10x Genomics Visium空間分析實驗規(guī)劃資源必備指南
空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一種開創(chuàng)性的分子分析方法，使科學(xué)家能夠測定組織樣本中的基因活性，并繪制該活性發(fā)生的位置。10x Visium空間基因表達(dá)解決方案可在整個福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）或新鮮冷凍組織的形態(tài)學(xué)背景下定位全轉(zhuǎn)錄組，從空間上解析基因表達(dá)，從而獲得疾病病理和臨床轉(zhuǎn)化研究的新見解。
Visium空間基因表達(dá)玻片的核心是帶有空間條形碼、與mRNA結(jié)合的寡核苷酸。如需捕獲新鮮冷凍組織的基因表達(dá)信息，先處理樣品切片從組織中釋放出mRNA，使其與組織相應(yīng)位置附近的捕獲寡核苷酸相結(jié)合。在組織原位進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄，生成帶有空間條形碼并保留空間信息的cDNA文庫。如需捕獲福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）組織的基因表達(dá)信息，先對組織進(jìn)行透化處理，使其釋放出連接的探針對，與玻片上的捕獲探針相結(jié)合。延伸探針對，以生成帶有空間條形碼并保留空間信息的文庫。帶有條形碼的文庫可映射回捕獲區(qū)的特定數(shù)據(jù)點(diǎn)。隨后將這種基因表達(dá)數(shù)據(jù)與組織切片的高分辨率顯微鏡圖像相疊加，從而能夠以空間分辨的方式觀察組織形態(tài)背景下任一條mRNA或多條mRNA組合的表達(dá)。
Visium空間基因表達(dá)結(jié)合免疫熒光的流程能夠輕松融入標(biāo)準(zhǔn)的組織切片和IF染色方法中，且使用現(xiàn)有的抗體。在同一張組織切片上實現(xiàn)蛋白質(zhì)、總mRNA和組織學(xué)分析，最大限度地使用寶貴樣本。將全轉(zhuǎn)錄組空間分析與免疫熒光蛋白檢測相結(jié)合，可更全面地捕獲組織切片上的生物學(xué)圖像，從而增進(jìn)對人類健康和疾病的了解。
將Visium空間基因表達(dá)解決方案與易用且廣泛的靶向基因組合相結(jié)合，觀察基因表達(dá)的空間模式，全面靶向相關(guān)基因，聚焦最關(guān)鍵的基因，能助力您洞悉研究中最重要的生物學(xué)本質(zhì)。用預(yù)先設(shè)計好的癌癥、免疫學(xué)、神經(jīng)科學(xué)和基因標(biāo)簽組合結(jié)合新鮮冷凍組織的Visium空間基因表達(dá)檢測，來分析一組特定的轉(zhuǎn)錄本。您可以在我們?nèi)娴�、預(yù)先設(shè)計的基因組合中選擇一種，并自行添加多達(dá)200個定制基因，在測序前富集您的Visium空間文庫。
Visium空間分析實驗規(guī)劃資源必備指南可作為路線圖，幫助您設(shè)計Visium空間基因表達(dá)實驗，優(yōu)化實驗參數(shù)，并確定適當(dāng)?shù)挠嬎?分析工具來分析空間基因表達(dá)數(shù)據(jù)。
下載該指南，您可以了解以下內(nèi)容：
