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ChIP-on-Chip 嵌合芯片技術(shù)服務(wù)
Tiling Array(中文譯為“嵌合芯片”)是迄今為止分辨率最高的基因芯片類型,Tiling Array的探針設(shè)計(jì)幾乎涵蓋了目標(biāo)DNA的全部序列。
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問:5364
最后更新:2015-1-16半年訪問:27
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服務(wù)描述
GeneChip® Tiling Array 技術(shù)簡介
Tiling Array(中文譯為“嵌合芯片”)是迄今為止分辨率最高的基因芯片類型,Tiling Array的探針設(shè)計(jì)幾乎涵蓋了目標(biāo)DNA的全部序列。目前為止,Affymetrix公司已經(jīng)開發(fā)出了人、小鼠、酵母、線蟲、擬南芥等模式生物的全基因組Tiling芯片,為全基因組規(guī)模上研究目的蛋白與核酸的相互作用提供了強(qiáng)有力的分析工具。

GeneChip® Tiling Array除了全基因組芯片外,還包括了專門應(yīng)用于ChIP-chip技術(shù)中的人啟動子和小鼠啟動子兩款芯片,探針設(shè)計(jì)覆蓋了轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近10kb的范圍,針對腫瘤相關(guān)的1300個基因中,覆蓋范圍更增加到12.5kb。

此外,Affymetrix公司提供了包括GCOS, TAS和IGB在內(nèi)的完整的數(shù)據(jù)處理體系,為客戶發(fā)表高質(zhì)量的文章提供了強(qiáng)有力的保障。


服務(wù)流程
★ 客戶需要提供足夠量生物樣品和具有ChIP活性的轉(zhuǎn)錄因子的抗體
★ 對生物樣品進(jìn)行甲醛交聯(lián)
★ 超聲破碎基因組DNA
★ 染色質(zhì)免疫共沉淀
★ 熒光標(biāo)記
★ 芯片雜交
★ 芯片掃描
★ 數(shù)據(jù)分析
★ 數(shù)據(jù)保存和結(jié)果報告

服務(wù)優(yōu)勢 ★ 高通量:一次實(shí)驗(yàn)可以完成某個轉(zhuǎn)錄因子對全基因組范圍內(nèi)的2萬多個基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究,如果選擇全基因組嵌合芯片,可以考察某個DNA結(jié)合蛋白的結(jié)合位點(diǎn)在全基因組的分布情況。
★ 品種全:物種包括了人、小鼠、線蟲、酵母、擬南芥、果蠅等諸多模式生物。
★ 嚴(yán)謹(jǐn)?shù)臄?shù)據(jù)處理體系:Affymetrix公司提供了包括GCOS, TAS和IGB在內(nèi)的完整的數(shù)據(jù)處理體系,為客戶發(fā)表高質(zhì)量的文章提供了強(qiáng)有力的保障。
★ 強(qiáng)大的文章支持:Affymetrix公司在Nature,Cell等頂級雜志上發(fā)表了多篇Tiling Array應(yīng)用方面的高質(zhì)量文章。
★ 專業(yè)的服務(wù)隊(duì)伍:本公司的ChIP-Chip技術(shù)平臺上投入了多位分子生物學(xué)和生物信息學(xué)的專家,除了為客戶提供全方位的服務(wù)外,還可參與到對方的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)之中,為發(fā)表高質(zhì)量的文章獻(xiàn)計(jì)獻(xiàn)策。

參考文獻(xiàn)
· Carroll J, et al. Chromosome-Wide Mapping of Estrogen Receptor Binding Reveals Long-Range Regulation Requiring the Forkhead Protein FoxA1. Cell, Vol. 122, 33-43, July 12, 2005.
· Cawley S et al., Unbiased mapping of transcription factor binding sites along human chromosomes 21 and 22 points to widespread regulation of noncoding RNAs. Cell. 2004 Feb 20;116(4):499-509. PMID: 14980218.
· Bernstein B et al. Genomic Maps and Comparative Analysis of Histone Modification in Human and Mouse. Cell Vol 120, 169-181. January 28, 2005.
· Bernstein B et al. A Bivalent Chromatin Structure Marks Key Developmental Genes in Embryonic Stem Cells. Cell. 2006 April 21; 125: 315-326.

訂購信息
產(chǎn)品編號. 產(chǎn)品名稱 產(chǎn)品描述
AFFY-900775 GeneChip® 人啟動子 1.0R 芯片服務(wù) 25,500個基因,1張芯片
AFFY-900774 GeneChip® 人Tiling 1.0R 芯片服務(wù) 14張芯片
AFFY-900772 GeneChip® 人Tiling 2.0R 芯片服務(wù) 7張芯片
AFFY-900543 GeneChip® 人ENCODE11.0F芯片服務(wù) 1張芯片
AFFY-900544 GeneChip® 人ENCODE11.0R芯片服務(wù) 1張芯片
AFFY-900545 GeneChip® 人染色體21/22 1.0F芯片服務(wù) 3張芯片s
AFFY-900546 GeneChip® 人染色體21/22 1.0R芯片服務(wù) 3張芯片
AFFY-900936 GeneChip® 人染色體21/22 2.0F芯片服務(wù) 1張芯片
AFFY-900889 GeneChip® 小鼠啟動子 1.0R 芯片服務(wù) 25,500個基因,1張芯片
AFFY-900853 GeneChip® 小鼠Tiling 1.1R 芯片服務(wù) 14張芯片
AFFY-900852 GeneChip® 小鼠Tiling 2.0R 芯片服務(wù) 7張芯片
AFFY-900594 GeneChip® 擬南芥Tiling 1.0R 芯片服務(wù) 1張芯片
AFFY-900935 GeneChip® 線蟲Tiling 1.0R 芯片服務(wù) 1張芯片
AFFY-900645 GeneChip® 釀酒酵母Tiling 1.0R 芯片服務(wù) 1張芯片
AFFY-900647 GeneChip® 裂殖酵母Tiling 1.0FR 芯片服務(wù) 1張芯片
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