寶予德HF extract高通量組織研磨儀在樣本研磨上的應(yīng)用

早在2019年12月之前，新冠病毒可能已經(jīng)在人群“隱秘傳播”（cryptic spread）階段發(fā)生了一些關(guān)鍵突變。也就是說，這種新型病毒在人群中出現(xiàn)的時間可能比設(shè)想的更早，甚至不一定最早出現(xiàn)在武漢。

上述推測結(jié)論來自兩位病毒學(xué)專家：澳大利亞悉尼大學(xué)瑪麗·巴希爾傳染病和生物安全研究所的愛德華·霍爾姆斯（Edward C. Holmes）教授，以及中國疾控中心（CDC）傳染病預(yù)防控制所研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬上海市公共衛(wèi)生臨床中心兼職教授張永振。當?shù)貢r間3月26日，這兩位“老搭檔”聯(lián)合在頂級學(xué)術(shù)期刊《細胞》（CELL）上發(fā)表了一篇評論“A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2”
 

 

武漢華南海鮮市場的起源不確定性：幾年前探訪過市場

此前的觀察顯示，第一批報告的COVID-19病例和武漢的華南海鮮野生動物市場有關(guān)聯(lián)。值得一提的是，張永振、霍爾姆斯等人曾在2014年親身探訪過該市場，霍爾姆斯提供的一張照片顯示，當時該市場即出售野生動物。

圖片來源：該照片由Edward C. Holmes提供，拍攝于2014年10月，當時兩位作者一起參觀了市場。
他們在文章中提到，在此次疫情暴發(fā)的時候那里仍然可以買到多種哺乳動物。然而，由于并非所有的早期案例都與市場有關(guān)，新冠病毒出現(xiàn)的故事可能比最初推測的更為復(fù)雜。

中國疾控中心此前獲得了來自該市場“環(huán)境樣本”（比如物體表面）的基因組序列。系統(tǒng)發(fā)育分析表明，它們與從武漢最早的病人身上采集的病毒密切相關(guān)。

張永振等人表示，雖然這再次表明，華南海鮮市場在病毒出現(xiàn)中發(fā)揮了重要作用，但很難明確這些環(huán)境樣本中的病毒來自該市場的動物還是當時已在無意中傳播的人。“不幸的是，隨著市場的關(guān)閉，目前明顯缺乏直接的動物樣本，這可能意味著很難、甚至不可能準確地識別出任何動物宿主。”

環(huán)境樣本的含有復(fù)雜的有機質(zhì)、無機鹽等雜質(zhì)，需要用研磨珠對樣本進行處理，并且利用IRT 技術(shù)對樣本的有機物、無機鹽進行分離，才能保證樣本的正常擴增。

寶予德HF extract高通量組織研磨儀是針對現(xiàn)代實驗室應(yīng)用而設(shè)計生產(chǎn)的一款全面型應(yīng)用的研磨儀，它可對小量、大批次樣品，如植物、動物組織細胞以及小量固體樣品、環(huán)境樣本進行快速地干磨、濕磨及冷凍研磨。

環(huán)境樣本核酸提取前處理過程圖示：

經(jīng)研磨儀處理后的冠狀病毒檢測結(jié)果：

a:不經(jīng)研磨和IRT去抑制物處理擴增結(jié)果

b:研磨儀處理，經(jīng)過IRT去抑制物進行擴增結(jié)果

 
由上可見：環(huán)境樣本需要經(jīng)過HF extract高通量研磨儀處理后，經(jīng)過IRT技術(shù)沉淀雜質(zhì)，才能真正的檢測出結(jié)果，提高陽性率，避免漏檢。