Millipore試劑盒推薦使用Q800R3設(shè)備剪切染色質(zhì)

染色質(zhì)通常被認(rèn)為是由DNA、組蛋白和非組蛋白組成的復(fù)合體。RNA染色質(zhì)復(fù)合體的成分被認(rèn)為是由mRNA或傳統(tǒng)的snRNA組成，它在轉(zhuǎn)錄過程中短暫地與染色質(zhì)相關(guān)聯(lián)。然而，越來越多的證據(jù)表明各種類型的非編碼RNA（例如：長鏈非編碼RNA，增強(qiáng)子RNA，甚至miRNA）與染色質(zhì)結(jié)合并可能通過序列特異性雜交和/或通過結(jié)構(gòu)和空間機(jī)制來實(shí)現(xiàn)調(diào)節(jié)功能。為了更好地描述這些調(diào)控機(jī)制，需要一種方法來識別和描述RNA分子（包括編碼和非編碼）、蛋白質(zhì)和DNA之間的相互作用。
 
Magna ChIRP^TM（點(diǎn)擊下載說明書）是由Millipore（默克-密理博）推出的用于研究和lncRNA（長鏈非編碼RNA）相互作用的染色質(zhì)DNA序列及蛋白的商品化試劑盒。這個(gè)試劑盒采用了獨(dú)特的方法，可以發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)關(guān)聯(lián)RNA（如lncRNA）與基因組DNA序列的結(jié)合位點(diǎn)，也可用于lncRNA調(diào)節(jié)復(fù)合體的蛋白質(zhì)組分進(jìn)行蛋白組學(xué)分析。
 
染色質(zhì)或染色質(zhì)RNA復(fù)合體的研究離不開超聲波剪切儀。Millipore（默克-密理博）在ChIRP^TM使用手冊里推薦用Qsonica的Q800R3染色質(zhì)/DNA剪切超聲波破碎儀來完成染色質(zhì)的修剪。
 

Kit說明書內(nèi)頁截圖：

 
Magna ChIRP^TM基本原理如下圖：