美國紐勤（Neogen）農(nóng)業(yè)基因組學(xué)解決方案
紐勤農(nóng)業(yè)基因組學(xué):
增強(qiáng)全球食品安全紐勤的子公司GeneSeek 是全球領(lǐng)先的農(nóng)業(yè)基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室，自1998 年起便開始提供全面的獸醫(yī)和農(nóng)業(yè)基因組學(xué)診斷解決方案。在農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)商需要就畜群作出決定時(shí)，GeneSeek 可為其提供必要的信息，進(jìn)而為農(nóng)場內(nèi)的食品安全問題提供基因組學(xué)解決方案。GeneSeek 在美國、巴西和歐洲都擁有農(nóng)業(yè)基因組學(xué)專家，能將專業(yè)知識在全球傳播，以特定語言為全球牛肉和牛乳供應(yīng)的關(guān)鍵地區(qū)提供特定于某個市場的協(xié)助。在全球人口快速增長的形勢下，專家預(yù)測到2020年，世界所需的食物將至少增加百分之三十。 屆時(shí)，農(nóng)民們將會被迫使用同等的資源來生產(chǎn)更多的食物，并將對環(huán)境的影響降至最小。因此，農(nóng)業(yè)基因組學(xué)將在增強(qiáng)食品安全方面扮演不可或缺的角色。
GeneSeek由紐勤支持，為食品和動物安全提供基因組學(xué)解決方案和增加農(nóng)業(yè)產(chǎn)量所必需的重要基因組學(xué)信息.結(jié)合紐勤在2012 年獲得的Igenity 生物信息學(xué)系統(tǒng)，GeneSeek 便擁有了一套工具可以幫助牛肉和牛乳生產(chǎn)商辨別積極或消極的性狀，同時(shí)使用這些信息來做出正確的繁殖決定，從增加想要的畜體性狀（如大理石花紋）到避免遺傳�。ㄈ缧⊥葟澢�。GeneSeek 是農(nóng)業(yè)領(lǐng)域重要的技術(shù)服務(wù)商，提供Illumina 的Infinium BeadChip服務(wù)。這些芯片由頂級的農(nóng)業(yè)研究人員用成千上萬已在農(nóng)業(yè)范圍內(nèi)得到證的單核苷酸多態(tài)性（SNP）研發(fā)而成.它們可提供的平均檢出率高達(dá)99%，可重復(fù)性高達(dá) 99.9%。紐勤和GeneSeek可提供眾多的工具和服務(wù)，隨時(shí)準(zhǔn)備幫助生產(chǎn)商加強(qiáng)全球食品安全。
關(guān)于紐勤
成立于 1982年的紐勤公司（納斯達(dá)克：NEOG）已經(jīng)增長為一個全球性企業(yè)，在美國和世界各地?fù)碛谐^750名員工。紐勤堅(jiān)定不移地致力于實(shí)現(xiàn)和滿足客戶所期望的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。紐勤的動物安全部在農(nóng)業(yè)動物基因組學(xué)方面處于領(lǐng)先地位，開發(fā)并銷售眾多動物醫(yī)療產(chǎn)品，包括藥物、診斷、獸醫(yī)器械、傷口護(hù)理、消毒劑和滅鼠劑。紐勤的食品安全部開發(fā)和銷售一站式解決方案，用于簡單、快速并準(zhǔn)確地檢測細(xì)菌致病菌、毒枝菌素、食品過敏原、基因改造、藥物和農(nóng)藥殘留、反芻動物副產(chǎn)品以及食物和動物飼料中的衛(wèi)生問題。再加上 GeneSeek的基因組學(xué)工作，紐勤可為生產(chǎn)商提供必要的產(chǎn)品和服務(wù)，以加強(qiáng)農(nóng)場內(nèi)外的食品安全。
