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使用QCM技術(shù)進(jìn)行天然活性分子的靶標(biāo)垂釣

瀏覽次數(shù):1369 發(fā)布日期:2022-11-21  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
       藥物研發(fā)是一個(gè)費(fèi)時(shí)費(fèi)力的過(guò)程,為了最大程度的節(jié)省人力物力以及時(shí)間,科學(xué)家們一直在尋求在藥物研發(fā)的早期驗(yàn)證并去除不合適藥物候選物的方法,并希望可以找到一種方法可以實(shí)現(xiàn)對(duì)天然活性小分子物質(zhì)的未知靶標(biāo)的垂釣。ATTANA分子與細(xì)胞相互作用檢測(cè)儀可以實(shí)現(xiàn)高通量地驗(yàn)證藥物候選物,使得在藥物研發(fā)早期篩除不適合的候選物,并可完成對(duì)天然活性小分子的未知靶標(biāo)的垂釣,使節(jié)省研發(fā)成本和時(shí)間成為可能。

ATTANA分子與細(xì)胞相互作用檢測(cè)儀基于
石英晶體微天平(Quartz Crystal Microbalance, QCM)技術(shù)原理,QCM通過(guò)石英諧振器的頻率變化感知芯片表面質(zhì)量的變化,生成感應(yīng)曲線,其敏感度可達(dá)到分子水平。實(shí)驗(yàn)時(shí)只需將細(xì)胞、抗原或抗體等包被于芯片表面,將含有與之相作用的分子的溶液流過(guò)芯片表面,石英諧振器即可檢測(cè)分子間結(jié)合、解離等整個(gè)變化過(guò)程,生成一張傳感圖,提供動(dòng)力學(xué)親和力等數(shù)據(jù)分析。接下來(lái),我們將對(duì)使用QCM技術(shù)進(jìn)行天然活性小分子物質(zhì)的未知靶標(biāo)垂釣的關(guān)鍵步驟——芯片表面的修飾技術(shù)進(jìn)行剖析,希望可以為從事相關(guān)研究的老師們提供幫助。

Article 1:

Guo L, Chao S, Huang P, et al. A Universal Photochemical Method to Prepare Carbohydrate Sensors Based on Perfluorophenylazide Modified Polydopamine for Study of Carbohydrate-Lectin Interactions by QCM Biosensor. Polymers (Basel). 2019;11(6):1023. Published 2019 Jun 10. doi:10.3390/polym11061023

1、實(shí)驗(yàn)概述:利用聚多巴胺實(shí)現(xiàn)將PFPA(一種全氟苯疊氮化物)修飾到芯片表面,研究糖與凝集素之間的相互作用。

2、PFPA的結(jié)構(gòu)特性:

PFPA的結(jié)構(gòu)式

在熱激活或光照射下,PFPA結(jié)構(gòu)中的疊氮化物可以轉(zhuǎn)變?yōu)橐环N高度活性的氮,它很容易插入到CH和NH鍵中,具有極高的插入效率,因此被用于熱化學(xué)和光化學(xué)引入一系列的官能團(tuán),包括蛋白質(zhì)、納米結(jié)構(gòu)和合成聚合物。PFPA化學(xué)的通用性使其成為表面改造的一個(gè)有吸引力的選擇。表面可以通過(guò)該技術(shù)進(jìn)行全局修改。

3、芯片表面修飾方法:

在堿性環(huán)境下,用PDA通過(guò)多巴胺自聚合法制備裸金芯片表面,使芯片表面具有聚多巴胺涂層;

通過(guò)Schiff-base反應(yīng)可以使具有氨基基基團(tuán)和疊氮結(jié)構(gòu)的PFPA與芯片表面的聚多巴胺涂層(含有鄰苯二酚和鄰苯二醌結(jié)構(gòu))相結(jié)合;

PFPA修飾到芯片上后,糖分子可以通過(guò)PFPA的插入反應(yīng)(通過(guò)紫外光照引導(dǎo)反應(yīng)發(fā)生)修飾到芯片表面。
Article 2:

nal. Chem. 2007, 79, 18, 6897–6902 , Publication Date:August 18, 2007
https://doi.org/10.1021/ac070740r

1、實(shí)驗(yàn)概述:利用PFPA(一種全氟苯疊氮化物)將糖分子修飾到芯片表面,研究糖與凝集素之間的相互作用。
2、芯片表面修飾方法:
PFPA分子上的巰基基團(tuán)可與裸金芯片表面形成S-Au鍵,從而使PFPA分子結(jié)合到裸金芯片表面;

將PEG涂布于芯片表面,加熱使PFPA插入PEG分子,從而將PEG修飾到芯片表面;

三個(gè)單糖均含有PFPA結(jié)構(gòu),利用PFPA的再次插入反應(yīng),將糖分子插入PEG分子,從而將糖分子修飾到芯片表面。

Article 3:

