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人類蛋白質(zhì)組芯片/蛋白芯片服務(wù)
HuProtTM 人類蛋白質(zhì)組芯片高通量的人類蛋白質(zhì)芯片,覆蓋有約20000種人類蛋白質(zhì)。
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問:2117
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Huprot_v3.1.png


 

     

        HuProt™20K人類蛋白組芯片,芯片上有近2萬種全長蛋白質(zhì),覆蓋75%的人類基因組ORF區(qū)。重組蛋白采用酵母表達(dá)系統(tǒng),逐個進(jìn)行表達(dá)與純化鑒定。在芯片上每個蛋白質(zhì)均設(shè)置技術(shù)重復(fù),并設(shè)有多種質(zhì)控點(diǎn),確保實(shí)驗(yàn)體系穩(wěn)定可靠。
 

蛋白芯片規(guī)格:

 

           芯片標(biāo)準(zhǔn):1×25×76mm硅片片基,蛋白點(diǎn)徑~60μm,體積0.5~1 nL;
           技術(shù)重復(fù):每個蛋白點(diǎn)2次技術(shù)重復(fù);
           熒光檢測:可使用單一或多色標(biāo)簽;
           純化體系:所有蛋白質(zhì)在非變性條件下,通過真核酵母表達(dá)體系表達(dá)純化;
           生產(chǎn)條件:溫度4-8℃,濕度30~40%點(diǎn)樣,4℃過夜固定,-80℃長期保存。

 

蛋白芯片列表:

 

        HuProt™20K人類蛋白組芯片通過化學(xué)修飾共價結(jié)合超過15,581人類基因編碼蛋白和124種小鼠基因編碼蛋白質(zhì)。這些蛋白廣泛覆蓋受體、轉(zhuǎn)錄因子、激酶、胞外基質(zhì)蛋白、細(xì)胞骨架蛋白等30余種蛋白類型,可用于多種生物學(xué)功能的創(chuàng)新研究。
 

 

蛋白芯片應(yīng)用:


        HuProt™20K人類蛋白組芯片適用于以蛋白質(zhì)相互作用為基礎(chǔ)原理的各種研究領(lǐng)域,具備廣泛的應(yīng)用價值。在蛋白與蛋白相互作用篩選、蛋白與核酸相互作用鑒定方面相比傳統(tǒng)的co-IP聯(lián)合質(zhì)譜鑒定的技術(shù)路線,更加高效和準(zhǔn)確。在小分子藥靶鑒定、單克隆抗體特異性篩選、脂類結(jié)合蛋白篩選、酶作用底物鑒定及自身抗體類biomarker的篩選等應(yīng)用中,其技術(shù)優(yōu)勢不可替代。
 

 

蛋白芯片原理:

蛋白質(zhì)相互作用譜篩選

 

        蛋白質(zhì)在體內(nèi)基本全部以蛋白復(fù)合狀態(tài)發(fā)揮功能,對蛋白復(fù)合物成員的識別和研究是認(rèn)識和理解蛋白功能的關(guān)鍵。高通量HuProt 20K蛋白組芯片是蛋白(抗體)互作譜鑒定的有力工具,通過釣餌蛋白與芯片上包被的~2萬種背景信息清晰的蛋白質(zhì)進(jìn)行互作反應(yīng),能夠極大提高相互作用蛋白的篩選范圍和工作效率。

 

HuProt™20K蛋白組芯片與免疫共沉淀(Co-IP)比較的優(yōu)勢

 

● 無需進(jìn)行克隆構(gòu)建、細(xì)胞培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染等實(shí)驗(yàn);
● 無需免疫沉淀實(shí)驗(yàn),不受靶蛋白表達(dá)量和共沉淀效率影響;
● 直接判定互作蛋白,無需進(jìn)行質(zhì)譜(MS)鑒定;
● 更加直觀、可靠和快速,有效提高工作效率;
● 待測蛋白無特異性抗體仍然可以進(jìn)行檢測;
● 待測蛋白有無純化標(biāo)簽(Tag)都可以檢測;
● 體外實(shí)驗(yàn),覆蓋范圍更廣泛,可鑒定更多互作蛋白類型和靶點(diǎn)。


蛋白芯片應(yīng)用案例:HCV復(fù)制機(jī)制研究--識別宿主細(xì)胞中HCV核心蛋白的結(jié)合蛋白(J Virol. 2013, 87(10): 5718. )

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DNA/RNA結(jié)合蛋白篩選

 

        HuProt™20K 蛋白組芯片可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)與核酸(DNA/RNA)特異性結(jié)合的高通量篩選。該芯片可迅速定位與目的核酸結(jié)合的蛋白質(zhì)及其背后豐富的生物信息,在轉(zhuǎn)錄因子篩選、LncRNA調(diào)控、 RNA毒性、病原微生物侵襲等研究中發(fā)揮重要作用。

 

 

HuProt™20K 篩選核酸結(jié)合蛋白的技術(shù)優(yōu)勢

 

