羅氏旗下454推出GS FLX Titanium系列試劑

 

羅氏旗下454生命科學(xué)公司宣布推出全新的GS FLX Titanium系列試劑和軟件，它們將改變生命科學(xué)行業(yè)。利用新的試劑，升級的Q20單個序列讀長達到400個堿基對（即第400個堿基的準(zhǔn)確率也高達99%，前面的堿基準(zhǔn)確率更高）；通量提高5倍，達到每輪運行能獲得4-6億個堿基對序列。產(chǎn)品性能提升到新高度，進一步鞏固了454生命科學(xué)公司在測序領(lǐng)域作為金標(biāo)準(zhǔn)的地位，在大多數(shù)應(yīng)用中有效取代了傳統(tǒng)的Sanger測序法。

北美多個主流基因組研究中心增加該儀器的配置數(shù)量正是響應(yīng)儀器性能提升的結(jié)果。貝勒醫(yī)學(xué)院是第一個安裝了10臺Genome Sequencer FLX儀器的機構(gòu)，圣路易斯的華盛頓大學(xué)緊隨其后也立刻將FLX增加至8臺。麻省理工大學(xué)和哈佛大學(xué)合作的Broad研究院目前的儀器數(shù)量是10臺，聯(lián)合基因組研究院（Joint Genome Institute）也增至8臺FLX。

 

首批GS FLX Titanium系列試劑盒在今年早期運送至這些基因組中心以進行測試和評估。針對這些試劑和軟件表現(xiàn)的反饋意見都非常滿意,充分肯定了新系統(tǒng)的強大實力。實際上，幾個主要的基因組中心已經(jīng)將GS FLX Titanium試劑運用于生產(chǎn)中。貝勒醫(yī)學(xué)院人類基因組測序中心的主管Richard Gibbs教授表示：“我們很高興能第一個優(yōu)先使用GS FLX Titanium試劑，也非常滿意----新試劑的性能與454承諾的一樣好。新的試劑有效取代了Sanger測序，因此我們正將其應(yīng)用到我們中心10臺GS FLX儀器上�！甭槭±砉ご髮W(xué)和哈佛大學(xué)聯(lián)合的Broad研究院的基因組生物計劃也是新試劑的早期用戶之一。該計劃的聯(lián)合主管Chad Nusbaum博士如此評價：“我們對新的GS FLXTitanium試劑系列的潛能非常樂觀，它能降低費用并提高測序質(zhì)量。這個系統(tǒng)將有助于我們擴展研究范圍，實施以前覺得成本過于昂貴的項目。我們正在開發(fā)新方法來充分利用這個全新的長達400個堿基對的序列讀長能力，尤其是用于大型基因組的重新拼接�！�

 

“我們用長的GS FLX Titanium序列讀長能力來對果蠅進行拼接，效果也非常好。利用454生命科學(xué)獨特的3K和20K配對末端讀序法，我們的N50 contig長度達到30-50kb，N50 scaffold的大小也超過3 Mb,基因組的序列覆蓋度為12倍�！必惱蔗t(yī)學(xué)院人類基因組測序中心的助理教授Stephen Richards博士表示,“與對照的果蠅基因組相比，這個結(jié)果非常好，說明GS FLX Titanium系列讀長至少相當(dāng)于Sanger讀長的8倍，

而速度卻快得多，費用也少了一個數(shù)量級。”Broad研究院測序部門的主管Rob Nicol博士補充道，“除了長達400bp的序列讀長和更高的測序讀長密度，新Titanium系列的改進有助于開發(fā)更高效、更高通量的工作用于大規(guī)模測序工作中----例如人類微生物組計劃（HMP）中的微生物全基因組測序。GS FLX Titanium系列的高效步驟讓我們簡化了工作流程，大大縮短了從樣品到數(shù)據(jù)再到結(jié)果的時間�！睘镚S FLX Titanium系列試劑的推出作準(zhǔn)備，更多的客戶應(yīng)邀參與了早期試用計劃�？巳R格凡特研究院（J.Craig Venter Institute,JCVI）核心技術(shù)開發(fā)與服務(wù)的副總裁Yu-Hui Rogers博士表示，“我們用GS FLX Titanium系列試劑進行的初期驗證結(jié)果是非常令人鼓舞。一旦這些試劑推出，序列讀長和產(chǎn)能的提升將促使我們立即將新產(chǎn)品投入使用。新的試劑，以及從不同大小的插入片段文庫中獲得配對末端序列讀長的能力，將大大提升454系統(tǒng)在JCVI幾個重要測序應(yīng)用中的作用，包括人類重測序和代謝基因組測序�！�

 

454生命科學(xué)的CEO兼總裁Chris McLeod表示：“我們很高興能為迅速擴大的客戶群提供GS FLXTitanium系列試劑。GS FLX系統(tǒng)正迅速成為DNA測序的金標(biāo)準(zhǔn)，它與傳統(tǒng)的Sanger測序和許多所謂的微讀長技術(shù)相比，性能、準(zhǔn)確性、價格的優(yōu)勢顯而易見�！睙o需對儀器的硬件做任何改動，僅僅改進試劑和軟件，就能實現(xiàn)技術(shù)性能提升。因此，目前使用GS FLX儀器的客戶不需要任何昂貴的儀器升級，即可利用和享受到這些改進。454生命科學(xué)研發(fā)部的副總裁Michael Egholm認(rèn)為：“我們很自豪能為科學(xué)家提供這樣卓越的性能升級。聯(lián)合基因組研究院現(xiàn)在單次運行就能得到超過6.5億個堿基。我們的平臺能讓科學(xué)家迅速獲得有意義的結(jié)果，這一點從頂級學(xué)術(shù)期刊發(fā)表文章的驚人比例中也能看出。新的GS FLX Titanium系列試劑無以倫比的性能提升已經(jīng)被市場認(rèn)可，而毛細(xì)管測序儀正慢慢地被淘汰，客戶也逐漸轉(zhuǎn)向454測序平臺�！�

 

羅氏始創(chuàng)于1896年，總部位于瑞士巴塞爾，在制藥和診斷領(lǐng)域是世界領(lǐng)先的以研發(fā)為基礎(chǔ)的健康事業(yè)公司之一。作為世界上最大的生物科技公司，羅氏提供從早期發(fā)現(xiàn)、預(yù)防、診斷到治療的創(chuàng)新產(chǎn)品與服務(wù)，在諸多領(lǐng)域都做出了突出的貢獻，從而提高了人類的健康水準(zhǔn)和生活質(zhì)量。羅氏是體外診斷領(lǐng)域、抗腫瘤藥品和移植藥品的全球領(lǐng)先者，是病毒學(xué)領(lǐng)域的市場領(lǐng)導(dǎo)者。在其它關(guān)鍵疾病領(lǐng)域如自身免疫性疾病、炎癥、代謝和中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病等同樣表現(xiàn)活躍。2008年，藥品部的銷售額達360億瑞士法郎，診斷部的銷售額達97億瑞士法郎。2008年，羅氏在研發(fā)方面的投入超過了90億瑞士法郎，并與多個合作伙伴建立了研究與開發(fā)的業(yè)務(wù)聯(lián)盟，包括羅氏控股的基因泰克和中外制藥。羅氏集團共擁有約8萬名員工。

 

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