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晶芯®轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片技術(shù)服務(wù)
轉(zhuǎn)錄因子是細(xì)胞內(nèi)一類重要的基因表達(dá)調(diào)控蛋白,它通過與基因上游啟動(dòng)子區(qū)中特異的DNA序列的相互作用,來決定被調(diào)控基因的開啟和關(guān)閉以及表達(dá)量。
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問:4705
最后更新:2015-1-16半年訪問:30
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服務(wù)描述
轉(zhuǎn)錄因子是細(xì)胞內(nèi)一類重要的基因表達(dá)調(diào)控蛋白,它通過與基因上游啟動(dòng)子區(qū)中特異的DNA序列的相互作用,來決定被調(diào)控基因的開啟和關(guān)閉以及表達(dá)量。一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子可調(diào)控?cái)?shù)百個(gè)基因的表達(dá),而一個(gè)基因的表達(dá)又可受數(shù)個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控。轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)和功能缺陷,與人類的一些疾。ㄈ缒[瘤和炎癥)相關(guān),許多轉(zhuǎn)錄因子還是藥物作用的靶點(diǎn)。所以,轉(zhuǎn)錄因子活性的檢測(cè)對(duì)疾病的研究和藥物開發(fā)都非常有意義。轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片是基于博奧獨(dú)創(chuàng)的專利技術(shù)OATFA(Oligonucleotide Array-based Transcription Factor Assay)所開發(fā)的一種新型分析芯片。OATFA技術(shù)結(jié)合了凝膠滯留和DNA微陣列的優(yōu)點(diǎn),實(shí)現(xiàn)對(duì)轉(zhuǎn)錄因子蛋白的快速、高通量檢測(cè),可對(duì)細(xì)胞中上百種轉(zhuǎn)錄因子活性狀況進(jìn)行考察,給出細(xì)胞中某一時(shí)刻轉(zhuǎn)錄因子活性狀況的全景圖。

樣品接收單表格下載:
1、博奧轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片樣品接收單

產(chǎn)品特點(diǎn)
★ 探針設(shè)計(jì)來源于商品化的TRANSFAC數(shù)據(jù)庫(BIOBASE),采用模擬退火(Simulated Annealing)的優(yōu)化算法,最大限度的排除了交叉結(jié)合和交叉雜交的可能性
★ 點(diǎn)陣設(shè)計(jì)中加入了多種質(zhì)控對(duì)照點(diǎn),包括陽性對(duì)照和陰性對(duì)照,保證了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確可靠
★ 人源轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片共包括280條轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合序列,可以同時(shí)檢測(cè)270多種轉(zhuǎn)錄因子。與小鼠的同源性高達(dá)70%,與大鼠的同源性為40%;酵母轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片可以檢測(cè)酵母全基因組規(guī)模的96種轉(zhuǎn)錄因子
★ 優(yōu)化的高保真單引物線性擴(kuò)增的方法(SPA),在提高靈敏度的同時(shí),嚴(yán)格遵守探針之間原有的定量關(guān)系

服務(wù)流程
★ 生物樣品(組織或細(xì)胞)
★ 抽提核蛋白,蛋白濃度測(cè)定
★ 核蛋白與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合序列(Probe Mix)的混合物共同孵育
★ 分離回收與核蛋白中轉(zhuǎn)錄因子發(fā)生結(jié)合的Probes
★ 擴(kuò)增并熒光標(biāo)記
★ 芯片雜交
★ 芯片掃描
★ 數(shù)據(jù)分析
★ 數(shù)據(jù)保存和結(jié)果報(bào)告

服務(wù)優(yōu)勢(shì)
★ 高通量:一次實(shí)驗(yàn)可以完成上百種轉(zhuǎn)錄因子的活性檢測(cè),可大大降低逐一檢測(cè)的成本
★ 高靈敏度:在標(biāo)記過程中引入了擴(kuò)增技術(shù),使檢測(cè)靈敏度有了顯著的提高
★ 準(zhǔn)確:成對(duì)樣本可以在同一張芯片上進(jìn)行雜交分析,提高了檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性
★ 重復(fù)性好:由于采用了優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)流程和輔助工具,使實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性R>0.95
★ 嚴(yán)格的質(zhì)控:為了保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性,芯片上設(shè)計(jì)了多種質(zhì)控參照
★ 強(qiáng)有力的文章支持:本芯片是由我們公司自主研發(fā)的服務(wù)平臺(tái),該技術(shù)的探索性文章(OATFA技術(shù))就發(fā)表在Journal of Proteome Research(IF>6)上,后續(xù)的生物應(yīng)用文章正在向更高質(zhì)量的雜志投稿
★ 專業(yè)的服務(wù)隊(duì)伍:轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片技術(shù)服務(wù)的負(fù)責(zé)人就是該技術(shù)的創(chuàng)始人之一,對(duì)整個(gè)平臺(tái)的細(xì)節(jié)及該技術(shù)的國際進(jìn)展有很強(qiáng)的把握能力,提供技術(shù)服務(wù)的同時(shí)可以給予客戶更深層次的建議

參考文獻(xiàn)
· Shao, W., Wei, H., Qiao, J., Zhao, Y., Sun, Y., Zhou, Y. and Cheng, J. (2005)."Parallel profiling of active transcription factors using an oligonucleotide array-based transcription factor assay (OATFA)"Journal of Proteome Research, 4(4): 1451-1456. (鏈接文獻(xiàn))

訂購信息
產(chǎn)品編號(hào) 服務(wù)名稱 轉(zhuǎn)錄因子數(shù)
230010 晶芯® 人轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片服務(wù) 270
230020 晶芯® 酵母轉(zhuǎn)錄因子活性譜芯片服務(wù) 96
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