中海大：測序與芯片揭示miRNA調控海參夏眠機制

 海參（Apostichopus japonicus），是生活在海邊至海底8000米的海洋棘皮動物，以海底藻類和浮游生物為食。當夏季來臨，上層海水由于太陽光強烈照射，溫度上升。此時，海底的小生物都浮到海面，進行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海參，迫于夏季食物中斷，進入夏眠，此時，其基礎代謝率明顯減退，耗氧和氨氮排泄率下降，甚至嚴重退化為一個很細小的腸纖維。

       MiRNAs在低代謝基因調控中的作用研究，是一個新興的熱點。為了確定miRNAs是否對海參夏眠過程具有調控作用，近日，中國海洋大學的陳慕雁博士后領銜的團隊和聯(lián)川生物公司科研團隊攜手，對海參夏眠過程中的miRNAs進行了深入研究，研究成果發(fā)表在10月刊的PLoS ONE上。

       研究人員對深度夏眠至少連續(xù)15天狀態(tài)的海參采集樣本，并使用經(jīng)過夏眠后又恢復活動狀態(tài)的非夏眠海參為對照樣本。之后，研究人員采用Solexa深度測序技術分析了海參腸miRNA的表達譜，結果一共鑒定出了308個海參miRNAs，包括18個新的海參特異性miRNAs。其中，有42個miRNAs在海參夏眠階段具有表達差異，最突出的miRNAs，包括miR-200-3p, miR-2004, miR-2010, miR-22, miR-252a, miR-252a-3p以及 miR-92，在夏眠與非夏眠階段相比，具有顯著的過表達。差異表達的miRNAs通過miRNA芯片和RT-RCR得到了驗證（miRNA芯片服務由聯(lián)川生物完成）。通過預測的miRNA靶基因并進行GO分析表明，這些miRNAs在海參夏眠階段的全轉錄水平抑制以及細胞分化中發(fā)揮重要作用。

*Chen M, Zhang X, Liu J, Storey KB.（2013） High-Throughput Sequencing Reveals Differential Expression of miRNAs in Intestine from Sea Cucumber during Aestivation. PLoS ONE15;8(10):e76120.[]