BioXp基因合成系統(tǒng)在生物合成學(xué)中的應(yīng)用

BioXp 3250 系統(tǒng)在不到20小時(shí)時(shí)間內(nèi)合成1800bp DNA和mRNA的全自動(dòng)合成儀。

極簡的合成流程

1.通過我們完全保密的官方網(wǎng)站，提交您的序列和載體信息

2.您的試劑耗材將在2-3天內(nèi)制備好

3.您只需在收到耗材后，按照指定位置進(jìn)行安放，點(diǎn)擊開始，即可運(yùn)行

4.運(yùn)行過程中完全免人工操作，您只需等待8-24小時(shí)即可獲得合成產(chǎn)物

5.運(yùn)行結(jié)束后，合成產(chǎn)物可直接進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)

多樣化的合成產(chǎn)物類型

BioXp基因合成系統(tǒng)在抗體藥物研究中的應(yīng)用

背景

自 1975 年 Köhler 和 Milstein 首次成功地將骨髓瘤細(xì)胞系與 B 細(xì)胞融合以產(chǎn)生雜交瘤以來，抗體已成為公認(rèn)的治療方法。與小分子藥物相比，抗體療法在選擇性、功能方面具有優(yōu)勢，預(yù)計(jì)到 2024 年全球市場增長超過 2458 億美元。目前藥物開發(fā)方向主要是針對復(fù)雜膜的治療性抗體的開發(fā)，如 GPCR 和離子通道。這兩個(gè)目標(biāo)類別都為常規(guī)的疾病適應(yīng)癥提供了重要的治療前景；然而，它們也被證明難以用傳統(tǒng)的抗體開發(fā)方法解決。

為了應(yīng)對這些挑戰(zhàn)，都需要新興技術(shù)、更精準(zhǔn)的方法和更高的效率。近幾年來，合成生物學(xué)有效的加速了基于抗體的藥物和療法的發(fā)現(xiàn)流程。

加速抗體發(fā)現(xiàn)的新型合成生物學(xué)解決方案

Codex DNA的科學(xué)家、工程師組成的多元化團(tuán)隊(duì)致力于提高合成生物學(xué)的效率并被科學(xué)界廣泛使用。我們相信，利用我們的技術(shù)優(yōu)化工作流程可以幫助解決抗體發(fā)現(xiàn)中的通量差距。

在世界各地，研究人員正在使用 Codex DNA 的新解決方案，包括 BioXp 自動(dòng)化合成生物學(xué)系統(tǒng)和 RapidAMP 技術(shù)，來實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的抗體發(fā)現(xiàn)工作流程，并且簡化流程并縮短項(xiàng)目時(shí)間。

Codex DNA 在抗體藥物研發(fā)中的解決方案

解決抗體發(fā)現(xiàn)的主要瓶頸

• 抗體克隆在數(shù)天而不是數(shù)周內(nèi)完成：通過優(yōu)化合成生物學(xué)工作流程，重鏈和輕鏈可變區(qū)克隆的端到端時(shí)間可以從數(shù)周縮短至數(shù)天。

• 減少工藝流程：RapidAMP™ 技術(shù)在質(zhì)粒生產(chǎn)過程中取代了與克隆、轉(zhuǎn)化以及大腸桿菌培養(yǎng)和收獲相關(guān)繁瑣的人工操作步驟。

• 工作效率的提升：通過使用 BioXp 3250™ 系統(tǒng)，可達(dá)到免人工操作、完全自動(dòng)化的 DNA 序列組裝、克隆和擴(kuò)增，抗體發(fā)現(xiàn)流程可以在傳統(tǒng)流程的一小部分時(shí)間內(nèi)，便可產(chǎn)生轉(zhuǎn)染就緒的質(zhì)粒。并且在單個(gè)通宵便可獲得目標(biāo)產(chǎn)物！

CODEX DNA對抗體發(fā)現(xiàn)工作流程的優(yōu)化

1.免提端到端基因合成和克隆

BioXp 3250 系統(tǒng)代表了一種快速合成生物學(xué)解決方案，它將來自 B 細(xì)胞的測序數(shù)據(jù)連接到下游高通量篩選和表征工作流程。通過使用 BioXp 3250 系統(tǒng)優(yōu)化發(fā)現(xiàn)工作流程，抗體發(fā)現(xiàn)程序可以將先導(dǎo)候選重鏈和輕鏈可變區(qū)克隆的端到端時(shí)間從數(shù)周縮短到幾天。

BioXp 3250 系統(tǒng)是一款全自動(dòng)臺式儀器，能夠從堿基序列開始實(shí)現(xiàn)一鍵式自動(dòng)構(gòu)建合成 DNA。在 Gibson Assembly 的強(qiáng)大支持下，BioXp 可以在單次儀器運(yùn)行中合成基因片段、合成 DNA 并將其克隆到用戶自定義的載體中、構(gòu)建變體庫或合成 mRNA。
 

2.RapidAMP 技術(shù)

Gibson Assembly® RapidAMP 等溫?cái)U(kuò)增可以在兩天的時(shí)間內(nèi)組裝和擴(kuò)增多達(dá) 10 µg 的構(gòu)建好的表達(dá)載體。最終的 DNA 產(chǎn)物可以消化成線性形式，然后準(zhǔn)備用于下游應(yīng)用，無需傳統(tǒng)的大腸桿菌轉(zhuǎn)化和質(zhì)粒純化。RapidAMP™ 技術(shù)已成功用于轉(zhuǎn)染——脂轉(zhuǎn)染和電穿孔——以及體外轉(zhuǎn)錄。

對于前導(dǎo)重鏈和輕鏈候選序列的小規(guī)模轉(zhuǎn)染，該技術(shù)是最優(yōu)的選擇，無需依賴細(xì)菌轉(zhuǎn)化和擴(kuò)增的傳統(tǒng)技術(shù)，瞬時(shí)表達(dá)后，可以從培養(yǎng)上清液中純化成熟抗體，其產(chǎn)量可與傳統(tǒng)大腸桿菌生產(chǎn)的質(zhì)粒相匹配甚至超越。收集的上清液可以很容易地轉(zhuǎn)移到高通量篩選平臺以進(jìn)行下一步的表征篩選。

借助 BioXp 3250 系統(tǒng)和 RapidAMP 技術(shù)，極大的提高抗體發(fā)現(xiàn)的效率，使研究人員可以在幾天內(nèi)生產(chǎn)出高保真、可轉(zhuǎn)染的材料，同時(shí)在內(nèi)部完成整個(gè)工作流程，并跳過細(xì)菌制備和菌落挑選的傳統(tǒng)瓶頸。
 

案例分析

通過對比傳統(tǒng)的工作流程與 BioXp 系統(tǒng)工作流程，發(fā)現(xiàn)后一種方法減少了生成時(shí)間并提高了效率。

總結(jié)：scFv- BioXpM 系統(tǒng)工作流程的優(yōu)勢

*花費(fèi)更少的時(shí)間來載體構(gòu)建

*減少人為錯(cuò)誤的可能性

*降低成本

*產(chǎn)能增加

*縮短交貨時(shí)間

*下游應(yīng)用程序的簡化

*將資源從構(gòu)建轉(zhuǎn)移到驗(yàn)證候選者