肉牛的基因組學(xué)解決方案
結(jié)合 Igenity 生物信息學(xué)技術(shù)，GeneSeek可為生產(chǎn)商提供必要的信息，以供其在早期作出最佳的繁殖管理決策，既省時(shí)又省錢。通過基因信息，生產(chǎn)商便可以更準(zhǔn)確地預(yù)測關(guān)鍵性狀，如大理石花紋和眼肌面積。
GeneSeek工具提供：
• 全基因組選擇
• 確定遺傳優(yōu)勢
• 識別數(shù)量性狀基因座
• 比較遺傳學(xué)研究
GeneSeek牛全基因組低密度 SNP芯片（GGP-LD）定制的 GeneSeek 牛全基因組（GGP）低密度微珠芯片基于美國 illumina 公司的 infinium化學(xué)技術(shù)，包含預(yù)測遺傳優(yōu)勢所必需的 10,000 多個SNP 標(biāo)記。如此多的SNP 確保了精確度，且包括了許多疾病和生產(chǎn)性狀SNP，包括 Igenity檔案、譜系SNP和關(guān)鍵的異常性狀。數(shù)據(jù)管理紐勤和 GeneSeek使用最先進(jìn)的工具來進(jìn)行數(shù)據(jù)管理和生物信息處理，確保了您可以以最適合您需要的方式來輕松訪問數(shù)據(jù)。
IgenIty 的優(yōu)勢
Igenity 能提供最全面的肉�；驒n案。Igenity可幫助牛肉生產(chǎn)商在選擇、繁殖、管理和銷售牛時(shí)得到更充分的信息，從而更自信地作出決策，而且比以前更為及時(shí)。Igenity檔案：全面、實(shí)用且強(qiáng)大
• 剩余采食量 • 難產(chǎn)率
• 日增重 • 溫順性
• 嫩度 • 肌生成抑制蛋白
• 大理石花紋 • 毛色（純合子黑色）
• 質(zhì)量等級 • 特殊品種，有角/無角
• 產(chǎn)量等級 • 復(fù)雜公畜譜系
• 脂肪厚度 • 牛病毒性腹瀉–持續(xù)感染
• 眼肌面積 （BVD-PI）診斷試
• 小母牛受孕率 • 特殊品種遺傳缺陷多重試驗(yàn)
• 保持力
Igenity有角/無角
眾所周知，商品牛如果有角，則會引起生產(chǎn)力降低，且會損壞畜體。Igenity可對數(shù)個品種進(jìn)行有角/無角分析，包括夏洛來牛、蓋普威牛、海福特牛、利木贊牛、西門塔爾牛和短角牛。
SeekSire譜系檢測
SeekSire 是專為牧場主、畜牧生產(chǎn)者和養(yǎng)殖協(xié)會而開發(fā)的，因?yàn)樗麄冃枰愿叨染_且成本效率較高的方式來管理其畜群的譜系。SeekSire 可以用來維護(hù)牧群登記、促進(jìn)基因改良并管理畜群生產(chǎn)和質(zhì)量。此外，一旦在一個畜群中所使用的所有公畜和母畜都通過 DNA得到了識別，便可識別所有后代，進(jìn)而實(shí)現(xiàn)完全的可追溯性。服務(wù)包括用于分配公畜的基因分型和生物信息學(xué)。牛懷孕早期檢測作為一個受到認(rèn)證的生物追蹤實(shí)驗(yàn)室，GeneSeek 為牛肉和乳牛生產(chǎn)商提供 BioPRYN®牛懷孕早期檢測診斷檢測服務(wù)。BioPRYN 是一個安全精確的懷孕檢測工具，作為農(nóng)場獸醫(yī)服務(wù)的一個補(bǔ)充，它為牛群提供了觸診和超聲波之外的診斷方法。BioPRYN測量在牲畜的血液循環(huán)中是否存在只在懷孕時(shí)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)B（PSPB），只有成長中胎兒的胎盤才會產(chǎn)生這種蛋白質(zhì)。母牛和小母牛必須在接種后 28天方可接受此試驗(yàn)，母牛在產(chǎn)犢后73 天方可接受此試驗(yàn)。
