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國自然之四-如何評估創(chuàng)新性及研究內(nèi)容的科學(xué)性

瀏覽次數(shù):1815 發(fā)布日期:2016-12-6  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

上回我們說到,臨床基礎(chǔ)研究課題,設(shè)計(jì)的第一步就要考慮,所研究臨床問題需要用的細(xì)胞模型和檢測指標(biāo)?紤]3個(gè)問題,1、誰。2、怎么與正常不同(病理改變-檢測指標(biāo))。3、我能做嗎(可行性)。除了第3個(gè)點(diǎn)外,前面兩個(gè)是課題設(shè)計(jì)科學(xué)性評估的地方。留下了一個(gè)問題,細(xì)胞模型和檢測指標(biāo)到底怎么評估。今天我們就來說道說道這個(gè)事情。跟課題創(chuàng)新性評估一起。

先說細(xì)胞模型和檢測指標(biāo)。

每年幫一些老師指導(dǎo)課題,除了課題設(shè)計(jì)要拿過來外,季博還有一個(gè)要求,設(shè)計(jì)中用到的細(xì)胞模型和檢測指標(biāo),近兩年的高分參考文獻(xiàn)拿過來。為啥是近兩年呢,再早的話,擔(dān)心所用細(xì)胞和檢測方法已經(jīng)過時(shí)了。所以,這里的評估,一是看,檢測方法是否過時(shí)(標(biāo)書評估中,檢測方法新穎性的地方)。比如RNA干擾這個(gè)技術(shù),如果設(shè)計(jì)中還是在用化學(xué)合成的在做,那就有點(diǎn)不妥了。二是看,細(xì)胞模型是否受高分雜志認(rèn)可,其實(shí)核心問題是,這個(gè)細(xì)胞株對于研究這個(gè)問題是否合適,我們自己說了不算,得高分reviewer認(rèn)可。

高分到什么情況呢,CNS級別是最好,至少5分以上。如果5分以上,近兩年的沒有,那我們要考慮一個(gè)問題了,“這個(gè)臨床問題的研究重要嗎?”。答案兩種,一是,不重要。因?yàn)槎紱]有高分文章去研究了。另一個(gè)是,很重要,但技術(shù)難度很大。這時(shí),我們就需要考慮我的項(xiàng)目組有能力去hold住這個(gè)課題嗎。就如去年5月份,季博在“機(jī)制上的哪些事兒”中介紹splicing的時(shí)候說,當(dāng)年差點(diǎn)火起來,但由于技術(shù)有難度,沒火得起來。結(jié)果,8月份nature上就狂發(fā)splicing相關(guān)的文章了。因?yàn)榧夹g(shù)難度解決了。這里是評估可行性的地方。

細(xì)胞模型和檢測指標(biāo)的評估,看這個(gè)臨床問題的研究中,高分文章用的什么,我們也一樣用。因?yàn)槲覀兊膭?chuàng)新不在細(xì)胞模型和檢測指標(biāo)。如果這里用高分文章沒有用過的新細(xì)胞模型或新檢測指標(biāo),很可能reviewer會(huì)認(rèn)為模型和檢測指標(biāo)可行性或科學(xué)性不足,數(shù)據(jù)不可信。

創(chuàng)新性評估。

下面就聊聊最重要的創(chuàng)新性。這里討論的創(chuàng)新性是基因的創(chuàng)新性,創(chuàng)新性有哪些,不了解的可翻看前文“國自然基金中的創(chuàng)新性到底指啥”。創(chuàng)新性評估,一定是有和無。不是少,或極少。

用“gene and disease”到pubmed中查詢,看看是否有文章。如果沒有文章,那創(chuàng)新性是OK的。單獨(dú)用gene名再查查,看看在其他疾病或領(lǐng)域的研究情況,這里目的是看看這個(gè)gene現(xiàn)有的研究中跟什么可能的細(xì)分方向相關(guān)。比如我做肺癌研究,基因A,在肺癌中沒有發(fā)過文章。肺癌中的創(chuàng)新性O(shè)K。查詢發(fā)現(xiàn),在肺纖維化中有人做過,可以調(diào)控自噬。OK,在我的課題中,機(jī)制細(xì)分方向可以看看自噬。我的課題假設(shè)就是“基因A通過調(diào)控自噬在肺癌中發(fā)揮D功能”。

如果pubmed查詢下來,有文章。咋辦呢。看下這些發(fā)表的文章,做了什么工作。比如做心梗研究,基因A與心梗到pubmed查,有5篇文章。把這些文章看看,如果這些文章都是研究基因A在心肌細(xì)胞中發(fā)揮D功能參與到心梗。OK,看下我自己的預(yù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),細(xì)胞模型是心肌細(xì)胞還是血管內(nèi)皮細(xì)胞。如果是心肌細(xì)胞,那么就需要重新思考創(chuàng)新性了。如果是血管內(nèi)皮細(xì)胞,而心梗中心血管再生方向沒有人做過。我的課題假設(shè)是“基因A通過B機(jī)制在心梗中發(fā)揮促新血管再生”,這個(gè)創(chuàng)新性是OK的。疾病相關(guān)的病理細(xì)胞,不同的病理細(xì)胞就是不同的研究方向。

最后說個(gè)實(shí)際做實(shí)驗(yàn)的事情,比如假設(shè),有一個(gè)基因,在乳腺癌中做了,肺癌做了,胃癌做了,跟自噬是相關(guān)的,都發(fā)了很好的文章。兩三年過去了,肝癌中一直沒有文章報(bào)道。OK,這個(gè)基因,我到肝癌中去做做,可以嗎。如果您手上正好有樣品,那么先合成QPCR引物,或者買個(gè)抗體做組化,檢測一下臨床相關(guān)性看看。如果經(jīng)費(fèi)多,那就構(gòu)建RNA干擾慢病毒,先做一個(gè)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)看看。因?yàn)椋绻@個(gè)基因真的很好,做肝癌研究的人不會(huì)看不到。一般情況下,不是別人沒有看到,而是也看到了,去做了,是陰性結(jié)果。腫瘤異質(zhì)性是非常強(qiáng)的,即使相同的腫瘤,不同病人的發(fā)病原因都可能不同。甚至同一個(gè)病人的瘤體中,不同腫瘤細(xì)胞的惡性原因都可能不同,這就是腫瘤容易耐藥復(fù)發(fā)的根源。如果您經(jīng)費(fèi)多,別人發(fā)的是十分以上,嘗試做做撞撞運(yùn)氣是OK的。

如果您要找季博評估課題,記得把pubmed查詢結(jié)果及細(xì)胞模型和檢測指標(biāo)的參考文獻(xiàn)一起拿來。如果您自己評估下來發(fā)現(xiàn)有問題,不用著急,來找季博,我們可以一起幫您分析,尋找解決方案。這個(gè)課題可以不做,但這個(gè)臨床問題的研究,我們需要繼續(xù)前行。

PS:希望和季博在學(xué)習(xí)、實(shí)驗(yàn)上有更多交流的朋友們,可以關(guān)注吉?jiǎng)P基因微信并回復(fù)“季博”兩個(gè)字。


長按加關(guān)注


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