花菁類染料-美國(guó)Lumiprobe
花菁這類染料的分子內(nèi)部含有由甲川基(CH)n組成的共軛鏈,n可為奇數(shù)或偶數(shù)。共軛鏈兩端或鏈中間連有雜環(huán)、芳環(huán)化合物、環(huán)烯化合物等與共軛鏈組成一個(gè)大的共軛體系,分子內(nèi)部的氫可被一定數(shù)目的各類取代基取代。
已經(jīng)有許多的花菁染料(Cyanine dyes)用于生命科學(xué)領(lǐng)域,一系列的噻唑和惡唑染料用作DNA 和蛋白質(zhì)染色(如TOTO,YOYO, Stains All和其它)。但是在生命科學(xué)研究領(lǐng)域最受歡迎的花菁染料是由卡內(nèi)基梅隆大學(xué)的Alan Waggoner和他的同事們?cè)?990年代早期發(fā)現(xiàn)的。該花菁染料是經(jīng)過修飾后的吲哚菁綠(ICG),從1970年代以來該染料一直用于血管造影術(shù),而且他們都包含兩個(gè)假吲哚環(huán)側(cè)翼(CH)n鏈。發(fā)現(xiàn)此類染料對(duì)生物分子表現(xiàn)出較低的非特異性結(jié)合, 由于巨大的消光系數(shù)能發(fā)出明亮的熒光和良好的量子產(chǎn)量。一旦獲得專利, 在卡內(nèi)基梅隆專利過期后這些分子可在公共領(lǐng)域獲得,并從Lumiprobe可購(gòu)買到, 作為各種反應(yīng)衍生物用于科研和商業(yè),比如用于點(diǎn)擊化學(xué)的NHS酯、馬來酰亞胺、疊氮化物的衍生品和其他衍生物。
花菁染料分為兩種:非磺化的花菁染料和磺化的花菁染料,對(duì)于許多的應(yīng)用,他們是可以互相替換的,因?yàn)樗麄兊墓庾V屬性幾乎相同;腔头腔腔玖峡捎糜贒NA和蛋白質(zhì)等生物分子的標(biāo)記。兩種染料的區(qū)別在于它們的溶解度:磺基染料是水溶性,他們可在水環(huán)境中標(biāo)記無(wú)需添加有機(jī)助溶劑,他們?cè)谒锏姆稚⑿暂^好。在某些情況下,你可能會(huì)只需要這兩種染料中的一種(下面將具體講述非磺化的花菁染料和磺化的花菁染料的具體區(qū)別。)
非磺化的花菁染料
非磺化的花菁染料的熒光性質(zhì)對(duì)溶劑和反應(yīng)環(huán)境的依賴性較小,非磺化的的花菁染料的吸光度和熒光光譜繪制如下。
磺化的花菁染料
磺化的花菁染料包含了額外地磺基官能團(tuán)能促進(jìn)染料分子在水相中的溶解度,帶電荷的磺酸鹽降低了染料分子的聚合度且能很好地標(biāo)記偶聯(lián)物。
目前可用的磺化花菁染料包括sulfo-Cy3,sulfo-Cy5和sulfo-Cy7。
磺化花菁染料具有高度水溶性。標(biāo)記生物分子時(shí)不需要有機(jī)助溶劑輔助。
磺化和非磺化花菁染料之間的異同
磺化和非磺化花菁染料都展現(xiàn)出非常相似的熒光性能。然而,在使用說明上有幾個(gè)不同點(diǎn)需要注意,非磺化花菁染料必須要先溶解在有機(jī)助溶劑中(DMF or DMSO),之后在適當(dāng)?shù)乃芫彌_劑作用下加入靶標(biāo)生物分子溶液。推薦使用的助溶劑的體積為,溶解Cy3, Cy5, Cy7使用10%助溶劑,.5的染料使用15%的助溶劑。而磺化的花菁染料可以在純粹的水環(huán)境中應(yīng)用。關(guān)于花菁染料在純化方面的差異:當(dāng)使用與水或水溶緩沖溶液相關(guān)的透析純化染料時(shí),必須使用sulfo-Cy以實(shí)現(xiàn)高效除去未反應(yīng)的染料材料。與磺化和非磺化花菁染料的反應(yīng)可以通過凝膠過濾,色譜法 (FPLC,高效液相色譜法,離子交換法),或電泳純化。
磺化和非磺化花菁染料在標(biāo)記以下類別目標(biāo)時(shí)是可互換的:
1.可溶性蛋白,其對(duì)額外添加的有機(jī)助溶劑具有耐受性
2.抗體(使用5 - 10% DMSO / DMF)
3.DNA和寡核苷酸
4.肽
5.許多小分子
注:用類似磺化和非磺化的試劑標(biāo)記的共軛物(例如:sulfo-Cy5 和Cy5)的熒光性質(zhì)是非常相似的,可用于各種熒光儀器。
以下情況必須選用磺化花菁染料:
1.遇DMF 或 DMSO變性的敏感蛋白質(zhì)
2.通過透析純化的蛋白質(zhì)偶聯(lián)物
3.在水溶液中有納米粒子
4.不溶于水或疏水的蛋白
以下情況必須選用非磺化花菁染料:
在有機(jī)相中發(fā)生的反應(yīng)(二氯甲烷,腈化甲烷)
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