遺傳異常測試
遺傳病不僅會導(dǎo)致生產(chǎn)商的經(jīng)濟(jì)損失，還會對牲畜造成過大的壓力。在接種前的遺傳測試可以給生產(chǎn)商提供必要的信息，以做出最佳的接種決定，從而避免遺傳病，諸如：
• 小腿彎曲（多發(fā)性關(guān)節(jié)硬化癥）
• 神經(jīng)性腦積水（NH）
• 先天性西昌趾（攣縮性蜘蛛指綜合征）
• 肺發(fā)育不良，并全身水腫（PHA）
• 脛側(cè)半肢畸形（TH）
• 特發(fā)性癲癇（IE）
• 骨硬化病
• 軟骨發(fā)育異常
• 皮毛光滑
• 褐色
• 甘露糖苷過多癥
提交表單和訂購表單可在 上找到
乳制品的基因組學(xué)解決方案
乳牛的基因測試為生產(chǎn)商提供必要的信息，以使其了解牲畜的積極和消極性狀，如不育、有角/無角和脊椎畸形綜合征（CVM）。
GeneSeek奶�；蚪M分析（低密度）與肉牛的基因組方案一樣，客戶定制的GeneSeek基因組分析方案（GGP）的低密度芯片采用Illumina Infinium化學(xué)技術(shù)，包括了近10,000 個SNP，含有很多疾病和生產(chǎn)性能特征。GGP正快速成為性能測試的全球標(biāo)準(zhǔn)。
GeneSeek 奶�；蚪M分析（高密度）定制的牛 GGP-HD微珠芯片包括 78,000多個 SNP，用于得到增強(qiáng)的基因組選擇能力，而且極度適合于推算到更高密度的標(biāo)記集以支持研究，可用于最精確地預(yù)測優(yōu)良品種個體.
GGP芯片還包括：
• SNP譜系 • 乳牛（澤西種）生育單倍型1
• β-酪蛋白 A/B • 卡帕-酪蛋白I和II
• β-乳球蛋白 • 銀色稀釋
• 黑/紅色外標(biāo)記顏色 • Y染色體不育
• 牛白細(xì)胞粘附缺陷�。˙LAD） • 脊椎畸形綜合征（CVM）*
• 軟骨發(fā)育異常 • 有角/無角
• 瓜氨酸血癥 • β-酪蛋白A2*
• 尿苷磷酸合成酶缺陷癥（DUMPS） • 短脊椎綜合癥*
• 褐色 • 毛發(fā)稀少-KRT71基因（鼠尾）*
• 乳牛（荷爾斯坦因種）單體型影響生育
（HH1，HH2，HH3）
*這些選配的、需要許可證的試驗(yàn)需要額外的檢測費(fèi)
SeekSire血統(tǒng)測試和懷孕檢測
GeneSeek的 SeekSire程序和早期懷孕檢測也可用于乳牛
商品小乳牛檔案
用 GGP芯片技術(shù)加速您畜群中的遺傳進(jìn)展
許多乳制品生產(chǎn)企業(yè)從畜群的大批量基因組篩選的投資中得到了極大的回報(bào)。乳制品生產(chǎn)商有大量替代小母�？晒┻x擇。由于性控精液的使用，乳牛繁殖的效率變得越來越高。使用了 Gen-eSeek全基因組分析方案（GGP）定制基因分型微珠芯片，生產(chǎn)商便可就譜系的雌性方作出決定，而之前的大多數(shù)遺傳進(jìn)展都是通過選擇公牛來實(shí)現(xiàn)的。GGP 的結(jié)果比標(biāo)準(zhǔn)的父母平均值預(yù)測方法有顯著提高。測試您的畜群可以就數(shù)個不同的性狀得出高度可信的基因組數(shù)據(jù)，這些性狀包括：
健康性狀 類型性狀
• 純價(jià)值 • 最終得分（PTAT） • 乳房裂縫
• 女兒 • 肢/蹄 • 乳房深度
