Dharmacon文庫在RNAi文庫篩選的應(yīng)用

1.什么是文庫？

――大幅提高研究效率的利器

以往的實(shí)驗(yàn)室研究中，無論是尋找新基因的功能、探索已知基因致病的機(jī)制、解析復(fù)雜信號通路網(wǎng)絡(luò)、探索疾病發(fā)生發(fā)展的機(jī)制，藥物敏感性測試或者是尋找藥物開發(fā)的新靶點(diǎn)，科研工作者們往往是圍繞著潛在的單個目標(biāo)基因進(jìn)行改造，包括針對該基因的過表達(dá)、沉默、敲除、激活、修飾、突變等操作。這種研究方式雖然具有明確的目的性，但效率無法得以提升，且無法對抗研究方向判斷錯誤、或技術(shù)的不熟練、或操作步驟復(fù)雜進(jìn)而引起失誤帶來的風(fēng)險。同時，基因與基因之間具有協(xié)同作用等復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系，使得對單個基因的研究，往往無法獲得明確的實(shí)驗(yàn)結(jié)論，從而錯失了尋找基因新功能的發(fā)現(xiàn)。Dharmacon文庫提供了一種批量研究基因功能的工具，支持從全基因組庫、成藥性基因庫、藥靶基因庫、各基因家族庫、客戶定制基因庫以及單個基因?qū)用妫�研究基因與疾病、表型、分子機(jī)理對應(yīng)的關(guān)系。近年來隨著高端酶標(biāo)儀、高通量顯微鏡、自動化流式細(xì)胞儀、高內(nèi)涵等設(shè)備的普及和技術(shù)更新，批量的基因研究方法趨向于成熟，Dharmacon文庫在各個領(lǐng)域中得以廣泛應(yīng)用，相關(guān)研究成果被發(fā)表在上千篇高質(zhì)量的CNS 文獻(xiàn)中。

2.文庫的種類

作為研究工具，Dharmacon 在進(jìn)行產(chǎn)品開發(fā)的時候，充分考慮不同的研究領(lǐng)域、方法學(xué)、研究經(jīng)費(fèi)對產(chǎn)品的需求，提供多種形式和規(guī)格的產(chǎn)品，以期所有的科研工作者都有機(jī)會受惠于這項(xiàng)技術(shù)革新帶來的紅利，獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)和加速科研進(jìn)程。按照對基因改造的需求不同，Dharmacon 文庫分為：基因沉默文庫，基因編輯文庫，基因過表達(dá)文庫，miRNA文庫。本文主要介紹基因沉默文庫

3.基因沉默文庫的應(yīng)用案例
 

A――尋找新基因的功能

B――探索已知基因致病的機(jī)制

C――解析復(fù)雜信號通路網(wǎng)絡(luò)

D――尋找藥物開發(fā)的新靶點(diǎn)

E――探索疾病發(fā)生發(fā)展的機(jī)制

F――藥物敏感性測試

4.基因沉默文庫的種類

覆蓋基因研究的范圍（以下數(shù)據(jù)隨時更新）：全基因組、成藥性基因、藥靶基因、各基因家族、客戶定制基因組合（20個基因以上）
Genome、Cell Cycle Regulation、Cytokine Receptors、Deubiquitnating Enzymes、DNA Damage Response、Drug Targets、Druggable Genome、Epigenetis、GPCR、Ion Channels、Membrane Trafficking、Nuclear Receptors、Phosphatase、Proteases、Protein Kinase、Serine Proteases、Transcription Factors、Tyrosine Kinase、Ubiquitin Conjugation Subset #1、Ubiquitin Conjugation Subset #2、Ubiquitin Conjugation Subset #3、Lincode siRNA
針對siRNA基因文庫，我們可提供siGENOME、ON-TARGETplus、Accell以及Lincode siRNA四種文庫類型，應(yīng)用不同的修飾技術(shù)以滿足不同客戶的需求。選擇方法可參考下圖：


5. 基因沉默文庫的選擇

--shRNA慢病毒載體

覆蓋基因研究的范圍（以下數(shù)據(jù)隨時更新）：全基因組、成藥性基因、藥靶基因、各基因家族、客戶定制基因組合（20個基因以上）
Whole Genome、Angiogenesis、Apoptosis、Cell Cycle Regulation、De-ubiquitinating Enzymes、 DNA Damage Response 、Drug Targets、Druggable Genome、Epigenetics、GPCR、Ion Channel、Kinase、Membrane Trafficking、Nuclear Receptor、Phosphatase、Proteases、Protein Kinase、Rest of Genome、Transcription Factors、Ubiquitins、Ubiquitin Conjugation(subset 1/2/3)、Ubiquitin Ligase
針對shRNA基因文庫，我們可提供SMART Vector、GIPZ、TRIPZ以及經(jīng)典的TRC shRNA文庫類型，不同的啟動子和熒光標(biāo)記，優(yōu)化的載體結(jié)構(gòu)滿足您的不同需求。選擇方法參考下圖：



 

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