甲基化芯片數(shù)據(jù)分析服務(wù)

CPG,microarray

敏芯科技為您提供甲基化芯片數(shù)據(jù)分析服務(wù)

服務(wù)類別：	芯片與生物信息學(xué)	總訪問：	2359
最后更新：	2014-4-1	半年訪問：	26
參考報(bào)價(jià)：	021-31523052
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服務(wù)商：上海敏芯信息科技有限公司

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甲基化芯片分析方案

項(xiàng)目一、原始數(shù)據(jù)的處理及歸一化（必選）

為了消除實(shí)驗(yàn)的誤差、生物樣品個(gè)體差異及噪聲等產(chǎn)生的影響，將數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化處理。

項(xiàng)目二、芯片探針重注釋（條件必選）

如果該芯片中的探針注釋并非由基因組序列設(shè)計(jì)產(chǎn)生，而是由實(shí)驗(yàn)克隆測(cè)序直接生成序列，在向基因組BLAST比對(duì)的時(shí)候，有時(shí)會(huì)沒有對(duì)應(yīng)。需要對(duì)其進(jìn)行重新注釋，獲得探針的基因組序列。

項(xiàng)目三、基因重注釋（條件必選）

我們將原有的基因列表進(jìn)行了重新注釋，原有的注釋一般只提供了CpG島位于哪個(gè)基因之內(nèi)，即within, 實(shí)際上一個(gè)啟動(dòng)子的范圍要大得多，因此我們加入了一些CpG島上游（upstream）和下游基因(downstream)的注釋。

項(xiàng)目四：差異CpG島的篩選（必選）

取表達(dá)2倍差異的基因：

項(xiàng)目五：轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)分析（推薦）

] 掃描CpG島區(qū)域的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。因?yàn)橐话闱闆r下甲基化會(huì)使轉(zhuǎn)錄因子與DNA的結(jié)合力下降，導(dǎo)致基因轉(zhuǎn)錄水平的降低。因此轉(zhuǎn)錄因子的分析可以解釋甲基化導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄抑制的機(jī)理。

項(xiàng)目六：甲基化顯著基因的Gene Ontology分析（推薦）

項(xiàng)目七：甲基化顯著基因的pathway分析（推薦）

項(xiàng)目八：基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建（可選）

項(xiàng)目九：甲基化與基因表達(dá)的相關(guān)性分析（可選）

詳情請(qǐng)查看公司網(wǎng)站：

上海敏芯信息科技有限公司

上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年10月，是國(guó)內(nèi)知名的生物信息學(xué)服務(wù)提供商。隨著業(yè)務(wù)擴(kuò)展，公司已經(jīng)發(fā)展成為國(guó)內(nèi)第一家專業(yè)提供系統(tǒng)生物學(xué)服務(wù)的高科技企業(yè)，提供包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)相關(guān)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)檢測(cè)、數(shù)據(jù)分析、結(jié)果驗(yàn)證及論文修改的全面解決方案。公司已獲得國(guó)家及上海市中小企業(yè)創(chuàng)新基金、上海市科技創(chuàng)新行動(dòng)計(jì)劃、上海市大學(xué)生創(chuàng)業(yè)基金、上海市專利試點(diǎn)企業(yè)、上海市技術(shù)成果轉(zhuǎn)化認(rèn)證、上海市楊浦區(qū)人才資助資金等多項(xiàng)國(guó)家及省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)。

具體業(yè)務(wù)包括：

-基因芯片：表達(dá)譜芯片、miRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、Exon芯片、Tilling芯片、lncRNA芯片等實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析

- 高通量測(cè)序：miRNA測(cè)序、mRNA測(cè)序、基因組重測(cè)序、甲基化測(cè)序、ChIP-Seq等實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析

-蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)芯片（SELDI）、細(xì)胞因子芯片、ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D等

- 代謝組學(xué)：液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）、氣質(zhì)聯(lián)用（GC-MS）及核磁共振（NMR）的實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析

- 文獻(xiàn)挖掘：提供基于pubmed數(shù)據(jù)庫的關(guān)鍵詞搜索服務(wù)

- 生物信息培訓(xùn)：定期舉辦綜合性生物信息培訓(xùn)班，并提供上門培訓(xùn)服務(wù)及隨到隨學(xué)班

u 專利代理：提供生命科學(xué)領(lǐng)域的專利寫作、專利潤(rùn)色及專利申請(qǐng)服務(wù)

- 實(shí)驗(yàn)服務(wù)：引物設(shè)計(jì)、RT-PCR、3730測(cè)序、Western Blot、2D-MS等

目前，公司國(guó)內(nèi)外客戶已超過500家，合作發(fā)表了50多篇高影響因子的SCI(影響因子累計(jì)超過100分)，并參與多項(xiàng)國(guó)家科研項(xiàng)目的申請(qǐng)與實(shí)施。

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