lncRNA芯片實驗及數(shù)據(jù)分析服務(wù)

lncRNA, lincRNA, ncRNA

獨家提供lncRNA最全面且權(quán)威的lncRNA實驗及數(shù)據(jù)分析服務(wù)，包括已知lncRNA鑒定、新lncRNA預(yù)測，lncRNA靶基因預(yù)測、反向lncRNA預(yù)測等多種服務(wù)

服務(wù)類別：	芯片與生物信息學(xué)	總訪問：	4193
最后更新：	2014-4-1	半年訪問：	18
參考報價：	021-31523052
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服務(wù)商：上海敏芯信息科技有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡介

lncRNA芯片實驗及數(shù)據(jù)分析服務(wù)

實驗測試服務(wù)：

采用進(jìn)行芯片實驗操作,實驗流程略

數(shù)據(jù)分析服務(wù)：

1. 均一化及差異lncRNA篩選

對芯片產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理、均一化后，利用統(tǒng)計學(xué)方法篩選出差異表達(dá)LncRNA

2. 差異lncRNA重注釋

3.lncRNA靶基因的功能及代謝通路分析

由于lncRNA芯片的注釋不太完善，且注釋的準(zhǔn)確性不高，需要將差異lncRNA在基因組上進(jìn)行重定位，確定其在染色體上的位置及與其他基因的關(guān)系。

我們將靶基因向gene ontology數(shù)據(jù)庫的各節(jié)點映射，計算每個節(jié)點的基因數(shù)目，另外，我們使用GenMAPP v2.1將靶基因向KEGG pathway數(shù)據(jù)庫映射，并統(tǒng)計基因在每個pathway中的富集程度（enrichment p-value）。

4.cis靶基因預(yù)測

Cis作用是lncRNA的一種靶基因作用方式。我們利用基因組注釋和基因組瀏覽器鑒定lncRNA的可能的靶基因。

5.trans靶基因預(yù)測

trans作用是lncRNA的另一種靶基因作用方式。我們利用RNAplex等鑒定lncRNA的可能的靶基因。

6. lncRNA轉(zhuǎn)錄因子分析

提取LncRNA轉(zhuǎn)錄起始位點上下游序列。轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫使用TRANSFAC 7.0 public（動物）或PlantCARE(植物)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測。

7.反向lncRNA靶基因預(yù)測

從您感興趣的已知基因開始（例如p53，COX-2等與腫瘤等密切相關(guān)的基因），利用我們的lncRNA數(shù)據(jù)庫和靶基因預(yù)測軟件pipeline，找到潛在的調(diào)節(jié)這些基因的lncRNA。

8.LncRNA轉(zhuǎn)錄本信息查詢

可針對客戶最終關(guān)注的LncRNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本信息確認(rèn)，提供去除內(nèi)含子的LncRNA序列信息及與相關(guān)基因的定位

上海敏芯信息科技有限公司

上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年10月，是國內(nèi)知名的生物信息學(xué)服務(wù)提供商。隨著業(yè)務(wù)擴展，公司已經(jīng)發(fā)展成為國內(nèi)第一家專業(yè)提供系統(tǒng)生物學(xué)服務(wù)的高科技企業(yè)，提供包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)相關(guān)的實驗設(shè)計、實驗檢測、數(shù)據(jù)分析、結(jié)果驗證及論文修改的全面解決方案。公司已獲得國家及上海市中小企業(yè)創(chuàng)新基金、上海市科技創(chuàng)新行動計劃、上海市大學(xué)生創(chuàng)業(yè)基金、上海市專利試點企業(yè)、上海市技術(shù)成果轉(zhuǎn)化認(rèn)證、上海市楊浦區(qū)人才資助資金等多項國家及省部級獎勵。

具體業(yè)務(wù)包括：

-基因芯片：表達(dá)譜芯片、miRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、Exon芯片、Tilling芯片、lncRNA芯片等實驗及數(shù)據(jù)分析

- 高通量測序：miRNA測序、mRNA測序、基因組重測序、甲基化測序、ChIP-Seq等實驗及數(shù)據(jù)分析

-蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)芯片（SELDI）、細(xì)胞因子芯片、ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D等

- 代謝組學(xué)：液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）、氣質(zhì)聯(lián)用（GC-MS）及核磁共振（NMR）的實驗及數(shù)據(jù)分析

- 文獻(xiàn)挖掘：提供基于pubmed數(shù)據(jù)庫的關(guān)鍵詞搜索服務(wù)

- 生物信息培訓(xùn)：定期舉辦綜合性生物信息培訓(xùn)班，并提供上門培訓(xùn)服務(wù)及隨到隨學(xué)班

u 專利代理：提供生命科學(xué)領(lǐng)域的專利寫作、專利潤色及專利申請服務(wù)

- 實驗服務(wù)：引物設(shè)計、RT-PCR、3730測序、Western Blot、2D-MS等

目前，公司國內(nèi)外客戶已超過500家，合作發(fā)表了50多篇高影響因子的SCI(影響因子累計超過100分)，并參與多項國家科研項目的申請與實施。

售后服務(wù)

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