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多功能酶標(biāo)儀在微生物生長(zhǎng)測(cè)定原理前景解析的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1862 發(fā)布日期:2024-2-6  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

600nm波長(zhǎng)處的光密度(OD600)可反映細(xì)菌和酵母等微生物的生長(zhǎng)信息。更具體地說,反映種群中微生物數(shù)量隨時(shí)間的變化情況。

微生物生生長(zhǎng)曲線

監(jiān)測(cè)微生物種群隨時(shí)間的變化,可繪制出一條生長(zhǎng)曲線(圖1),分為四個(gè)生長(zhǎng)階段:

 

遲緩期

Lag phase

少量微生物被置入培養(yǎng)基(接種)開始培養(yǎng)后,需要一段時(shí)間適應(yīng)新環(huán)境。在此期間不會(huì)發(fā)生分裂,種群密度保持不變。

對(duì)數(shù)期

Log phase

當(dāng)微生物適應(yīng)了新的環(huán)境,就會(huì)開始增殖。細(xì)胞數(shù)量在一段時(shí)間內(nèi)以幾何級(jí)數(shù)增加。對(duì)數(shù)期是微生物分裂最活躍的時(shí)期,可用于進(jìn)一步計(jì)算倍增時(shí)間和生長(zhǎng)速率等參數(shù)。

穩(wěn)定期

Stationary phase

微生物的増殖受到培養(yǎng)基中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的限制。一旦碳源或其他必需成分消耗殆盡,就會(huì)停止分裂。微生物生長(zhǎng)曲線在這一階段的特點(diǎn)表現(xiàn)為微生物種群密度穩(wěn)定保持在較高水平。

衰亡期

 Death phase

隨著營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)、鹽、氨基酸的耗盡,以及酸或乙醇等有害廢物的積累,微生物培養(yǎng)環(huán)境條件惡化,微生物種群開始衰亡。這表現(xiàn)為微生物密度整體呈下降趨勢(shì)。

圖1:微生物生長(zhǎng)曲線。分批培養(yǎng)中微生物數(shù)量的典型變化過程。

 

利用OD600測(cè)量微生物生長(zhǎng)的原理

OD600基于吸收光檢測(cè),測(cè)量的是穿過樣品,即微生物懸液的光。透射光與微生物的生長(zhǎng)有什么關(guān)系?由于溶液中的微粒會(huì)產(chǎn)生散射光,微粒(微生物)越多,散射的光就越多。因此,隨著細(xì)菌或酵母數(shù)量成倍增長(zhǎng),光散射程度和測(cè)量的吸光度值會(huì)變大。同時(shí),這意味著只是通過吸收光模式測(cè)定光散射的程度,而不是衡量分子對(duì)光的選擇性吸收。這一點(diǎn)至關(guān)重要:OD600實(shí)際上測(cè)量的是散射引起的透射光損失,而不是吸光度!

 

多種生物和醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域都要用到有關(guān)微生物生長(zhǎng)的信息:

 抗生素耐藥性 

感染多重耐藥病原體的人數(shù)和因感染而死亡的人數(shù)不斷增加。亟需開發(fā)新型藥物或方法,來控制這些病原體。在新抗菌藥物的研發(fā)過程中,要用到OD600評(píng)估其對(duì)微生物生長(zhǎng)的抑制作用,以確定藥物的有效性。

 微生物生產(chǎn) 

微生物本身可以成為工業(yè)產(chǎn)品,可用于生產(chǎn)烘焙食品或奶酪等,還可用于生產(chǎn)酶、抗生素、維生素等產(chǎn)品。對(duì)于這兩種用途,都需要在過程初始對(duì)生長(zhǎng)特性等方面進(jìn)行菌種優(yōu)化。生產(chǎn)過程一經(jīng)建立,就需要進(jìn)行微生物監(jiān)測(cè)。同樣,要用到OD600監(jiān)測(cè)過程中的微生物生長(zhǎng)情況。

 合成生物學(xué) 

使用基因工程經(jīng)典方法來構(gòu)建具有預(yù)定特性的生物系統(tǒng)。這意味著要對(duì)生物 “機(jī)器”進(jìn)行合理設(shè)計(jì),包括對(duì)基因進(jìn)行高度改造,甚至是改造成完全人工基因組。其目的是生產(chǎn)出石化產(chǎn)品替代品,如生物燃料或塑料,以及能感知污染物或降解塑料的微生物產(chǎn)品。常用的微生物有大腸桿菌(E. coli)和釀酒酵母菌(S. Cerevisiae)等,需要通過OD600監(jiān)測(cè)其生長(zhǎng)情況。

OD600檢測(cè)微生物生長(zhǎng)的注意事項(xiàng)

如前所述,OD600測(cè)量的是散射光,而非吸收光。理論上,描述吸光度與吸收分子濃度線性關(guān)系的朗伯-比爾定律不適用于OD600測(cè)量。但實(shí)踐證明,盡管不使用吸光度,比爾-朗伯定律仍適用于低密度培養(yǎng)物。換句話說,OD600值可以直接與極低密度懸液中的微生物數(shù)量相關(guān)。對(duì)于密度較高的培養(yǎng)物,OD600的測(cè)量結(jié)果呈拋物線狀。只有將OD600值與一系列微生物數(shù)量進(jìn)行校準(zhǔn)后,才能計(jì)算出這種培養(yǎng)物中的微生物數(shù)量。

選擇比色皿還是微孔板?

