miRNA的芯片及定量PCR數(shù)據(jù)應(yīng)用于診斷超急性期腦梗死的新穎標(biāo)志物循環(huán)血miR-16

全世界范圍內(nèi)，卒中嚴(yán)重降低其患病者的生存質(zhì)量。而缺血性卒中占整個(gè)卒中的70-85%�？焖僭\斷對超急性期腦梗死的臨床決策非常重要。人們逐漸把尋找生物標(biāo)志物的方向投向循環(huán)血的miRNA。但腦梗死病因復(fù)雜，分類繁多，使尋找特異性和敏感性高的循環(huán)血miRNA標(biāo)志物困難重重。本研究使用miRNA的芯片及定量PCR數(shù)據(jù)來判定miRNA對超急性期腦梗死（HACI）的診斷價(jià)值，以TOAST及OCSP分型來探討血漿的miRNA與腦梗死分型的關(guān)系，以MRS評分來摸索血漿的miRNA與腦梗死預(yù)后的關(guān)系。

1、 HACI與健康對照組（HVT）之間的芯片差異譜

以改變倍數(shù)大于2，p小于0.05的miRNA作為差異基因。11個(gè)miRNA是上調(diào)的 (miR-140,miR-106b,miR-130a,miR-16,miR-223,miR-93,miR-484,miR-25,miR-130b ,miR-107,andmiR-151)，一個(gè)miRNA是下調(diào)的(miR-4454)。在芯片的聚類熱圖中本研究選送的4個(gè)對照標(biāo)本自動(dòng)聚攏為一個(gè)組，說明選送標(biāo)本代表性良好。該研究中Agilent Human miRNA (8_60K) V19.0 array服務(wù)由伯豪生物提供。

2、以定量PCR驗(yàn)證芯片差異表達(dá)譜

研究者從芯片差異表達(dá)譜的12個(gè)miRNA中挑選標(biāo)準(zhǔn)化信號值較高的7個(gè)進(jìn)行定量PCR驗(yàn)證。7個(gè)miRNA在定量PCR中的變化趨勢有6個(gè)與芯片變化趨勢相同，一個(gè)與芯片相反，說明二者較好的一致性。比較7個(gè)miRNA的定量PCR結(jié)果僅miR-16有統(tǒng)計(jì)差異。

3、基于miR-16的預(yù)測靶基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析

差異最顯著的GO類別（生物學(xué)進(jìn)程）主要包括細(xì)胞分化，細(xì)胞死亡，發(fā)育過程，凋亡，細(xì)胞增殖，細(xì)胞周期等。KEGG類別包含的主要經(jīng)典信號通路有：p53，T細(xì)胞受體，ErbB，Toll-樣受體(TLR)，NOD-樣受體，MAPK。

4、miR-16診斷HACI的靈敏度和特異度

本研究以ROC曲線來判斷miR-16診斷HACI整體 的準(zhǔn)確性。曲線下面積 (AUC)是0.775(95%CI 0.653±0.897，P=0.001)。當(dāng)miR-16的表達(dá)水平在最佳截?cái)帱c(diǎn)處(1.8333)，其靈敏度和特異度分別是 69.7%和87%。以大動(dòng)脈粥樣硬化型（LAAS）腦梗死來繪制ROC曲線，AUC是0.952(95%CI 0.879±1.024)，其靈敏度和特異度分別是 100%和91.3%。以完全前循環(huán)型腦梗死（TACI）來繪制ROC曲線，AUC是0.978(95%CI 0.925±1.031)，其靈敏度和特異度分別是 100%和91.3%。以部分前循環(huán)型腦梗死（PACI）來繪制ROC曲線，AUC是0.795(95%CI 0.642±0.948)，其靈敏度和特異度分別是 70.6%和87%。

5、血漿miR-16與HACI分型相關(guān)

本研究發(fā)現(xiàn) LAAS型腦梗死患者的血漿miR-16表達(dá)水平比對照組顯著增高，TACI型和PACI型腦梗死患者的血漿miR-16表達(dá)水平也比對照組顯著增高。其余TOAST分型和OCSP分型的腦梗死患者的血漿miR-16表達(dá)水平與對照組無明顯差別。

6、血漿miR-16與HACI預(yù)后相關(guān)

研究者按MRS評分將HACI患者分為預(yù)后良好組（mRS=0-2）和預(yù)后不佳組（mRS=3-6）。預(yù)后不佳組的血漿miR-16水平比預(yù)后良好組明顯增高。

本研究第一次通過臨床證據(jù)證明循環(huán)血miR-16可以作為HACI的生物標(biāo)志物。血漿miR-16診斷HACI靈敏度、特異度高。生物信息學(xué)分析顯示miR-16調(diào)節(jié)的靶基因與HACI后的眾多生物學(xué)進(jìn)程和信號通路相關(guān)。血漿miR-16濃度與HACI的TOAST分型相關(guān)，與OCSP分型相關(guān)，且與其預(yù)后相關(guān)。本研究對血漿miR-16與HACI的關(guān)系提供了令人著迷的新觀點(diǎn)，為HACI進(jìn)一步的機(jī)制研究提供了新的思路。

原文出處：Tian C, Li Z, Yang Z, Huang Q, Liu J, Hong B. Plasma MicroRNA-16 Is a Biomarker for Diagnosis, Stratification, and Prognosis of Hyperacute Cerebral Infarction. PLoS One. 2016;11(11):e0166688.