English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
當(dāng)前位置 > 技術(shù)服務(wù) > 生物研發(fā)服務(wù)> 芯片與生物信息學(xué) > 表達(dá)譜芯片服務(wù)
表達(dá)譜芯片服務(wù)
基因表達(dá)譜芯片是最早實現(xiàn)從高通量的角度檢測全基因組差異基因表達(dá)的平臺。
服務(wù)類別：芯片與生物信息學(xué)總訪問：1016
最后更新：2019-1-18半年訪問：42
參考報價：
立即詢價 電話咨詢
[發(fā)表評論] [本類其他服務(wù)] [本類其他服務(wù)商]
服務(wù)商： 上海鯨舟基因科技有限公司 查看該公司所有服務(wù) >>
  • 服務(wù)介紹
  • 公司簡介
 一、Agilent表達(dá)譜芯片
基因表達(dá)譜芯片是最早實現(xiàn)從高通量的角度檢測全基因組差異基因表達(dá)的平臺。為方便廣大科研工作者轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)篩選分析，中科普瑞引進(jìn)Agilent表達(dá)譜芯片檢測平臺，為您的轉(zhuǎn)錄組mRNA檢測和分析提供全方位的服務(wù)。在美國FDA組織的MAQC中，作為眾多參與該計劃的芯片制造商之一，Agilent的表達(dá)譜芯片產(chǎn)品無論從檢出率，芯片的跨平臺比較，數(shù)據(jù)重復(fù)性，平均CV，還是與qPCR的一致性等方面，均表現(xiàn)出卓越的性能。

Agilent表達(dá)譜芯片特點
  • 獨特的噴墨原位合成技術(shù)；
  • 探針長度60 mer，同時兼顧較高的靈敏性和特異性；
  • 由于探針設(shè)計較長，芯片檢出率高，有利于捕捉對生命活動有更重要意義的低豐度基因；
  • 芯片隨信息庫及時更新，基因信息更新更全，可不斷升級到高級芯片版本；
  • 靈活的定制方案，客戶可任意制作自己的芯片，僅需基因組或EST序列；
  • 平均CV＜10% (MAQC: Nature Biotechnology Sept, 2006）；
  • 芯片具有良好的可重復(fù)性，相關(guān)系數(shù)R2＞0.95 (MAQC)；
  • 芯片數(shù)據(jù)結(jié)果與qPCR數(shù)據(jù)結(jié)果具有良好的相關(guān)性，相關(guān)系數(shù)R2＞0.9 (MAQC)。
Agilent表達(dá)譜芯片類型及參數(shù)
未標(biāo)題-5.jpg
其它物種表達(dá)譜芯片或定制芯片
擬南芥、玉米、水稻、煙草、牛、雞、狗、馬、豬、羊、兔、猴、蛙、三文魚、斑馬魚、線蟲、蚊子、果蠅、酵母、大腸桿菌、稻瘟菌（更多物種或需要定制請咨詢銷售人員）
樣品要求（非FFPE樣本）
        1. 樣品純度：OD 260/280值應(yīng)在1.9～2.2 之間；DNA 應(yīng)該去除干凈；
        2. 樣本完整性：Agilent 2100 RIN≥ 7，且28S/18S≥ 0.7；
        3. 樣品濃度：低濃度不低于100ng/µl；
        4. 樣品總量：每個樣品總量不少于2µg；
        5. 樣品溶劑：要溶解在RNase-free H20或RNase-free TE (pH 8.0)中；
        6. 樣品運輸：RNA用凍存管保存，并用干冰或液氮運輸。
Agilent表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)分析 

blob.png

 
基礎(chǔ)分析
1. 原始數(shù)據(jù)處理分析 1）數(shù)據(jù)歸一化
2）箱線圖
3）樣本聚類圖
4）樣本相關(guān)性分析
5）主成份分析 (PCA)
2. 差異基因篩選 1）表達(dá)差異基因篩選
2）散點圖
3）火山圖
4）差異基因?qū)蛹壘垲悷釄D
3.   差異mRNA功能分析（GO/KEGG）
Agilent表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)分析展示
  1. 原始數(shù)據(jù)處理分析
  2. 差異基因篩選                              
blob.png
 
  1. 差異mRNA功能分析（GO/KEGG）
blob.png                               
 
  1. 信號通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建（Pathway-Networkblob.png
    Pathway-Network

  2. 基因相互作用網(wǎng)絡(luò)圖blob.png
    基因相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

  3. 轉(zhuǎn)錄因子分析及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
  4. motif分析，從而推測差異基因中有哪些基因可能直接受該轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)。最后結(jié)果會用統(tǒng)計學(xué)方法進(jìn)行檢驗，找到調(diào)控目標(biāo)生物性狀，統(tǒng)計學(xué)上有顯著差別的轉(zhuǎn)錄因子。找到差異的轉(zhuǎn)錄因子及其調(diào)控的靶基因，我們可以構(gòu)建TF-network，從中得出關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄因子及被關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄調(diào)控的基因，系統(tǒng)的研究轉(zhuǎn)錄因子與基因的調(diào)控關(guān)系。
blob.png
轉(zhuǎn)錄因子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
 
  1. 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建(Coexpression Network)
  2. Coexpression Network）是根據(jù)基因表達(dá)信號值的動態(tài)變化，計算基因間的共表達(dá)關(guān)系，得到基因間的表達(dá)調(diào)控關(guān)系及調(diào)控方向，從而構(gòu)建基因的表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。利用共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖，研究者可通過分析基因調(diào)控能力，獲得樣本隨實驗變化的核心調(diào)控基因。
  3. 3個或3個以上生物學(xué)重復(fù)blob.png
  4. 時間序列的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)
    blob.png
  5. 分子建模預(yù)測(MAKER 預(yù)測)
blob.png
MAKER 預(yù)測
二、中科普瑞基因芯片服務(wù)平臺
高標(biāo)準(zhǔn) — 擁有15年以上科技服務(wù)實驗和分析技術(shù)經(jīng)驗的團(tuán)隊成員以GLP-like質(zhì)量管理體系為您的基因芯片服務(wù)體系全線保駕護(hù)航。
高效率 — 樣品質(zhì)檢合格后，15個工作日出具結(jié)果報告，專屬生物信息和技術(shù)支持服務(wù)人員為您提供在線結(jié)果咨詢和解釋服務(wù)。
高質(zhì)量 — 符合3大基因芯片廠商質(zhì)量要求的服務(wù)質(zhì)量體系，項目質(zhì)量管理專員負(fù)責(zé)對您的項目全程跟蹤和質(zhì)控。
blob.png
 
bio-equip.com
售后服務(wù)
快速詢價 請 登錄 或 注冊在線詢價　(請留下您的聯(lián)系方式，以便供應(yīng)商聯(lián)系您)
* 姓 　名：
* 地　 區(qū)：
* 單　 位：
職　 位：
* 手機(jī)/電話：
* E-mail：
請寄產(chǎn)品資料：
 需要 不需要
請報價格：
 需要報價 不需要報價
留 　言：
驗證碼：
 換一張
發(fā)表評論在線評論（0條）
您最近瀏覽過的服務(wù)
關(guān)于我們 | 法律聲明 | 廣告報價 | English | 網(wǎng)站地圖
Copyright(C) 1998-2024 生物器材網(wǎng) 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com
立即詢價