Edman 降解法是一種用于確定小肽和蛋白質(zhì)的N-末端氨基酸序列的方法。這種方法是基于周期性地移除肽鏈N-末端的氨基酸并檢測(cè)該氨基酸的身份。這個(gè)過程可以重復(fù)進(jìn)行,從而連續(xù)地確定多個(gè)氨基酸的順序。
Edman降解的大致步驟如下:
1.肽鍵選擇性標(biāo)記:
首先,樣品與Edman試劑(酚酞異硫氰酸)反應(yīng),這會(huì)特異性地與肽的N-末端氨基酸形成一個(gè)環(huán)狀酞酰化衍生物。
2.酞;苌锏牧呀猓
經(jīng)過酞酰化后,酞酰化氨基酸可以通過溫和的酸性條件(如三氟醋酸)從肽鏈上釋放出來,而不破壞肽鏈上的其它氨基酸。
3.氨基酸檢測(cè):
釋放的酞酰化氨基酸可以通過色譜法進(jìn)行分離和檢測(cè),從而確定其身份。
4.重復(fù)過程:
剩余的肽再次與Edman試劑反應(yīng),釋放下一個(gè)N-末端的氨基酸,如此反復(fù)進(jìn)行。
圖1
雖然這個(gè)方法在確定小肽的序列上很有用,但它有一些局限性。其中最大的局限性是它在降解過程中會(huì)出現(xiàn)效率損失,這通常使得連續(xù)降解超過15-20個(gè)氨基酸變得困難。對(duì)于較大的蛋白質(zhì),通常需要將其分解為較小的片段,然后對(duì)這些片段進(jìn)行Edman降解。
近年來,由于質(zhì)譜技術(shù)的進(jìn)步,質(zhì)譜成為了蛋白質(zhì)序列和鑒定的主要工具,但在某些情境下,Edman降解仍然是一個(gè)有用的補(bǔ)充方法。