單細(xì)胞懸液制備儀在皮膚單細(xì)胞懸液制備及測(cè)序過(guò)程中的應(yīng)用

作為哺乳動(dòng)物最大的器官，皮膚是動(dòng)物與外界環(huán)境間最主要的物理屏障；由于生活習(xí)性和所處的外界環(huán)境不同，皮膚的功能和表面的微生物組成等都會(huì)發(fā)生變化。同時(shí)，皮膚又是獨(dú)特的免疫器官，在維持穩(wěn)態(tài)和抵抗各種病理?xiàng)l件時(shí)，發(fā)揮獨(dú)特的免疫功能。皮膚組織內(nèi)包含如朗格漢斯細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、樹(shù)突細(xì)胞等多種免疫細(xì)胞。在單細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用領(lǐng)域，研究者往往需要對(duì)皮膚組織內(nèi)的不同細(xì)胞亞群進(jìn)行分類，并在不同疾病模型下定位靶細(xì)胞，同時(shí)在進(jìn)行腫瘤類研究時(shí)（如黑色素瘤和鱗狀細(xì)胞癌等）也需要對(duì)腫瘤亞型及細(xì)胞的識(shí)別。

只有制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液才能保證下游實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行，但是常規(guī)手工解離皮膚組織，不但費(fèi)時(shí)，且獲得的細(xì)胞懸液碎片高，產(chǎn)量低，同時(shí)還易結(jié)團(tuán)，細(xì)胞活性差，嚴(yán)重影響下游研究的開(kāi)展，如單細(xì)胞測(cè)序。因此在進(jìn)行皮膚組織單細(xì)胞懸液制備時(shí)，需要更加簡(jiǎn)單快捷的方法，在提高實(shí)驗(yàn)效率同時(shí)，又能保證實(shí)驗(yàn)樣本的質(zhì)量。

瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀，通過(guò)組織處理管機(jī)械剪切，配合酶解試劑盒和內(nèi)置的處理程序及溫控系統(tǒng)，只需將樣本放入，設(shè)好程序，即可輕松獲得高質(zhì)量皮膚單細(xì)胞懸液，獲得的細(xì)胞可直接用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)，如單細(xì)胞測(cè)序、原代細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞分選等。

有了高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液后，高效穩(wěn)定且高性價(jià)比的單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)將保障下游實(shí)驗(yàn)結(jié)果的質(zhì)量與大規(guī)模應(yīng)用的可能。達(dá)普生物Galaxy單細(xì)胞建庫(kù)平臺(tái)基于專利的微流控油包水單細(xì)胞包裹技術(shù)與微球編碼配套技術(shù)，可快速實(shí)現(xiàn) 1-4 樣本的單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建。經(jīng)過(guò)生信分析軟件 StarScope處理后，表達(dá)矩陣結(jié)果兼容幾乎所有下游生信分析軟件，輕松得到單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)數(shù)據(jù)。

下面為大家展示一下，瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀和達(dá)普生物單細(xì)胞建庫(kù)平臺(tái)無(wú)縫對(duì)接的樣本制備與單細(xì)胞建庫(kù)測(cè)序結(jié)果。
 

樣本：小鼠耳部皮膚、背部皮膚。
制備方法：
1. 試劑準(zhǔn)備
使用試劑盒中配套的Buffer將酶A、B、C分別充分溶解。

2. 樣本準(zhǔn)備
將剪下的小鼠背部皮膚置于冷PBS緩沖液中，用手術(shù)剪或手術(shù)刀的閉合圓邊尖端分離皮膚樣本后清洗3遍；耳部皮膚去除無(wú)毛部分，用鑷子將背腹側(cè)分開(kāi)，用鑷子輕輕刮耳朵內(nèi)側(cè)，去除殘留軟骨，然后將皮膚切成約1cm²的組織塊。
 

圖2.小鼠耳部皮膚處理

3. 程序處理
將組織塊和酶mix放入組織處理管，安裝加熱套，運(yùn)行加熱程序 “M_Skin_Heater_1”。

4. 單細(xì)胞懸液收集
程序運(yùn)行結(jié)束后，用潤(rùn)濕后的40 μm細(xì)胞濾器過(guò)濾細(xì)胞懸液樣本，50 mL離心管收集細(xì)胞懸液，500×g離心8min，徹底棄掉上清后，用適當(dāng)緩沖液重懸后用于單細(xì)胞測(cè)序、流式細(xì)胞術(shù)或原代細(xì)胞培養(yǎng)等。
 

圖3.耳部皮膚
 

圖4.背部皮膚

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果

達(dá)普生物先對(duì)上述懸液進(jìn)行成像質(zhì)檢，并選取背部皮膚組織單細(xì)胞懸液，用其自主研發(fā)的Galaxy單細(xì)胞建庫(kù)平臺(tái)及配套的轉(zhuǎn)錄組試劑盒進(jìn)行單細(xì)胞建庫(kù)測(cè)序。

> 測(cè)序結(jié)果
1）達(dá)普StarScope軟件分析結(jié)果：

圖5.UMAP圖
 

圖6.Reference：A Single Cell Transcriptomic Atlas Characterizes Aging Tissues in the Mouse
 

以上單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄測(cè)序結(jié)果顯示：通過(guò)瑞沃德自動(dòng)單細(xì)胞懸液制備系統(tǒng)制備的皮膚組織樣本可以直接用于達(dá)普Galaxy單細(xì)胞建庫(kù)平臺(tái)，不但縮短樣本懸液制備時(shí)間，同時(shí)高質(zhì)量的懸液質(zhì)量，減少了單細(xì)胞建庫(kù)過(guò)程中樣本優(yōu)化及減少一些碎片對(duì)反轉(zhuǎn)錄的影響，保證了建庫(kù)質(zhì)量，整體上縮減了整個(gè)單細(xì)胞建庫(kù)測(cè)序周期， 驗(yàn)證了瑞沃德與達(dá)普Galaxy產(chǎn)品的高兼容性。