Origins高分辨率潛水電泳儀助力病原微生物流行病學(xué)研究

【Microorganisms】Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia
在斯洛伐克城市、農(nóng)業(yè)和洞穴棲息地中，蓖麻硬蜱對伯氏疏螺旋體復(fù)合體感染率的時空特異性

萊姆病(Lyme borreliosis ，LB)是歐洲最常見的蜱傳人類感染性疾病，近幾十年來發(fā)病率不斷上升。該病以蜱為媒介，由伯氏疏螺旋體(Bbsl)所致的自然疫源性疾病。在歐洲全域，特別是斯洛伐克，已觀察到大量的蓖麻硬蜱種群，成為病原體伯氏疏螺旋體(Bbsl)復(fù)合體的主要媒介。了解感染性疾病的傳播途徑對實施有效的控制措施至關(guān)重要。

本研究聚焦于斯洛伐克，從代表城市/郊區(qū)、自然和農(nóng)業(yè)棲息地的三個地點尋找感染伯氏疏螺旋體(Bbsl)的蓖麻硬蜱種群，調(diào)查Bbsl的感染率及其物種多樣性的時空特異性。在布拉迪斯拉發(fā)鎮(zhèn)(城市/郊區(qū)棲息地)、小喀爾巴阡山脈(自然棲息地)和斯洛伐克東部農(nóng)業(yè)棲息地，通過拖拽植被采集蓖麻硬蜱若蟲和成蟲。用聚合酶鏈式反應(yīng)檢測蜱體內(nèi)是否存在疏螺旋體，并用限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）鑒定Bbsl種群。用反向線性印跡法（Reverse Line Blotting ，RLB）鑒定共感染蜱中的伯氏疏螺旋體類型，從而獲得不同環(huán)境中蓖麻硬蜱攜帶伯氏疏螺旋體的真實情況。

文中使用限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）分析鑒定Bbsl種群類型，具體通過Origins高分辨率潛水電泳儀結(jié)合Spreadex gel EL300 mini預(yù)制膠，以核酸片段分布圖譜確定Bbsl種群及亞種。

在探索的棲息地中，蜱蟲感染伯氏疏螺旋體在空間和時間上存在顯著差異�？偢腥韭首畹偷氖浅鞘�/郊區(qū)棲息地，而自然和農(nóng)業(yè)棲息地的感染率較高。RFLP在每個環(huán)境類型中檢測到6種Bbsl，包括B. burgdorferi sensu stricto (s.s.)， B. afzelii， B. garinii， B. valaisiana，B. lusitaniae 和 B. spielmanii。其中，共感染占總感染數(shù)量的3%。通過RLB和測序鑒定出B. kurtenbachii與B. burgdorferi s.s，B. garinii 和B. valaisiana存在共感染的情況。這是首次在斯洛伐克和歐洲的蓖麻硬蜱調(diào)研中發(fā)現(xiàn)B.kurtenbachii。同時在若蟲和成蟲之間、不同年份之間以及不同生物環(huán)境類型之間，發(fā)現(xiàn)了Bbsl物種比例的變化。在城市棲息地相對距離較短的地點之間，Bbsl物種的流行模式和比例也存在空間差異。伯氏疏螺旋體感染率和分布的時空特異性可能與當?shù)丨h(huán)境條件和脊椎動物宿主譜有關(guān)。由于存在對人類致病的伯氏疏螺旋體類型，所有探索的地點都可以被列為具有高流行病學(xué)風(fēng)險的地區(qū)。

Kazimírová, Mária, et al. "Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia." Microorganisms 11.7 (2023): 1666.

Origins高分辨率潛水電泳來自奧地利AL-Labortechnik公司，集成了整體的溫度控制系統(tǒng)，即通過半導(dǎo)體元件和自動溫度控制系統(tǒng)，精準控制電泳過程中的溫度。同時整合循環(huán)泵系統(tǒng)，確保整個電泳區(qū)域溫度和pH值恒定，形成均勻的、線性電場，這使得該設(shè)備具有高分辨率和高重復(fù)性，可廣泛用于植物、微生物物種的分群和鑒定，以及疾病相關(guān)基因的研究等。

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