• 受孕率 • 綜合 • 前乳頭分布
• 繁殖期（月份） • 乳房綜合 • 后乳頭分布
• 體細(xì)胞評分 • 體高 • 乳頭長度
產(chǎn)量性狀 • 強(qiáng)壯度 • 總性能指數(shù)（TPI）
• 牛奶 • 體高
• 脂肪（磅） • 產(chǎn)乳形態(tài)
• 脂肪（%） • 尻角度
• 蛋白質(zhì)（磅） • 髖寬度
• 蛋白質(zhì)（%） • 后腿側(cè)視圖
產(chǎn)犢性狀 • 后腿后視圖
• 女兒妊娠率 • 蹄角度
• 女兒易產(chǎn)性 • 肢蹄得分
• 女兒死胎率 • 前房附著
• 后房高度
豬的基因組學(xué)解決方案
GeneSeek 的豬基因組學(xué)解決方案為窺探豬的遺傳結(jié)構(gòu)打開了一個重要的窗口，包括是否易感染治療昂貴的疾病以及繁殖中對想要性狀的鎖定。
GeneSeek豬全基因組低密度微珠芯片
該微珠芯片提供約 10,000個 SNP，包括經(jīng)常使用的 USDA血統(tǒng)和身份 SNP、用于識別品種的 SNP以及和結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性相關(guān)的 SNP。其它性狀標(biāo)記包括：
• 應(yīng)激綜合癥基因（HAL） • 紅細(xì)胞生成素受體—和 子宮容量以及
• 酸肉基因（RN）* 同胎生仔數(shù)相關(guān)
• 大腸桿菌腹瀉抗性基因（F4 ab/ac）* • 與生長和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)的 6 個特定
• PRRS抵抗性/耐受性 SNP：采食量/飼料轉(zhuǎn)化率/增重/瘦肉
• 雌激素受體基因（ESR）*：對大白豬或長白 率/脂肪含量和肉質(zhì)。
豬的產(chǎn)仔數(shù)性狀有較大影響 基因:MC4R、HMGA、CCKAR、CAST、PRKAG
*這些選配的、需要許可證的試驗(yàn)需要額外的檢測費(fèi)
豬SNP60微珠芯片
這一微珠芯片包括 64,000多個SNP，遍布豬的整個基因組，可以高效率且高通量檢測。
SeekGain性能標(biāo)記：GeneSeek的豬生產(chǎn)性狀測試程序
GeneSeek提供經(jīng)過驗(yàn)證的豬生產(chǎn)性狀 DNA 標(biāo)記測試，使用的是來自七個獨(dú)特基因的信息，這
些基因的影響范圍如下：
• 攝食量和飼料轉(zhuǎn)化率 • 同胎生仔數(shù)
• 增重 （雌激素受體）
• 精肉增長 • 同胎生仔數(shù)
• 脂肪含量 （紅細(xì)胞生成素）
• 肉質(zhì)
額外試驗(yàn)
GeneSeek還為豬提供眾多基因和疾病診斷法，包括：
• 應(yīng)激綜合癥基因（PSS）
• 豬繁殖與呼吸綜合征病毒（PRRSV）和豬圓環(huán)病毒 2 型（PCV2）
• SeekSire血統(tǒng)測試
• SeekTrace 來源驗(yàn)證程序
• 大腸桿菌 F4ab/ac 遺傳測試
綿羊的基因組學(xué)解決方案
綿羊的基因組學(xué)測試可以提醒生產(chǎn)商注意一些問題，而如果不進(jìn)行測試的話，很可能再過幾年他們才能發(fā)現(xiàn)這些問題。也可用它來為畜群的繁殖做出正確的決定。GeneSeek的綿羊基因組學(xué)測試解決方案包括：
• 全基因組選擇
• 確定遺傳優(yōu)勢
• 識別數(shù)量性狀基因座（QTL）
• 比較遺傳學(xué)研究
可用的Illumina基因分型試驗(yàn)
