T-UCR芯片技術(shù)服務(wù)

   T-UCR芯片技術(shù)服務(wù)

深度研究長鏈非編碼RNA    探索癌癥診斷及預(yù)后標(biāo)志物

    人，小鼠和大鼠基因組中存在481個(gè)完全相同超高保守區(qū)域（UCR）, T-UCR是一類由這些超高保守區(qū)域轉(zhuǎn)錄出來的長鏈非編碼RNA，。T-UCR并不翻譯成蛋白，是一類特殊的長鏈非編碼RNA（LncRNA）。大部分T-UCR的功能仍然未知，但其高度保守性及其在多種組織中的大量表達(dá)表明了其在生物功能中的重要作用。

    T-UCR的表達(dá)類型與表達(dá)量變化已被證明與人類癌癥的生存率息息相關(guān)，包括慢性淋巴細(xì)胞白血病，結(jié)腸癌，原發(fā)性肝癌以及神經(jīng)細(xì)胞瘤等。此外，研究顯示某些T-UCR，特別是uc.73和uc.338能夠作為癌基因啟動(dòng)癌細(xì)胞的大量生長。因此，T-UCR可作為癌癥診斷和預(yù)后的標(biāo)記物，并成為癌癥治療的潛在靶點(diǎn)。

    Arraystar公司作為LncRNA研究先驅(qū)，全球首推人T-UCR芯片。最新推出的這款芯片不僅可以檢測T-UCR的表達(dá)情況，還能檢測UCR及其附近區(qū)域的RNA轉(zhuǎn)錄本，幫助您發(fā)現(xiàn)新的T-UCR。

Arraystar Human T-UCR芯片特點(diǎn)

●  全面可靠的數(shù)據(jù)來源，收錄目前最新的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫預(yù)測的153條潛在T-UCRs

●   獨(dú)特的60nt tiling探針設(shè)計(jì)，全面覆蓋481個(gè)UCRs及上下游1kb區(qū)域，滿足研究者檢測已知T-UCR和發(fā)現(xiàn)新T-UCR的需要

●    準(zhǔn)確檢測UCR及其附近區(qū)域的RNA轉(zhuǎn)錄本，有助于發(fā)現(xiàn)T-UCR對附近蛋白編碼基因的調(diào)控關(guān)系

●   根據(jù)疾病關(guān)聯(lián)的基因區(qū)域?qū)�T-UCR進(jìn)行分類和注釋，讓您輕松探索疾病標(biāo)志物

準(zhǔn)確檢測潛在T-UCR

    T-UCR可在人多種組織中表達(dá)[2]，但其表達(dá)模式仍然未知。為幫助研究者更準(zhǔn)確地研究T-UCR的功能，Arraystar Human T-UCR Microarray收錄權(quán)威數(shù)據(jù)庫如RefSeq，UCSC，Ensembl預(yù)測的153條潛在T-UCRs�？煽康臄�(shù)據(jù)來源確保對T-UCR最新最全面的覆蓋。同時(shí)我們采用了“轉(zhuǎn)錄本特異”的探針設(shè)計(jì)，識(shí)別外顯子和剪接位點(diǎn)，可以準(zhǔn)確檢測由一條原始轉(zhuǎn)錄本經(jīng)可變剪切而產(chǎn)生的多個(gè)可變剪切異構(gòu)體（Figure 1）。

獨(dú)特探針設(shè)計(jì)，發(fā)現(xiàn)新的T-UCR

    Arraystar Human T-UCR Microarray不僅能準(zhǔn)確檢測潛在T-UCR，還能助您發(fā)現(xiàn)新的T-UCR！數(shù)萬探針（60nt tiling探針設(shè)計(jì)，間隔40nt），覆蓋全部481個(gè)UCRs及上下游1kb區(qū)域（figure2），滿足您發(fā)現(xiàn)新T-UCR的需要。

UCR相關(guān)轉(zhuǎn)錄本研究

    一些T-UCR存在于mRNA/LncRNA中，并且在它們的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中起著重要作用，比如可變剪切和mRNA加工。為了揭示T-UCR與這些RNA轉(zhuǎn)錄本之間的潛在功能聯(lián)系，Arraystar T-UCR芯片還對UCR區(qū)域的1518條LncRNA和2261條mRNA的表達(dá)情況進(jìn)行檢測，并區(qū)分正義鏈和反義鏈（Figure 3）。

    此外，一些T-UCR存在于基因間，作為遠(yuǎn)端調(diào)控或組織特異性增強(qiáng)子從而影響到鄰近的蛋白編碼基因的表達(dá)。為了研究這些mRNA，Arraystar T-UCR芯片采用“轉(zhuǎn)錄本特異”的探針設(shè)計(jì)，可以檢測到1809條UCR附近500kb區(qū)域的蛋白編碼轉(zhuǎn)錄本。這些特異性探針的設(shè)計(jì)，和潛在T-UCR探針一樣，可以準(zhǔn)確檢測由一條原始轉(zhuǎn)錄本經(jīng)可變剪切而產(chǎn)生的多個(gè)可變剪切異構(gòu)體（figure 1）。

結(jié)果助您前行

    481個(gè)UCR區(qū)域最初是由Bejerano等[2]從人類基因組hg17 版總結(jié)而來。Arraystar已經(jīng)根據(jù)最新的hg19版對其進(jìn)行更新。我們還將這些T-UCR重新分為三組：外顯子區(qū)，內(nèi)含子區(qū)以及基因間隔區(qū)。更新后的分組有助于明確T-UCR的功能。最后我們還對位于兩類疾病相關(guān)區(qū)域（與癌癥關(guān)聯(lián)的基因區(qū)域CAGR以及脆性位點(diǎn)FRA）的T-UCR進(jìn)行了詳細(xì)注釋，讓您可根據(jù)T-UCR結(jié)果尋找疾病診斷和預(yù)后的生物標(biāo)志物，并探索疾病治療的潛在靶點(diǎn)（Table 1）。

Arraystar 人T-UCR 芯片參數(shù)

★康成獨(dú)家提供技術(shù)服務(wù)
康成生物獨(dú)家為您提供Arraystar公司T-UCR芯片全程技術(shù)服務(wù)，您只需要提供保存完好的組織或細(xì)胞標(biāo)本，康成的芯片技術(shù)服務(wù)人員就可為您完成全部實(shí)驗(yàn)操作，并提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告。

 

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