥通過調(diào)控腸道菌群增強(qiáng)腫瘤免疫治療的巨大應(yīng)用潛力。
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文獻(xiàn)名稱：Polyamine metabolism links gut microbiota and testicular dysfunction
發(fā)表期刊：Microbiome（IF=14.6）
組學(xué)技術(shù)：宏基因組、代謝組學(xué)
實(shí)驗(yàn)材料：小鼠睪丸損傷模型
技術(shù)路線：
· 雷公藤甲素注射造成嚴(yán)重的睪丸損傷，影響包括精胺代謝在內(nèi)的多條代謝途徑的改變；
· 睪丸損傷后，多胺代謝在睪丸和腸道微生物群中均受到抑制；
· 補(bǔ)充多胺可改善睪丸功能障礙；
· 由精胺調(diào)節(jié)的熱休克蛋白70家族（HSP70s）可防止睪丸損傷；
· 抗生素去除腸道菌群加劇了睪丸損傷，移植狄氏副擬桿菌可改善睪丸損傷。
小結(jié)：本研究以雷公藤甲素誘導(dǎo)小鼠睪丸損傷為模型，采用代謝組學(xué)與宏基因組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)雷公藤甲素抑制多胺的生物合成與吸收，同時破壞多胺產(chǎn)生菌的動態(tài)平衡。補(bǔ)充多胺或者移植腸道菌群能夠改善睪丸損傷，揭示了腸道菌群在改善睪丸損傷中發(fā)揮重要作用。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，精胺的保護(hù)作用依賴于HSP70蛋白的上調(diào)。
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