Illumina已經(jīng)設(shè)計了兩種標(biāo)準(zhǔn)的miRNA表達(dá)型芯片:人和小鼠。其中miRNA序列信息來自于最新的Sanger Institute miRBase 數(shù)據(jù)庫12.0和文獻(xiàn)報道等到公認(rèn)的miRNA,對于研究人類疾病群或者小鼠模型中感興趣的基因表達(dá)調(diào)節(jié)機(jī)制來說是再理想不過的技術(shù)手段。
特點:高靈敏度:適用于檢測低豐度的miRNA和樣本間差異小的樣品;
高通量:一張芯片可同時檢測12或96個樣本;
低樣本量:培養(yǎng)的細(xì)胞,新鮮的凍塊,或者是FFPE組織中的總RNA,約100-200ng;
易綜合:與其他Illumina基因表達(dá)技術(shù)相比,使用BeadArray掃描儀,和具有相似的化學(xué)方法;
高特異性:基于酶介導(dǎo)的引物延伸后的雜交的兩步法差異。
※microRNA表達(dá)譜芯片
人類的miRNA芯片上包含了1146個人miRNA,小鼠的miRNA芯片上包含了656個小鼠miRNA。miRNA序列信息來自于最新的Sanger Institute miRBase 數(shù)據(jù)庫12.0和文獻(xiàn)報道等到公認(rèn)的miRNA。每張芯片可同時檢測12個或96個樣本。