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基因芯片-基因組層次服務(wù)
Illumina全基因組分型芯片（物種有 人、牛、馬、羊、豬、犬、玉米）
服務(wù)類別：芯片與生物信息學(xué)總訪問：3872
最后更新：2015-8-19半年訪問：45
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服務(wù)商： 晶能生物技術(shù)（上海）有限公司 查看該公司所有服務(wù) >>
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Illumina Human SNP 分型芯片服務(wù)
 
Illumina全基因組分型芯片采用Infinium技術(shù)，該技術(shù)無需PCR反應(yīng)，不依賴限制性內(nèi)切酶，在SNP位點(diǎn)的選擇上可以完全根據(jù)基因組情況來選擇，芯片反應(yīng)通過等位基因特異性延伸來完成，保證了高質(zhì)量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。SNP是迄今為止分布最為廣泛、存在數(shù)量最多的一種遺傳多態(tài)性。SNP的研究將幫助我們尋找新的遺傳病的致病基因或易感基因,認(rèn)識人種、人群、個(gè)體間的遺傳差異,疾病與個(gè)體差異的關(guān)系,以及個(gè)體差異對藥物的耐藥性存在的不同的反應(yīng)能力。
 
芯片名稱: Human omni-1 quad beadchip
芯片信息: Human omni-1 quad 芯片數(shù)據(jù)來自于人類千人基因組計(jì)劃測序結(jié)果。其中包含了超過114 萬個(gè)探針信息，可以在一張芯片上平行進(jìn)行4 個(gè)樣本的檢測。該款芯片包含針對基因SNPs，標(biāo)簽SNPs，拷貝數(shù)變化（CNV）, 及其他高價(jià)值的基因組區(qū)基因組區(qū)域域設(shè)計(jì)探針。
 
芯片名稱：Human omniexpress-12 beadchip
芯片信息：含蓋人類基因組計(jì)劃HapMap三個(gè)階段研究的數(shù)據(jù)，針對基因SNPs，標(biāo)簽SNPs，拷貝數(shù)變化（CNV），及其他高價(jià)值的基因組區(qū)域設(shè)計(jì)探針.共700,000多個(gè)位點(diǎn)，每張芯片可同時(shí)檢測12個(gè)樣本。在r2 > 0.8 前提下，在CEU，JPT+CHB，YRI等人種中基因組覆蓋率分別為：0.91，0.91，0.68。CNV區(qū)域平均間隔4.0kb。
 
芯片名稱：Human omni-zhonghua-8 beadchip
芯片信息：此芯片是一款專為中國人設(shè)計(jì)的全基因組SNP基因分型芯片，每張芯片做8個(gè)樣品，芯片覆蓋了在中國人群體中發(fā)現(xiàn)的常有和稀有變異，適用于全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）。經(jīng)優(yōu)化的90萬個(gè)標(biāo)簽SNP信息來自HapMap所有三個(gè)階段及千人基因組計(jì)劃（1kGP）。并經(jīng)策略性選擇，可用于在中國人種群中探索全新的疾病和性狀關(guān)聯(lián)。
 
芯片名稱：Infinium Human Exome BeadChip
芯片信息：Human Exome BeadChip芯片前所未有地覆蓋了推定的功能性外顯子變異，這些變異精選自12,000多個(gè)個(gè)體的外顯子組和全基因組序列。外顯子內(nèi)容包含了> 240,000個(gè)標(biāo)志物，它們代表了不同群體—包括歐洲、非洲、中國和西班牙個(gè)體—以及多種常見病，如II型糖尿病、癌癥、代謝及精神疾病。
 
芯片名稱：CytoSNP-12 BeadChip
芯片信息：CytoSNP-12 BeadChip芯片，包含30萬個(gè)和疾病相關(guān)的遺傳標(biāo)。數(shù)據(jù)來源于Hapmap  I和II。
 
芯片名稱：Omni2.5-Quad BeadChip
芯片信息：Omni2.5-Quad BeadChip芯片，包含250萬個(gè)SNP探針及CNV探針。用于基因分型和全基因組CNV分析，平均間隔1.2kb，MAF>2.5%。數(shù)據(jù)來源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。
 
芯片名稱：Omni5-Quad BeadChip
芯片信息：Omni5-Quad BeadChip芯片，包含500萬個(gè)SNP探針及CNV探針。用于基因分型和全基因組CNV分析，平均間隔0.6kb，MAF>1%。數(shù)據(jù)來源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。
 
技術(shù)路線
 
生物信息學(xué)分析
 
樣品要求
1）樣品類型：細(xì)胞、新鮮組織或DNA樣品。
2）樣品量：細(xì)胞樣品請?zhí)峁┲辽?×106個(gè)細(xì)胞，組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片。DNA樣品請?zhí)峁?μg以上的基因組DNA。
3）樣品質(zhì)量：DNA無明顯降解，OD260/280值在1.7～1.9之間，濃度≥50ng/μl。
4）樣品保存：細(xì)胞樣品或新鮮組織塊（切成～50mg的小塊）用液氮速凍后，-80℃保存。DNA樣品可溶于的超純水或TE（PH8.0）中，-20℃短期保存或者-80℃長期保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。
5）樣品運(yùn)輸：樣品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰運(yùn)輸。DNA樣本放離心管或者PCR板中，密封后，冰袋運(yùn)輸。
 
 
 
樣品要求
1）樣品類型：細(xì)胞、新鮮組織或DNA樣品。
2）樣品量：細(xì)胞樣品請?zhí)峁┲辽?×106個(gè)細(xì)胞，組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片。DNA樣品請?zhí)峁?μg以上的基因組DNA。
3）樣品質(zhì)量：DNA無明顯降解，OD260/280值在1.7～1.9之間，濃度≥50ng/μl。
4）樣品保存：細(xì)胞樣品或新鮮組織塊（切成～50mg的小塊）用液氮速凍后，-80℃保存。DNA樣品可溶于的超純水或TE（PH8.0）中，-20℃短期保存或者-80℃長期保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。
5）樣品運(yùn)輸：樣品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰運(yùn)輸。DNA樣本放離心管或者PCR板中，密封后，冰袋運(yùn)輸。
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