Shang K, Song S, Cheng Y, et al. Fabrication of Carbohydrate Chips Based on Polydopamine for Real-Time Determination of Carbohydrate⁻Lectin Interactions by QCM Biosensor. Polymers (Basel). 2018;10(11):1275. Published 2018 Nov 16. doi:10.3390/polym10111275

1、實(shí)驗(yàn)概述:基于聚多巴胺制備碳水化合物芯片,用于通過(guò)QCM生物傳感器實(shí)時(shí)測(cè)定碳水化合物與凝集素的相互作用。

2、芯片表面修飾方法:

在堿性環(huán)境下,通過(guò)多巴胺自聚合作用,使QCM裸金芯片表面具有聚多巴胺涂層;

通過(guò)Schiff base 或者 Michael addition反應(yīng)使氨基化碳水化合物固定在聚多巴胺涂層芯片表面,得到碳水化合物修飾的芯片。
Article 4:


Oscar Norberg, Irene H. Lee, Teodor Aastrup, Mingdi Yan, Olof Ramström, Photogenerated lectin sensors produced by thiol-ene/yne photo-click chemistry in aqueous solution, Biosensors and Bioelectronics, Volume 34, Issue 1, 2012, Pages 51-56, ISSN 0956-5663,

https://doi.org/10.1016/j.bios.2012.01.001.

1、實(shí)驗(yàn)概述:基于巰基與烯烴/炔烴之間的光引發(fā)自由基反應(yīng)制備碳水化合物芯片,用于生物分子相互作用的分析。

2、芯片表面修飾方法:
聚苯乙烯涂布在裸金芯片表面,利用PFPA的插入反應(yīng),將PFPA(15)修飾到芯片表面;

由于PFPA分子上帶有羧基基團(tuán),可與14/16分子中的氨基基團(tuán)發(fā)生反應(yīng),從而使其結(jié)合到芯片表面;

利用烯烴、炔烴與巰基的反應(yīng)從而將化合物修飾到芯片表面。
Article 5:


Elmlund L, Söderberg P, Suriyanarayanan S, Nicholls IA. A phage display screening derived Peptide with affinity for the adeninyl moiety. Biosensors (Basel). 2014;4(2):137‐149. Published 2014 Apr 29. doi:10.3390/bios4020137

1、實(shí)驗(yàn)概述:利用噬菌體轉(zhuǎn)噬技術(shù)篩選具有腺嘌呤部分親和力的多肽。


2、芯片表面修飾方法:

將裸金芯片浸泡在5 mM 11-mercaptoundecanoic acid solution in ethanol (99.75%),該分子含有巰基和羧基基團(tuán),利用S-Au鍵可將該分子修飾到芯片表面;

此時(shí),芯片表面外層均為羧基基團(tuán),在EDC和DMAP的作用下,可與9-(2′-hydroxyethyl)adenine 分子中的羥基反應(yīng)形成酯鏈,從而將9-(2′-hydroxyethyl)adenine分子修飾在芯片表面。
實(shí)驗(yàn)方法總結(jié):

  • 芯片表面多采用裸金表面、羧基表面、聚苯乙烯表面和生物素表面等,但是小分子修飾通常利用裸金表面完成,使用后可利用濃硫酸或過(guò)氧化氫試劑可將芯片上的結(jié)合物洗脫干凈,方便再次進(jìn)行芯片的使用。
  • 常見的芯片修飾方法有兩種
  • 利用巰基基團(tuán)與裸金表面形成的S-Au鍵進(jìn)行小分子修飾;
  • 在芯片表面涂布聚合物,如聚多巴胺、聚苯乙烯等,在聚合物基礎(chǔ)上進(jìn)行二次修飾
 
 
 
  • 根據(jù)小分子的結(jié)構(gòu)進(jìn)行修飾方法的設(shè)計(jì),進(jìn)而完成對(duì)流經(jīng)芯片的大分子的垂釣。

  • 可通過(guò)檢測(cè)信號(hào)的強(qiáng)弱、信號(hào)的變化,觀測(cè)分子之間的相互作用,實(shí)現(xiàn)大分子的垂釣。

石英晶體微天平(QCM)系統(tǒng)已逐漸廣泛應(yīng)用于實(shí)時(shí)、無(wú)標(biāo)記的分子相互作用中,Attana是此發(fā)展過(guò)程中的先驅(qū)者。Attana公司總部位于瑞典斯德哥爾摩,自2003年起,其系統(tǒng)已被廣泛應(yīng)用于一流大學(xué)和生物技術(shù)公司的各種生命科學(xué)研究領(lǐng)域,Attana分子與細(xì)胞相互作用檢測(cè)儀可以幫助研究人員大大節(jié)省研究的時(shí)間與成本。

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