數(shù)據(jù)質(zhì)控:去除接頭污染和低質(zhì)量數(shù)據(jù);
與參考序列進行比對、統(tǒng)計測序深度及覆蓋度;
序列拼接組裝,交付質(zhì)粒序列fasta格式文件。
注:以下情況可能會有拼接結(jié)果不好的風(fēng)險:a. 質(zhì)粒存在重復(fù)序列、高GC\AT結(jié)構(gòu);b. 質(zhì)粒不純(相似度太高的質(zhì)粒無法通過本方法區(qū)分開)。
案例展示:
圖1.測序成環(huán)質(zhì)粒圖
圖2.質(zhì)粒序列FASTA格式文件
送樣要求:
純菌:新鮮菌液≥200 μL,穿刺菌,冰袋運輸;
質(zhì)粒:濃度≥50 ng/μL,體積 ≥20 μL,主帶明顯、無降解無污染,務(wù)必用滅菌的雙蒸水溶解;
信息單詳細填寫載體名稱、質(zhì)粒大小及抗性,擎科提供Amp,Kana兩種抗生素。
寄樣地址:(請聯(lián)系當(dāng)?shù)劁N售經(jīng)理寄送)
江蘇省南京市江寧區(qū)乾德路9號大樹科技2號樓五樓
高通量測序組(收) 13851793730
寄件須知:
冰袋保存寄送,建議選擇順豐快遞,寄樣時需要將《擎科生物高通量測序樣品信息單-全質(zhì)粒測序》(長按識別下方二維碼)打印出來隨樣本一起寄送。