全自動(dòng)DNA片段回收儀用于皰疹病毒介導(dǎo)的宿主細(xì)胞miRNA研究

文獻(xiàn)速遞：Pippin Prep全自動(dòng)DNA片段回收儀聯(lián)用Illumina，用于皰疹病毒miRNA介導(dǎo)的宿主細(xì)胞miRNA加工抑制機(jī)制研究
 

Selective inhibition of miRNA processing by a herpesvirus-encoded miRNA【Nature】
皰疹病毒編碼的miRNA對(duì)（宿主）miRNA的選擇性加工抑制

期刊：Nature（IF：64.8）
發(fā)表年份：2022年5月4日
物種：皰疹病毒+人（herpesvirus & human）
文庫類型：小RNA文庫（small-RNA library）
miRNA文庫富集和精準(zhǔn)回收：Sage Science公司Pippin Prep全自動(dòng)DNA片段回收儀
miRNA測(cè)序：Illumina NextSeq 500

 

摘要簡介：

人類皰疹病毒通過控制宿主細(xì)胞的信號(hào)通路和免疫逃避過程，增強(qiáng)其感染性和持續(xù)潛伏及重新激活。雖然普遍認(rèn)為病毒活化-潛伏的開關(guān)和病毒非編碼RNA之間有密切關(guān)系，但具體機(jī)制尚不清楚。

本文中，通過病毒 microRNA （miRNA） 介導(dǎo)的宿主 miRNA 加工抑制，人類皰疹病毒 6A （HHV-6A）被重新激活，轉(zhuǎn)變?yōu)榱呀獠《靖腥�，破壞宿主�?xì)胞線粒體結(jié)構(gòu)、逃避宿主內(nèi)在免疫防御，驗(yàn)證了這一理論。

文章證明，病毒編碼的 miR-aU14 通過與各自的初級(jí) （pri）-miRNA 發(fā)夾環(huán)直接相互作用，選擇性地抑制多個(gè) miR-30 家族成員的加工。隨后 miR-30 的丟失和 miR-30-p53-DRP1 軸線的激活引發(fā)了線粒體結(jié)構(gòu)的深度破壞，進(jìn)而削弱了增殖性病毒感染和病毒再激活都必需的I型干擾素的誘導(dǎo)分泌。miR-aU14 的異位表達(dá)則再度激活了潛伏期病毒，因此可以將病毒 miR-aU14 確定為皰疹病毒溶解-潛伏開關(guān)的主調(diào)節(jié)因子。研究結(jié)果表明，病毒miRNA介導(dǎo)的宿主miRNA加工抑制代表了一種廣義的細(xì)胞機(jī)制，可用于選擇性地靶向miRNA家族的單個(gè)成員。作者預(yù)計(jì)靶向 miR-aU14 將為預(yù)防 HHV-6 相關(guān)疾病中的皰疹病毒再激活提供新的治療選擇。

 

在smallRNAs測(cè)序文庫制備過程中使用Sage Science公司的Pippin Prep全自動(dòng)DNA片段分選回收儀回收141bp的DNA片段，準(zhǔn)確、高效去除引物二聚體及其他非smallRNAs片段DNA，從而獲得高質(zhì)量的smallRNAs測(cè)序數(shù)據(jù)。

原文
Hennig, Thomas, et al. "Selective inhibition of miRNA processing by a herpesvirus-encoded miRNA." Nature 605.7910 (2022): 539-544..

 

美國Sage Science是全球領(lǐng)先的全自動(dòng)核酸電泳片段回收儀的生產(chǎn)廠家，擁有美國技術(shù)專利，各個(gè)型號(hào)產(chǎn)品可以高效完成不同長度范圍的DNA片段的精準(zhǔn)回收，廣泛用于二代測(cè)序、三代測(cè)序以及多種分子生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域。

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