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免疫方向研究思路精選!

瀏覽次數(shù):3885 發(fā)布日期:2017-9-21  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

在“蛋白組學在臨床科研中的應(yīng)用”這一系列的文章中,我們分享了眼科、內(nèi)分泌、心血管、神經(jīng)等方面的研究思路。今天我們來介紹一個非常重要的,并且離不開蛋白質(zhì)組學研究的一個學科——免疫方向的科研套路,哦不,是思路。

話不多說,滿滿干貨!

 

第一篇,      強直性脊椎炎

雜志:Cts-Clin Transl Sci

時間:2015

IF: 1.052

摘要:這篇文章使用正常對照(9例)和患者(12例)的外周血單核細胞,利用iTRAQ技術(shù)做兩組之間的差異蛋白比較分析。一共得到1232個蛋白,其中183個表達有差異。后續(xù)作者挑選CTSG, DFEA3,PTPRC和 PRDX1做Elisa驗證。與對照組相比,CTSG,DEFA3和PTPRC的表達量都有顯著升高,而PRDX1的表達量明顯下降。文章的這些發(fā)現(xiàn)可能為研究強直性脊柱炎的發(fā)病機制提供新的思路。

思路:iTRAQ+Elisa

 

第二篇,      類風濕性關(guān)節(jié)炎

雜志:PLOS One

時間:2016

IF: 3.057

摘要:本文使用用藥有反應(yīng)的類風濕性關(guān)節(jié)炎患者(R組4例)與用藥沒反應(yīng)的類風濕性關(guān)節(jié)炎患者(NR組4例)的血清樣本。通過iTRAQ實驗,共找到264個蛋白,其中有差異表達的只有9個。其中四個蛋白由于沒有商業(yè)化抗體沒有進行Elisa實驗,其余五個均用Elisa試劑盒進行了驗證。結(jié)果顯示HPX在R/NR之間有顯著的差異。血清中的蛋白可以作為用藥指導的Biomarker。

思路:iTRAQ+Elisa

 

第三篇,      持續(xù)性過敏性鼻炎

雜志:Clin Exp Allergy

時間:2016

IF: 5.587

摘要: 本文使用45例持續(xù)過敏性鼻炎患者的血清樣本作為實驗組,20例正常人的血清樣本作為對照。去除14種高峰度蛋白之后,作者使用iTRAQ技術(shù)尋找兩組之間的差異表達蛋白。一共找到133種。通過Metacore數(shù)據(jù)庫生信分析之后,轉(zhuǎn)錄因子ESR1,STAT1和STAT3被認為是非常關(guān)鍵的,其中STAT3可能與A2M的表達有關(guān)系。接著作者在血清中通過Elisa的方法驗證了A2M的表達量,同時在鼻粘膜樣本中,通過免疫組學得到A2M,ESR1,STAT1和STAT3的表達情況。通過一系列的實驗,作者找到10條與過敏性鼻炎相關(guān)的通路,其中BC通路是最顯著被調(diào)節(jié)的。通路中的A2M在患者中表達量很高。干預STAT3-A2M通路可作為今后過敏性鼻炎免疫反應(yīng)中功能研究的方向。

思路:iTRAQ+生信分析+ELISA驗證差異蛋白+免疫熒光/HE染色驗證

 

第四篇,      銀屑病

雜志:Immunity

時間:2013

IF: 24.082

摘要: 這篇文章樣本來自患者的皮損處及非皮損處表皮,各19例。通過iTRAQ分組比較后,得出1217個蛋白,其中有表達量差異的有214個。其中以S100A8-A9上調(diào)最為顯著,其次為C3。隨后作者通過構(gòu)建基因敲除鼠發(fā)現(xiàn),S100A9基因敲除后,小鼠的銀屑病程度減輕。同時,在體內(nèi)干擾C3的表達量也能減輕病樣表現(xiàn)。作者據(jù)此推測S100A9作為一個染色質(zhì)成分,可能通過結(jié)合C3起始位點的上游區(qū)域來調(diào)節(jié)C3的表達。因此,S100A8-A9有望成為銀屑病潛在的治療靶點。[

思路:iTRAQ+生信分析+小鼠iTraq+免疫組化+免疫熒光+WB驗證

 

上述可見,相對定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)以其新穎、性價比高、低門檻得到越來越多關(guān)注,來吉凱挑選適合您的蛋白質(zhì)組學方案吧!

 

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各類蛋白質(zhì)組學的應(yīng)用:

來源:上海吉凱基因醫(yī)學科技股份有限公司
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標簽: 蛋白組學
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