浙理工：測序揭示鯊魚肝臟再生相關(guān)miRNAs

大量的證據(jù)表明，microRNAs（miRNAs）豐富地存在于肝臟中，并對肝臟的發(fā)育，再生及疾病的發(fā)生發(fā)揮著重要作用。為了更好地促進肝臟疾病與海洋生物的研究，近日，浙江理工大學(xué)的呂正兵教授，領(lǐng)銜其團隊，對條紋斑竹鯊肝臟的miRNA進行了深入研究，研究成果發(fā)表在7月刊的BioMed Research International上。

雖然條紋斑竹鯊的基因組測序尚未完成，但最近提出的葉吻銀鮫（callorhinchus milii）基因組是一個軟骨魚類基因組理想模型。因此，研究人員使用葉吻銀鮫基因組預(yù)測pre-miRNA的發(fā)夾結(jié)構(gòu)。通過小RNA測序，共有91個已知的miRNA和166個假定候選的miRNAs首次在條紋斑竹鯊中得到鑒定（小RNA測序服務(wù)由聯(lián)川生物完成）。通過目標(biāo)預(yù)測和GO分析， 在91個已知的miRNA中，篩選出46個miRNAs，特別是細胞增殖和生長相關(guān)的miRNAs。

研究人員進一步通過RT-PCR分析條紋斑竹鯊的miRNAs簇以及miRNAs的表達。在正常和再生肝組織中篩選出差異表達的基因,通過鑒定得到十個序列。

本研究是關(guān)于軟骨魚miRNA的首次全面報道， 為條紋斑竹鯊現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫添加了大量新的miRNA序列信息，并為進一步研究miRNAs在條紋斑竹鯊肝臟發(fā)育中的功能奠定了基礎(chǔ)。不僅為魚類也為其它物種的肝臟miRNA研究做出了貢獻。

*Conger Lu, et al. (2013) Study of MicroRNAs Related to the Liver Regeneration of the Whitespotted Bamboo Shark, Chiloscyllium plagiosum. BioMed Research International . [article]