生信分析：解鎖Venn圖畫法

Venn圖，又稱韋恩圖或文氏圖，韋恩圖用于展示在不同的事物群組(集合)之間的數(shù)學(xué)或邏輯聯(lián)系，尤其適合用來表示集合(或)類之間的“大致關(guān)系”，它也常常被用來幫助推導(dǎo)(或理解推導(dǎo)過程)關(guān)于集合運(yùn)算(或類運(yùn)算)的一些規(guī)律。是一種用于直觀表示元素集合重疊的一種圖形。接下來和大家分享一下韋恩圖的制作方法。

1.在線Venn圖的解鎖
（1）jvenn（http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html）
第一步：（界面）打開鏈接是這樣的。
 

第二步：（數(shù)據(jù)輸入）左側(cè)輸入數(shù)據(jù)，這里也可以導(dǎo)入文件，輸入文件為文本文檔。在輸入對(duì)應(yīng)組合名時(shí)，組合名不能超過11個(gè)字符。
 

第三步：（釋義與數(shù)據(jù)導(dǎo)出）在上圖紅框中輸入數(shù)據(jù)，即可得到兩個(gè)數(shù)據(jù)集的交集基因，如不需要柱狀圖，可通過將下圖紅框中設(shè)置為"NO"，同時(shí)通過點(diǎn)擊黃框中的英文即可得到圖像及相應(yīng)的文件。
 

（2）Draw Venn Diagram（http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/）

第一步：（界面）打開首頁(yè)是這樣的。
 

第二步：（數(shù)據(jù)輸入）左側(cè)輸入數(shù)據(jù)，這里既可以導(dǎo)入文件，也可以直接輸入組合的列表，如果輸入框不夠，可以點(diǎn)擊"Add"添加新的輸入框。右側(cè)可填寫對(duì)應(yīng)組合的名稱。
 

第三步：（數(shù)據(jù)導(dǎo)出）上傳數(shù)據(jù)，命名好組名并點(diǎn)擊"Submit"，即可得到結(jié)果。最后，就是下載結(jié)果。
 

在線Venn圖小結(jié)
jvenn和Draw Venn Diagram兩個(gè)Venn圖網(wǎng)站各有優(yōu)缺點(diǎn)。jvenn只能畫少于6組的Venn圖且會(huì)限制組名的長(zhǎng)度，Draw Venn Diagram能夠畫大于6組的圖像。

2、R語(yǔ)言代碼Venn圖的解鎖
（1）首先展示一個(gè)使用R的VennDiagram包繪制常規(guī)韋恩圖的方法，該包適用于2<=樣本數(shù)<=5的情形。通常韋恩圖所展示的樣本數(shù)量不會(huì)超過5，因?yàn)楫?dāng)樣本數(shù)量大于5時(shí)，繪圖結(jié)果將難以觀測(cè)。因此對(duì)于VennDiagram包來講，它所支持的樣本數(shù)量也是最多為5個(gè)。其實(shí)不止R的VennDiagram包，其它可繪制韋恩圖的R包或除R外的其它繪圖工具等，一般也不支持樣本數(shù)大于5個(gè)的情形。

第一步：Venn圖數(shù)據(jù)整理

第二步：Venn包加載及畫圖函數(shù)參數(shù)設(shè)置

結(jié)果展示：
 

（2）面對(duì)多于5個(gè)樣本的數(shù)據(jù)，大家可以使用叫"venn"的R包，它最多可支持7個(gè)樣本的韋恩圖。

 第一步：Venn圖數(shù)據(jù)整理

第二步：Venn包加載及畫圖函數(shù)參數(shù)設(shè)置

結(jié)果展示：

Veen圖數(shù)據(jù)下載鏈接：
https://pan.baidu.com/s/1eVfBudXRVX6QRvEjHUmy2A
提取碼：hwzt