高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)展與展望

高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究最重要的一個(gè)工作是對(duì)大數(shù)據(jù)的分析和數(shù)據(jù)挖掘，在第二部分，該綜述詳細(xì)介紹了單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的后續(xù)數(shù)據(jù)分析過(guò)程和常用分析方法。另外，針對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的特點(diǎn)，本文還重點(diǎn)闡述了細(xì)胞軌跡推演，細(xì)胞互作預(yù)測(cè)和功能富集幾種常見(jiàn)且具有代表性的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)深入挖掘高級(jí)分析內(nèi)容。



在第三部分，綜述重點(diǎn)對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中的常見(jiàn)技術(shù)問(wèn)題：樣本類型選擇、多細(xì)胞率、捕獲效率、罕見(jiàn)亞群缺失問(wèn)題進(jìn)行了闡述，并根據(jù)最新的研究進(jìn)展，提出了可能的解決方案。從這里，我們也可以看到，雖然每種技術(shù)方法有各種不完美的地方，但是，現(xiàn)在對(duì)單細(xì)胞技術(shù)的廣泛關(guān)注，也使得這些存在的問(wèn)題在一步步解決。

在隨后一部分，本綜述對(duì)單細(xì)胞技術(shù)的未來(lái)發(fā)展進(jìn)行了展望。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序用于lncRNA、外泌體檢測(cè)，用于降低成本的多樣本標(biāo)簽技術(shù)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，三代測(cè)序用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組，單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)等進(jìn)行了展望。我們相信，在接下來(lái)的幾年中，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究會(huì)為科學(xué)研究帶來(lái)更多的成果和產(chǎn)出。

參考文獻(xiàn)：高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)展與展望. 生命科學(xué), 2020, 32(12): 1280-1287.