●  無需克隆構(gòu)建、細(xì)胞培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn);
●  無需細(xì)胞核蛋白的提取,不受蛋白表達(dá)水平影響;
●  無需進(jìn)行免疫沉淀實(shí)驗(yàn),不受共沉淀效率影響;
●  與EMSA、ChIP、RIP比較,更適合篩選需求;
●  直接確定結(jié)合蛋白,無需進(jìn)行質(zhì)譜鑒定;
●  快速可靠,各蛋白信息清晰,驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)簡便;
●  體外實(shí)驗(yàn),覆蓋范圍更廣泛,可鑒定更多互作蛋白類型和靶點(diǎn)。


蛋白芯片應(yīng)用案例: 人類蛋白組芯片篩選lncRNA結(jié)合蛋白與lncRNA作用機(jī)理研究經(jīng)典案例(Mol Cell Proteomics. 2013, 1-9)
 

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疾病標(biāo)志物研究:自身抗體譜篩選

 

        腫瘤、炎癥、自身免疫性疾。ㄈ纾杭t斑狼瘡、類風(fēng)關(guān)、克隆氏病、多發(fā)性硬化)等多種疾病中,體內(nèi)產(chǎn)生和累積大量的自身抗體。HuProt™20K蛋白組芯片覆蓋~20000種人類蛋白質(zhì),能夠結(jié)合并大規(guī)模篩選這些人類自身抗體,從而為多種疾病的診斷、預(yù)后、藥效評價等提供豐富候選標(biāo)志物。

 

 

HuProt™ 20K用于biomarker篩選的技術(shù)優(yōu)勢

 

●  芯片覆蓋近2萬種人類蛋白質(zhì),獲得biomarker可能性大;
●  較質(zhì)譜技術(shù)更適用于血清/血漿蛋白篩選;
●  特別適合自身免疫病及自身抗體類疾病標(biāo)志物的篩選;
●  可追溯組織中自身抗體對應(yīng)抗原的異常,理解發(fā)病機(jī)理;
●  可訂制小芯片,用于擴(kuò)大樣本驗(yàn)證實(shí)驗(yàn);
●  研究成果的轉(zhuǎn)化應(yīng)用和開發(fā)有極強(qiáng)便利性。


蛋白芯片應(yīng)用案例:人類蛋白組芯片應(yīng)用于移植排斥標(biāo)志物篩選(Clin J Am Soc Nephro. 2012, 23: 750-763)

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蛋白修飾與酶底物譜鑒定

 

        HuProt™20K蛋白組芯片包含的~2萬種真核生物酵母表達(dá)的人類全長蛋白質(zhì),這些蛋白具備充分的生物活性, 可以為多種蛋白修飾 (如磷酸化、甲基化、乙;⒎核鼗、SUMO化、NEDD化及亞硝基化等) 及酶促反應(yīng)提供大量的候選底物,且每種蛋白生物信息背景清晰。以泛素化檢測為例,如下圖所示:
 

HuProt™20K 用于酶底物譜鑒定的技術(shù)優(yōu)勢

 

●  芯片覆蓋近2萬種人類蛋白質(zhì),通量高,底物鑒定范圍全面;
●  可進(jìn)行多種修飾酶底物譜鑒定,應(yīng)用范圍廣;
●  驗(yàn)證效率高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確、全面、創(chuàng)新性強(qiáng);
●  底物背景信息清晰,方便進(jìn)行生物信息分析和深入機(jī)理解析。


蛋白芯片應(yīng)用案例:人類蛋白組芯片技術(shù)應(yīng)用于FAK激酶新底物篩選識別研究(Int J Biol Sci. 2015, 11(4): 404-410)

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小分子&單抗藥物靶點(diǎn)篩選

 

        化學(xué)小分子和單克隆抗體是目前主要的靶向藥物來源,然而經(jīng)典的藥物研發(fā)體系往往需要15-20年的時間才能開發(fā)出適用于臨床的靶向藥物,且研發(fā)失敗率非常高。

        HuProt™20K 蛋白質(zhì)組芯片作為簡便、快速和準(zhǔn)確的藥物靶點(diǎn)篩選實(shí)驗(yàn)技術(shù),該蛋白芯片可以快速地定性和相對定量地分析經(jīng)過熒光、生物素、放射性同位素標(biāo)記的小分子或單克隆抗體藥物與~2萬種人類全長蛋白質(zhì)的結(jié)合情況,判斷候選分子的結(jié)合靶點(diǎn)和特異性,為藥物研發(fā)體系的改進(jìn)提供強(qiáng)大的技術(shù)保障。
 

ZEB2單抗特異性研究實(shí)例展示

 

A. 檢驗(yàn)HuProt™20K 芯片質(zhì)量:綠色熒光點(diǎn)(anti-GST),紅色熒光點(diǎn)(Positive Control),白色方框(ZEB2蛋白);
B. 競爭藥廠的ZEB2單抗特異性檢測結(jié)果:白色方框(ZEB2蛋白),白色箭頭(抗體結(jié)合非特異蛋白);
C. 本藥廠的ZEB2單抗特異性檢測結(jié)果:白色方框(ZEB2蛋白)。
結(jié)論:本藥廠的ZEB2單抗靶點(diǎn)單一,較競爭藥廠的單抗藥物特異性更強(qiáng),具有更優(yōu)的應(yīng)用價值。


蛋白芯片應(yīng)用案例:人類蛋白組芯片技術(shù)應(yīng)用于單克隆抗體識別研究案例 (Mol Cell Proteomics, 2012, 11(6))

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