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晶芯® miRNA微陣列服務(wù)
該芯片技術(shù)服務(wù)通過(guò)先分離低分子量RNA進(jìn)行熒光素標(biāo)記,然后再進(jìn)行芯片雜交和結(jié)果分析,可為客戶提供準(zhǔn)確的、高通量的miRNA分析服務(wù)。
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問(wèn):4804
最后更新:2015-1-16半年訪問(wèn):17
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MicroRNA(miRNA)是細(xì)胞內(nèi)存在的一組由基因組DNA編碼、長(zhǎng)度約22 個(gè)的核苷的非編碼RNA。它們主要通過(guò)降解mRNA和抑制翻譯兩種方式調(diào)控生物體內(nèi)的基因表達(dá),在動(dòng)植物的生長(zhǎng)發(fā)育、細(xì)胞的分化和凋亡以及人類疾病的發(fā)生(如腫瘤)等過(guò)程中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。博奧推出的哺乳動(dòng)物micro RNA芯片V3.0針對(duì)人677(包含Nature 雜志預(yù)測(cè)的有122個(gè)miRNA, Nature 2005, 434, 338-345.)、小鼠461個(gè),大鼠292個(gè)成熟micro RNA。由于三者的miRNA保守性比較強(qiáng),具有很多共同的序列,取三者的并集,一共設(shè)計(jì)了924條探針(數(shù)據(jù)來(lái)自2007年8月Sanger miRNA的數(shù)據(jù)庫(kù):miRBase 10.0)。博奧推出的哺乳動(dòng)物micro RNA芯片V2.0針對(duì)人576(包含Nature 雜志預(yù)測(cè)的有122個(gè)miRNA, Nature 2005, 434, 338-345.)、小鼠358個(gè),大鼠238個(gè)成熟micro RNA。由于三者的miRNA保守性比較強(qiáng),具有很多共同的序列,取三者的并集,一共設(shè)計(jì)了743條探針(數(shù)據(jù)來(lái)自2006年7月Sanger的數(shù)據(jù)庫(kù):miRBase 8.2)。博奧推出的植物micro RNA芯片V2.0針對(duì)Sanger數(shù)據(jù)庫(kù)中2007年2月份植物全部的994條序列,去了冗余后,剩余了348個(gè)miRNA;然后加上了Zhu Jian-Kang在《Cell》上預(yù)測(cè)的4個(gè),中科院遺傳與發(fā)育所預(yù)測(cè)的74個(gè),芯片上一共有426個(gè)miRNA對(duì)應(yīng)的探針。該芯片技術(shù)服務(wù)通過(guò)先分離低分子量RNA進(jìn)行熒光素標(biāo)記,然后再進(jìn)行芯片雜交和結(jié)果分析,可為客戶提供準(zhǔn)確的、高通量的miRNA分析服務(wù)。
1 、三種陽(yáng)性對(duì)照
★ 用于檢測(cè)探針在芯片上固定的陽(yáng)性對(duì)照:用Hex 標(biāo)記的寡核苷酸點(diǎn)片作為片基、點(diǎn)樣和探針固定的質(zhì)控
★ 用于檢測(cè)雜交的陽(yáng)性對(duì)照(內(nèi)源陽(yáng)性對(duì)照):用U6RNA和tRNA作為miRNA芯片的內(nèi)源陽(yáng)性對(duì)照
★ 芯片系統(tǒng)的陽(yáng)性對(duì)照(外參對(duì)照):用外源性序列互補(bǔ)的Oligo探針和重組miRNA摻入到實(shí)驗(yàn)的整個(gè)過(guò)程作為系統(tǒng)陽(yáng)性對(duì)照
2 、陰性對(duì)照
★ 陰性對(duì)照設(shè)計(jì)了兩種,一種是空白點(diǎn)樣液體;另外一種是外源性無(wú)互補(bǔ)序列的探針,由于沒(méi)有摻入對(duì)應(yīng)的miRNA,其結(jié)果為陰性。陰性對(duì)照預(yù)期的雜交信號(hào)值很弱,它們的信號(hào)值不足以進(jìn)入到后續(xù)的數(shù)據(jù)分析當(dāng)中。


服務(wù)流程
★ 組織塊和細(xì)胞RNA的提取
★ miRNA的分離
★ miRNA樣品的熒光標(biāo)記
★ 雜交與清洗
★ 芯片掃描
★ 數(shù)據(jù)分析


服務(wù)優(yōu)勢(shì)
★ 一次實(shí)驗(yàn)可檢測(cè)已知的全部哺乳動(dòng)物和植物的miRNA的表達(dá)情況,通量高
★ 通過(guò)聚類、SAM等數(shù)據(jù)分析,可以比較不同組織中miRNA表達(dá)的差異情況
★ 芯片miRNA的檢測(cè)較傳統(tǒng)的Northern Blot分析,敏感性和特異性較高
★ 擁有一套先進(jìn)的芯片實(shí)驗(yàn)質(zhì)控體系,對(duì)芯片制作及實(shí)驗(yàn)全過(guò)程實(shí)施嚴(yán)格的質(zhì)控,保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確、可靠


訂購(gòu)信息 產(chǎn)品編號(hào) 產(chǎn)品名稱 探針數(shù)目
225010 晶芯® 哺乳動(dòng)物miRNA微陣列芯片服務(wù)V1.0 509
225011 晶芯® 哺乳動(dòng)物miRNA微陣列芯片服務(wù)V2.0 743
225012 晶芯® 哺乳動(dòng)物miRNA微陣列芯片服務(wù)V3.0 924
225110 晶芯® 植物miRNA微陣列芯片服務(wù)V1.0 308
225111 晶芯® 植物miRNA微陣列芯片服務(wù)V2.0 426
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