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手把手教你如何發(fā)一篇Hepatology

瀏覽次數(shù):1812 發(fā)布日期:2017-3-8  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

廣大臨床醫(yī)生朋友們,是否還在熬夜看文獻(xiàn)寫標(biāo)書頭疼不已?Dr.S的臨床醫(yī)生如何發(fā)表高分SCI文章系列又來了,上期咱們說了肺癌(想看點(diǎn)我),今天咱們繼續(xù)從肝癌說起,來分析一篇Hepatology(11.7分)的文章,該期刊是消化領(lǐng)域的老牌雜志,權(quán)威性和影響力相當(dāng)?shù)母摺?/SPAN>

廢話不多說,我們先解讀一下題目:The microtubule-associated protein PRC1 promotes early recurrence of hepatocellular carcinoma in association with the Wnt/β-catenin signalling pathway

非常經(jīng)典的:A基因通過B信號(hào)通路在C疾病中發(fā)揮D功能寫法,建議廣大的醫(yī)生朋友但凡研究基因功能寫標(biāo)書或?qū)懳恼碌亩急M量按照這個(gè)寫法,思路清晰,涵蓋文章的所有要點(diǎn)。

作者不知道哪里找到這么個(gè)基因PRC1,發(fā)現(xiàn)這個(gè)基因的mRNA和蛋白表達(dá)水平在癌旁組織,原位灶和復(fù)發(fā)灶中逐漸上升,還和患者預(yù)后生存期相關(guān),同時(shí)用了TCGA數(shù)據(jù)庫來輔助證明,證據(jù)很扎實(shí)。(Dr.S小貼士:很多朋友寫文章的時(shí)候以為一定要把自己做了什么樣的篩選找到這個(gè)基因的過程寫出來,怕審稿人問基因怎么來的,其實(shí)根本不用擔(dān)心,基因怎么找到的不是很重要,重要的是基因要有臨床相關(guān)性和功能)

既然基因和肝癌的復(fù)發(fā)如此相關(guān),是否有功能呢,下面閉著眼睛也能知道作者要用細(xì)胞和動(dòng)物模型驗(yàn)證基因功能了,發(fā)現(xiàn)確實(shí)把基因敲減了以后細(xì)胞也不增值不侵襲轉(zhuǎn)移了,皮下瘤也不長了,漂亮的數(shù)據(jù)。(Dr.S小貼士:如果你做了很多種類似的細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的話細(xì)胞系用兩株就ok了,如果你做的細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)類型不多的話可以考慮多做幾株細(xì)胞)。

臨床相關(guān)性和體內(nèi)外功能都驗(yàn)證了,下面該做什么了?要沖10分的文章肯定要做深入機(jī)制研究嘛。作者發(fā)現(xiàn)PRC1啟動(dòng)子區(qū)域有TCF4結(jié)合位點(diǎn)因此可能受WNT通路影響,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí)了作者的猜想,而且PRC1基因還能夠和Axin1/APC/GSK3B形成蛋白復(fù)合物,參與調(diào)控WNT通路下游靶基因。形成了一個(gè)反饋負(fù)反饋調(diào)控通路。

好了,又一個(gè)漂亮的故事誕生了,WNT3a通過結(jié)合細(xì)胞外受體激活WNT通路,導(dǎo)致PRC1的表達(dá)量上升,而過量的PRC1又通過抑制APC復(fù)合物的形成保護(hù)B-catenin不被降解,從而導(dǎo)致了WNT通路下游的靶向癌基因(包括PRC1自己)都被激活形成一個(gè)惡性循環(huán),最終導(dǎo)致了肝癌的發(fā)生同時(shí)促進(jìn)肝癌的復(fù)發(fā)。

Dr.S解讀:

1. 要發(fā)Hepatology,首先你得要有一個(gè)具有臨床相關(guān)性,而且有功能的基因,這個(gè)基因在所研究的疾病中沒報(bào)道過功能。

2. 要想沖10分以上的文章,機(jī)制部分可以往上游扯一扯再往下游扯一扯,一定要解釋到目的基因能和哪些蛋白結(jié)合形成復(fù)合物,或者目的基因的啟動(dòng)子區(qū)域哪些堿基受到了上游蛋白的調(diào)控,直接互作機(jī)制最好了。

3. 機(jī)制部分最好找明星基因或者通路,這樣比較容易把功能回復(fù)實(shí)驗(yàn)做出來,因?yàn)橄掠位虻墓δ芸隙ㄊ呛軓?qiáng)的。

4.發(fā)高分文章可以多用幾株細(xì)胞來驗(yàn)證功能(人海戰(zhàn)術(shù)很多時(shí)候是很有效的),做機(jī)制的話可以只用一株細(xì)胞。

根據(jù)吉?jiǎng)P基因的經(jīng)驗(yàn),從樣本出發(fā)通過芯片、測序、質(zhì)譜等高通量方法篩選到的候選基因會(huì)很多,但從中再得到有功能的新基因的概率大約只有10%,因此想要篩選驗(yàn)證得到一個(gè)新功能基因的難度非常大。吉?jiǎng)P基因歷經(jīng)3年,斥資上億,已完成近6000個(gè)腫瘤相關(guān)基因的功能學(xué)篩選,已從中找到明確的腫瘤功能標(biāo)志基因若干,等待您來尋寶~~~

長按加關(guān)注


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