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MassARRAY® DNA 甲基化分析定制服務(wù)
MassARRAY®EpiTYPER™ DNA 甲基化分析技術(shù)結(jié)合了堿基特異性酶切反應(yīng)和 MALDI-TOF 檢測(cè)原理用于DNA 甲基化定量分析。
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問(wèn):5721
最后更新:2015-1-16半年訪問(wèn):35
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MassARRAY®EpiTYPER™ DNA 甲基化分析技術(shù)結(jié)合了堿基特異性酶切反應(yīng)和 MALDI-TOF 檢測(cè)原理用于DNA 甲基化定量分析?蓪(shí)現(xiàn)多重 CpG 的分析檢測(cè),是用于 DNA 甲基化定量分析及在基因組任何區(qū)域或者候選基因中鑒定甲基化定量分析的首選方法。

堿基特異性酶切(MassCLEAVE)實(shí)驗(yàn)由亞硫酸鹽處理待測(cè) DNA 開(kāi)始。經(jīng)過(guò)亞硫酸鹽處理,DNA中的未甲基化的胞嘧啶 (C) 轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ║),由此在 DNA 模板中產(chǎn)生甲基化特異的序列變化。利用 5' 末端帶有T7-啟動(dòng)子的引物進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng) SAP (蝦堿性磷酸酶)處理后用于堿基特異性的酶切反應(yīng)。酶切后 DNA 片段的大小和分子量取決于亞硫酸鹽處理后的堿基變化,飛行質(zhì)譜能測(cè)出每個(gè)片段的分子量,配套軟件 EpiTYPER 則能自動(dòng)報(bào)告每個(gè)相應(yīng)片段的甲基化程度。
 
服務(wù)流程
   客戶提供 DNA 或者生物樣本
   樣本前處理
   PCR 擴(kuò)增、SAP、Transcription、Cleavage
   點(diǎn)樣
   質(zhì)譜檢測(cè)
   分析報(bào)告
 
技術(shù)特點(diǎn)
   高性能
●   能夠分析覆蓋長(zhǎng)達(dá) 600bp 的多個(gè) CpG 位點(diǎn)
●   能夠分析福爾馬林處理的石蠟組織
●   無(wú)需任何熒光標(biāo)記
   高靈敏度
●   精度高(5%CV)
●   檢測(cè)低至 5% 的甲基化水平
●   分析需要的起始樣本量少(<5pg)
   高性價(jià)比
●   用384孔板進(jìn)行 PCR 反應(yīng)
●   一個(gè)擴(kuò)增產(chǎn)物可以進(jìn)行多重 CpG位點(diǎn)分析
●   無(wú)需后續(xù)驗(yàn)證,可直接發(fā)表結(jié)果
   操作簡(jiǎn)便
●   無(wú)需設(shè)計(jì) CpG 位點(diǎn)特異性引物
●   無(wú)需進(jìn)行 PCR 產(chǎn)物純化
●   研究幾個(gè)到幾百個(gè)甲基化位點(diǎn)的理想手段
 
參考文獻(xiàn)
   HEIJMANS, B., et al. (2007) “Heritable rather than age-related environmental and stochastic factors dominate variation in DNA methylation of the human 1GF2/H19 locus” Hum Mol Genet 16(5):547-54.
   RAVAL, A., et al. (2007). “Downregulation of Death-Associated Protein Kinase 1(DAPK1) in chronic lymphocytic leukemia.” Cell 129: 879-90.
   RICHTER, E., et al. (2007). “A role for DNA methylation in regulating the growth suppressor PMEPA1 gene in prostate cancer.” Epigenetics 2(2):100-105.
 
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產(chǎn)品描述
290050
Sequenom MassArray®DNA甲基化分析定制服務(wù)
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