illumina測序新品NextSeq1000與NextSeq2000性能的預(yù)測

大家好，正床上躺著看《慶余年》的我收到了宇哥發(fā)來的微信，才想起來今天竟到了illumina新品發(fā)布會的日子，看著手機(jī)上的產(chǎn)品宣傳圖片我不由的想起來家里的加濕器，還是自帶小夜燈和觸控屏幕的空氣加濕器（只不過這加濕器有點(diǎn)貴啊，21萬美刀^起）。
 

圖片來源于illumina中國官網(wǎng)

接下來我們來簡單介紹一下illumina的新產(chǎn)品—NextSeq1000與NextSeq2000，我粗略的看了下illumina官網(wǎng)上新產(chǎn)品的宣傳彩頁，頓感些許失落，但是誰知后面會不會也難逃“真香”定律呢？

前幾天我寫了一篇《2020 illumina新品發(fā)布預(yù)測》的文章，帶著“必然蒙對”的傲嬌對號入座的瞄了一下我當(dāng)時(shí)的預(yù)測，嗯！就是這個(gè)。

在我當(dāng)時(shí)的新品預(yù)測中，其中一個(gè)預(yù)測是illumina可能會發(fā)布一款介于NextSeq系列和Novaseq6000之間的機(jī)型，以補(bǔ)充兩機(jī)型之間的“產(chǎn)品斷崖”，該機(jī)器的數(shù)據(jù)產(chǎn)量可以相當(dāng)于Novaseq的SP芯片（800M Reads，PE150，240Gb/Flowcell），而測序試劑的價(jià)格將介于NextSeq High-Output芯片（$40/Gb）和Novaseq SP芯片($18/Gb)之間。我當(dāng)時(shí)預(yù)測的這款機(jī)器的主要目標(biāo)客戶群體是以北美地區(qū)的Hiseq系列或者Nextseq系列使用者為主，之所以如此判斷，原因有二：

第一,是我預(yù)測illumina2019年在中國市場幾乎是零增長，業(yè)績將基本與2018年持平（2018年illumina大中華區(qū)營收為3.65億美金，占總營收的11%），造成這份態(tài)勢，華大智造MGISEQ-2000測序系統(tǒng)優(yōu)秀的市場表現(xiàn)“功不可沒”，如果illumina發(fā)布介于NextSeq和Novaseq之間的機(jī)型，那么該機(jī)器的主要性能參數(shù)將與華大智造的MGISEQ-2000接近，所以我不認(rèn)為illumina推出這類機(jī)型會對中國市場的客戶有太大的吸引力，自然中國市場（甚至是亞太市場）也不會是其主要目標(biāo)客戶群體（起碼短時(shí)間內(nèi)不是） 

第二，北美才是illumina的大本營（第一大市場，2018年illumina美國市場營收為17.73億美元，占總營收的53%），所以這次韭菜還是要回家割，業(yè)績增長的壓力還是要靠家里人來一起“扛”的。北美地區(qū)還有大量的Hiseq2500和Hiseq4000等老舊機(jī)型在服役，這些機(jī)型開機(jī)成本較高、運(yùn)行速度較慢、通量較大，而Nextseq系列的單位數(shù)據(jù)成本又太高、數(shù)據(jù)產(chǎn)量上也無法滿足后續(xù)單細(xì)胞測序、基于液體活檢的Pan-Cancer等應(yīng)用的檢測需求，所以一款“中間機(jī)型”的需求應(yīng)運(yùn)而生。但這讓我想到了美國的智能手機(jī)市場，用戶的選擇真是少到可憐啊，不是蘋果就是三星，最多加個(gè)LG，哪有我們幸福... ...另外美國這么多CLIA實(shí)驗(yàn)室，這RUO版本的機(jī)型也是可以拿過來直接用的。

另外，剛看到Genomeweb的推文，Roche與illumina將基于NextSeq550Dx測序平臺合作開發(fā)體外診斷試劑盒，而且illumina宣布即將推出NovaseqDx，所以如我預(yù)測，NovaseqDx即將來臨，后續(xù)將聯(lián)合DRAGEN Bio-IT在Pan-Cancer（ctDNA）、cWES和cWGS應(yīng)用中擔(dān)當(dāng)重任。

好的，上面啰嗦這么多，總結(jié)成一句就是想說明咱這預(yù)測不是胡扯，那么接下來咱們簡單看一下本次發(fā)布的新品具體的參數(shù)。

首先我們來看一下尺寸大小

NextSeq550的長寬高為 63.5cm×53.3cm×58.4cm，毛重為151.5kg。

Nextseq2000的長寬高為65cm×60cm×60cm，重量為141kg。

從體型上來看，這個(gè)小夜燈加濕器與Nextseq550是基本一樣的。

接下來我們再來看一下四款儀器的性能參數(shù)對比表

 最后我們還說一下NextSeq1000/2000有哪些創(chuàng)新的地方？

 但因?yàn)槟壳爱a(chǎn)品細(xì)節(jié)公開的還是太少（宣傳75項(xiàng)創(chuàng)新�。�，并且下面的內(nèi)容，宣傳彩頁上都是現(xiàn)成的，所以我還是長話短說為大家做簡單歸納：

第一，NextSeq1000/2000測序系統(tǒng)直接搭載了DRAGEN Bio-IT FPGA Secondary analysis，簡單來說就是分析加速系統(tǒng)。可以用來大大加快變異檢測的分析速度。

第二，簡化的上機(jī)操作流程，將廢液桶和測序試劑卡槽集成在一起，待loading的文庫也加入試劑卡槽，測序芯片插入試劑卡槽，再將測序試劑盒插入測序儀，搞定！

第三，可以在云端對本次測序的運(yùn)行模式進(jìn)行設(shè)定（例如讀長、Barcode等測序參數(shù)）。
 

這樣看下來這機(jī)器有點(diǎn)AIOT的意思啦，好了，今天就到這里，后續(xù)獲得更多新品細(xì)節(jié)后再與大家交流學(xué)習(xí)。

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