伯豪單細(xì)胞Flex年中巨惠，1.1W/樣本活動價即將截止
單細(xì)胞Flex
年中巨惠來襲
活動時間：即日起至2024年8月31日
巨惠價
1.1W/樣本
含抽核，上機，建庫，測序50G及Cell Ranger矩陣
年中巨惠來襲
活動時間：即日起至2024年8月31日
巨惠價
1.1W/樣本
含抽核，上機，建庫，測序50G及Cell Ranger矩陣
活動說明：
1.活動時間為合同簽訂時間；
2.2024年10月31日前有到款；
3.4~9個樣本，基礎(chǔ)分析1000元/樣本；≥10個樣本，基礎(chǔ)分析500元/樣本；
4.活動最終解釋權(quán)歸伯豪生物所有。
1.活動時間為合同簽訂時間；
2.2024年10月31日前有到款；
3.4~9個樣本，基礎(chǔ)分析1000元/樣本；≥10個樣本，基礎(chǔ)分析500元/樣本；
4.活動最終解釋權(quán)歸伯豪生物所有。
10X Genomics及伯豪生物均實驗過許多組織類型：肺癌、前列腺癌、鼻咽癌腦轉(zhuǎn)移、肺轉(zhuǎn)移、肝癌、腸道、結(jié)直腸癌、肺癌淋巴結(jié)、子宮內(nèi)膜癌、胃癌、食管鱗癌、胃癌腦轉(zhuǎn)移、頸部淋巴結(jié)，黑色素瘤，卵巢癌，腎等。伯豪生物已完成數(shù)百例樣本，如圖所示FFPE居多，此外有細(xì)胞固定冰凍樣本。不同組織類型的基因中位數(shù)有所差別，項目開展前您可與伯豪生物科研顧問聯(lián)系溝通了解白名單樣本以及其他樣本的更多信息。
1 Flex應(yīng)用樣本
• FFPE樣本，醫(yī)院病理科大量存檔樣本，進(jìn)行回顧性研究。
• 某些傳染類疾病樣本，由于運輸和實驗條件限制不便于取新鮮樣本，可固定后送樣檢測。（附：細(xì)胞/核固定操作流程）
• 準(zhǔn)確獲取樣本瞬時基因表達(dá)譜“微量”變化，實驗處理/藥物治療的不同時間及不同發(fā)育時間組等。新鮮組織解離過程容易誘導(dǎo)應(yīng)激基因的表達(dá)，或隨著處理時間的延長而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜發(fā)生變化，引起細(xì)胞轉(zhuǎn)錄模式發(fā)生“人為改變”。尤其對于一些解離時間較長和基因表達(dá)變化迅速的組織。
• 與FFPE空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合，極大開拓了FFPE樣本的利用空間。
• 某些新鮮或冰凍樣本質(zhì)檢結(jié)果差，無法滿足常規(guī)實驗要求的樣本。
2 Flex亮點
• 探針捕獲更靈敏，分析數(shù)千個至數(shù)十萬個細(xì)胞或細(xì)胞核的基因表達(dá)，捕獲人類或小鼠全轉(zhuǎn)錄組，可檢測低表達(dá)基因。
• 兼容不同樣本類型，將單細(xì)胞分析擴展到臨床試驗或其他轉(zhuǎn)化研究所使用的FFPE組織并附帶針對不同樣本類型而優(yōu)化的示范方案，包括細(xì)胞系、原代細(xì)胞以及含有脆弱細(xì)胞的解離組織。
• 鎖定細(xì)胞瞬時狀態(tài)，準(zhǔn)確獲取樣本瞬時基因表達(dá)譜“微量”變化。
• 細(xì)胞捕獲率高達(dá)65% ，多細(xì)胞（multiplets）比例低，每1,000個細(xì)胞僅為0.8%，滿負(fù)荷上樣時每個樣本的多細(xì)胞比例不超過8%。
• 減少批次效應(yīng)，在不折損數(shù)據(jù)質(zhì)量的情況下保存樣本，實現(xiàn)在同一次運行中批量分析樣本，并最大限度減少實驗可變性。
3 送樣建議
• 優(yōu)先寄送蠟塊，要求被包埋組織體積>0.5cm3，蠟塊密封后4度避光保存和運輸。如不方便提供蠟塊，可切石蠟卷寄送。
• 石蠟卷要求：25μm或50μm厚度石蠟切片3卷以上，蠟卷被包埋組織橫截面積＞0.3cm2，現(xiàn)切現(xiàn)用（4度最多保存一周），厚度不可小于25μm，石蠟卷置于1.5ml EP管內(nèi)，密封后4度避光保存和運輸，保證石蠟卷完整不破碎。石蠟卷如破碎較為嚴(yán)重，說明樣本脆性較大，會影響樣本質(zhì)量。注：某些組織類型由于同等體積下細(xì)胞數(shù)量較少，可能需要提供更多蠟卷，例如穿刺樣本、脂肪組織、肺癌、心肌等。
• FFPE保存年限：無明確年限要求，10X已測試1-11年FFPE，已有文獻(xiàn)表明相對于保存時間，固定時間對RNA質(zhì)量影響更大（Trinks A，2024）。
• 石蠟樣本后續(xù)需經(jīng)過DV200質(zhì)控，DV200≥30%的樣本繼續(xù)進(jìn)行細(xì)胞核解離操作，細(xì)胞核產(chǎn)量需≥30萬，背景干凈雜質(zhì)少，核膜完整度>80%，結(jié)團率<10%；合格樣本，可繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)單細(xì)胞測序?qū)嶒灐?br />
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