• 綿羊SNP50微珠芯片—54,000多個大信息量的 SNP標(biāo)記
• 山羊 SNP50 微珠芯片—53,000多個 SNP標(biāo)記
• 還有定制的微珠芯片
綿羊遺傳試驗(yàn)
• 綿羊進(jìn)行性肺炎病毒 • 羊蜘蛛腿綜合征
（OPPV）易感性 • 肌生成抑制蛋白
• 癢病易感性 • SNP 譜系
馬和狗的基因組學(xué)解決方案
這些遺傳檢測可以確定馬或狗是否具有想要的繁育特性，另外，如果對馬或者狗的血統(tǒng)有所懷疑的時(shí)候，經(jīng)過這樣的檢測證明它們的血統(tǒng)。
• 馬 SNP70微珠芯片—70,000 個大信息量的 SNP標(biāo)記
• 狗 HD微珠芯片—170,000 多個 SNP 標(biāo)記
• 血統(tǒng)驗(yàn)證—公畜確認(rèn)
針對研發(fā)的基因組學(xué)解決方案
GeneSeek為研發(fā)提供眾多基因組學(xué)解決方案，從小鼠到植物基因分型。
小鼠通用基因分型試驗(yàn)
MEGA小鼠通用基因分型試驗(yàn)（MUGA）提供 76,000 個根據(jù)Illumina Infinium 平臺建立的SNP標(biāo)記。
這些SNP 標(biāo)記分布于整個小鼠基因組。為了讓這些基因分型結(jié)果能夠得到最高效的應(yīng)用，實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)讓每一個被測試的SNP都獨(dú)立的提供了最大量的標(biāo)記信息。
Mega MUGA的設(shè)計(jì)標(biāo)準(zhǔn)優(yōu)化了雜合子區(qū)域的檢測以及純合子區(qū)域內(nèi)單倍型之間的區(qū)分。該實(shí)驗(yàn)的等位基因頻率和單倍型是從八個實(shí)驗(yàn)室小鼠品系得出的，這些品系是基因交互協(xié)作的基礎(chǔ)。
定制基因分型微珠芯片
有了這些微珠芯片，便可查詢幾乎任何物種的任何SNP。Infinium微珠芯片化學(xué)技術(shù)的高度重復(fù)性和靈活性，是定制研究的理想選擇。
植物基因分型
GeneSeek可為任何規(guī)模的定制項(xiàng)目提供基因分型服務(wù)：種子質(zhì)量控制、轉(zhuǎn)基因分析、全基因組掃描或標(biāo)記輔助選擇。
GeneSeek持續(xù)開發(fā)新方法和系統(tǒng)，用于從各類型植物中進(jìn)行樣本收集、儲存、DNA提取和基因分型。從一個很小的葉片中，GeneSeek就能夠使用專用的分子應(yīng)用技術(shù)來分析感興趣的目標(biāo)。
定制基因分型解決方案：標(biāo)記輔助選擇（MAS）和管理（MAM）
GeneSeek 也提供強(qiáng)大而精確的質(zhì)譜法用于SNP分型。GeneSeek 用靈活的可定制方案來提供常規(guī)基因分型服務(wù)（從 1 個到1,000 個SNP），幫助一些項(xiàng)目使用遺傳信息來進(jìn)行選擇和繁育，這之中沒有樣本數(shù)目的限制。不管樣本必須每天、每周還是每月進(jìn)行基因分型，GeneSeek都可以提供靈活的周期和可用于任何應(yīng)用的數(shù)據(jù)質(zhì)量。
GeneSeek MAS項(xiàng)目的關(guān)鍵特性包括：
• 以質(zhì)譜分析法為基礎(chǔ)的檢測系統(tǒng)可提供靈敏、準(zhǔn)確且快速的分析。
• 便于使用的多重試驗(yàn)設(shè)計(jì)以及優(yōu)化軟件節(jié)省研究時(shí)間，并將效率最大化。
