差異表達(dá)蛋白指的是在不同生物樣本或不同處理?xiàng)l件下,其表達(dá)水平發(fā)生顯著變化的蛋白質(zhì)。這種差異表達(dá)的觀察對于理解細(xì)胞生理和疾病機(jī)制是非常重要的。例如,在健康和疾病狀態(tài)下,或者在正常和受到某種處理的細(xì)胞之間,某些蛋白質(zhì)可能會上調(diào)或下調(diào)。
1、檢測方法:
最常用的技術(shù)是質(zhì)譜法,特別是液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)。此外,雙向電泳和Western blot也經(jīng)常被用來研究蛋白質(zhì)的差異表達(dá)。
2、定量方法:
可以使用標(biāo)記或非標(biāo)記的定量策略來定量蛋白質(zhì)在不同樣本中的豐度,從而確定哪些蛋白是差異表達(dá)的。
3、生物學(xué)意義:
差異表達(dá)的蛋白質(zhì)可以為生物過程、細(xì)胞通路或疾病提供重要信息。例如,某些差異表達(dá)的蛋白可能與疾病進(jìn)展、藥物反應(yīng)或細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)有關(guān)。
4、應(yīng)用:
差異表達(dá)蛋白的研究在許多領(lǐng)域都有應(yīng)用,包括癌癥、神經(jīng)退行性疾病、代謝性疾病等。此外,它們也可以作為疾病標(biāo)記物或藥物靶點(diǎn)。
圖1.差異表達(dá)蛋白聚類折線圖
注:x軸表示樣品分組,y軸表示表達(dá)量。黑色線條表示這個(gè)cluster中的所有蛋白在不同實(shí)驗(yàn)條件下相對表達(dá)量的平均值的折線圖。
研究差異表達(dá)蛋白是蛋白質(zhì)組學(xué)的核心領(lǐng)域,它為我們提供了關(guān)于細(xì)胞和組織在不同條件下的功能和狀態(tài)的寶貴信息。