如果要對(duì)大容量的樣品進(jìn)行過程監(jiān)測(cè),推薦使用比色皿。每隔一定時(shí)間(如1小時(shí))取樣一次,測(cè)定微生物的種群密度。每次檢測(cè)需要約1.5ml微生物懸液,并且需要留出一定時(shí)間進(jìn)行樣品抽。▓D2)。

圖2:從酵母發(fā)酵罐中取樣。

 

微孔板則用于微生物生長(zhǎng)的持續(xù)監(jiān)測(cè)。只需200µl懸液,以設(shè)定的時(shí)間間隔自動(dòng)檢測(cè)生長(zhǎng)過程。通常使用的是96孔板 ,非常適合多種樣品的重復(fù)測(cè)量,以及比較不同的培養(yǎng)基條件或菌株。對(duì)于中高通量應(yīng)用,可實(shí)現(xiàn)流程自動(dòng)化。

 

如何選擇檢測(cè)儀器?

以吸收光模式測(cè)定顆粒的光散射時(shí),使用不同的儀器得出的結(jié)果可能會(huì)有所差異。原因在于光束的類型不同,探測(cè)器與樣品的距離也不同?梢韵胂螅(dāng)通過微生物的光束發(fā)生散射,距離較近的探測(cè)器更容易捕捉到光線,而距離較遠(yuǎn)的探測(cè)器則有可能捕捉不到(圖3)。因此,建議使用可用OD600來檢測(cè)微生物生長(zhǎng)過程的一系列專用儀器。

圖3:不同的檢測(cè)儀器會(huì)產(chǎn)生不同的結(jié)果。該圖展示探測(cè)器位置的影響:在尺寸相同的情況下,距離樣品較近的探測(cè)器可檢測(cè)到散射光,而距離樣品較遠(yuǎn)的探測(cè)器則檢測(cè)不到光信號(hào)。

 

顯然,比色皿或微孔板的使用限制了選擇范圍,二者分別對(duì)應(yīng)分光光度計(jì)和酶標(biāo)儀。但像SPECTROstar® Nano這種兼具比色皿和微孔板檢測(cè)能力的儀器,可以滿足您當(dāng)下和未來的所有需求(圖4)。

圖4:BMG LABTECH的SPECTROstar® Nano是一款帶有比色皿端口的酶標(biāo)儀。

 

 什么情況下需要校準(zhǔn)?

如果需要用OD600值來確定溶液中的微生物數(shù)量/濃度(如每毫升的微生物數(shù)量),或者需要對(duì)OD600散射測(cè)量的非線性性質(zhì)進(jìn)行校正,需要進(jìn)行校準(zhǔn)。為了進(jìn)行測(cè)量,需要制備已知微生物濃度的微生物懸浮液,并使用與后續(xù)實(shí)驗(yàn)相同的樣品量在所選儀器上測(cè)量OD600。用測(cè)量值生成校準(zhǔn)曲線,隨后可將未知樣品的OD600值與該曲線相關(guān)聯(lián),并反算出濃度。由于光散射會(huì)隨著顆粒大小和形狀的變化而變化,因此對(duì)每種微生物都要進(jìn)行校準(zhǔn)。同樣,在更換分析儀器或樣品量時(shí)也需要進(jìn)行校準(zhǔn)。

OD600測(cè)量的前景

利用微孔板測(cè)量OD600的方法越來越多地與發(fā)光或熒光等檢測(cè)模式相結(jié)合。微生物生長(zhǎng)測(cè)量值可用于其他檢測(cè)法的歸一化處理。例如在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)期刊發(fā)表的一篇文章中,一項(xiàng)研究使用 CLARIOstar® 多功能酶標(biāo)儀測(cè)量金/黃/色/葡/萄/球/菌(Staphylococcus aureus)的翻譯。使用熒光模式測(cè)量了β-半乳糖苷酶報(bào)告基因,并將表示酶活性的信號(hào)歸一化為OD600。另一個(gè)例子是使用化學(xué)發(fā)光法檢測(cè)單核細(xì)胞增生李斯特氏菌(L. monocytogenes)基因表達(dá),并將其歸一化為OD600值。

檢測(cè)微生物生長(zhǎng)的其他方法

散射比濁法

利用散射比濁法檢測(cè)微生物生長(zhǎng)也是基于光散射原理。與測(cè)量散射導(dǎo)致的透射損失的OD600值不同,散射比濁法直接檢測(cè)散射光。這是BMG LABTECH的NEPHELOstar® Plus(圖5)的強(qiáng)項(xiàng)。與基于吸光度模式的方法相比,散射比濁法的靈敏度更高,可檢測(cè)顆粒數(shù)量較低的樣品,因此適用于檢測(cè)微生物數(shù)量極少的懸液。

圖5:BMG LABTECH的NEPHELOstar® Plus是微孔板散射濁度儀,適用于檢測(cè)微生物數(shù)量極少的懸液。

 

穩(wěn)定熒光團(tuán)表達(dá)

由相關(guān)微生物穩(wěn)定表達(dá)的熒光團(tuán)(如GFP或RFP)也能夠反映微生物的生長(zhǎng)情況。熒光強(qiáng)度與熒光團(tuán)濃度呈線性關(guān)系?赏ㄟ^VANTAstar® 等熒光酶標(biāo)儀對(duì)熒光信號(hào)的變化進(jìn)行檢測(cè)(圖6)。

圖6:BMG LABTECH的VANTAstar®屬于多功能酶標(biāo)儀,可用于熒光檢測(cè)。

 

使用BMG LABTECH酶標(biāo)儀進(jìn)行微生物研究

酶標(biāo)儀為微生物生長(zhǎng)檢測(cè)提供了更多可能性。如果您想進(jìn)一步了解BMG LABTECH為微生物研究制定的解決方案,請(qǐng)通過文末的“閱讀原文”閱讀或下載我們的微生物檢測(cè)手冊(cè)。



 

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